VAMP1

VAMP1
Ідентифікатори
Символи	VAMP1, SPAX1, SYB1, VAMP-1, vesicle associated membrane protein 1, CMS25
Зовнішні ІД	OMIM: 185880 MGI: 1313276 HomoloGene: 40678 GeneCards: VAMP1
Пов'язані генетичні захворювання
	spastic ataxia 1
Онтологія гена
Молекулярна функція	• SNAP receptor activity; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • syntaxin binding;
Клітинна компонента	• synaptic vesicle membrane; • синапс; • integral component of membrane; • мітохондрія; • tertiary granule membrane; • azurophil granule membrane; • міжклітинні контакти; • integral component of plasma membrane; • neuron projection; • мембрана; • cell surface; • specific granule membrane; • мітохондріальна зовнішня мембрана; • cytoplasmic vesicle membrane; • GO:0016023 cytoplasmic vesicle; • гіалоплазма; • SNARE complex; • integral component of synaptic vesicle membrane; • neuromuscular junction; • presynapse; • glutamatergic synapse;
Біологічний процес	• SNARE complex assembly; • vesicle fusion; • vesicle-mediated transport; • екзоцитоз; • synaptic vesicle priming; • regulation of synaptic vesicle fusion to presynaptic active zone membrane;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ; ; ;
	Більше даних
Ортологи
	6843
	22317
	ENSG00000139190
	ENSMUSG00000030337
	P23763
	Q62442
	NM_001297438; NM_014231; NM_016830; NM_199245
	NM_001080557; NM_009496
	NP_001284367; NP_055046; NP_058439; NP_954740
	NP_001074026; NP_033522
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

VAMP1 (англ. Vesicle associated membrane protein 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 118 амінокислот, а молекулярна маса — 12 902^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MSAPAQPPAE	GTEGTAPGGG	PPGPPPNMTS	NRRLQQTQAQ	VEEVVDIIRV
NVDKVLERDQ	KLSELDDRAD	ALQAGASQFE	SSAAKLKRKY	WWKNCKMMIM
LGAICAIIVV	VIVIYFFT

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Локалізований у мембрані, мітохондрії, клітинних контактах, цитоплазматичних везикулах, зовнішній мембрані мітохондрій, синапсах, синаптосомах^[en].

Література

Isenmann S., Khew-Goodall Y., Gamble J., Vadas M., Wattenberg B.W. (1998). A splice-isoform of vesicle-associated membrane protein-1 (VAMP-1) contains a mitochondrial targeting signal. Mol. Biol. Cell. 9: 1649—1660. PMID 9658161 DOI:10.1091/mbc.9.7.1649
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Archer B.T. III, Oezcelik T., Jahn R., Francke U., Suedhof T.C. (1990). Structures and chromosomal localizations of two human genes encoding synaptobrevins 1 and 2. J. Biol. Chem. 265: 17267—17273. PMID 1976629

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з VAMP1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:12642 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, P23763 (англ.) . Архів оригіналу за 29 вересня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 12

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

[1] Захворювання, генетично пов'язані з VAMP1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[2] Human PubMed Reference:.

[3] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-4] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:12642 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)

[UniProt-5] UniProt, P23763 (англ.) . Архів оригіналу за 29 вересня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]