VAMP8

VAMP8
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 4WY4
Ідентифікатори
Символи	VAMP8, EDB, VAMP-8, vesicle associated membrane protein 8
Зовнішні ІД	OMIM: 603177 MGI: 1336882 HomoloGene: 37846 GeneCards: VAMP8
Онтологія гена Молекулярна функція • SNAP receptor activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • chloride channel inhibitor activity • SNARE binding Клітинна компонента • цитоплазма • integral component of membrane • recycling endosome • везикула • гіалоплазма • ендосома • early endosome membrane • мембрана • secretory granule membrane • late endosome membrane • клітинна мембрана • mucin granule • lysosomal membrane • SNARE complex • early endosome • perinuclear region of cytoplasm • лізосома • екзосома • clathrin-coated vesicle membrane • phagocytic vesicle membrane • azurophil granule membrane • specific granule membrane • recycling endosome membrane • tertiary granule membrane • Синаптичні бульбашки Біологічний процес • post-Golgi vesicle-mediated transport • автофагія • GO:0000046 autophagosome maturation • negative regulation of secretion by cell • protein transport • viral entry into host cell • vesicle fusion • eosinophil degranulation • vesicle-mediated transport • mucus secretion • regulation of protein localization to plasma membrane • positive regulation of histamine secretion by mast cell • antigen processing and presentation of exogenous peptide antigen via MHC class I, TAP-dependent • autophagosome membrane docking • neutrophil degranulation • membrane organization • regulation of molecular function • GO:0015915 транспорт Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	8673	22320
Ensembl	ENSG00000118640	ENSMUSG00000050732
UniProt	Q9BV40	O70404
RefSeq (мРНК)	NM_003761	NM_016794
RefSeq (білок)	NP_003752	NP_058074
Локус (UCSC)	Хр. 2: 85.56 – 85.58 Mb	Хр. 6: 72.36 – 72.37 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

VAMP8 (англ. Vesicle associated membrane protein 8) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 100 амінокислот, а молекулярна маса — 11 438.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MEEASEGGGN		DRVRNLQSEV		EGVKNIMTQN		VERILARGEN		LEHLRNKTED
LEATSEHFKT		TSQKVARKFW		WKNVKMIVLI		CVIVFIIILF		IVLFATGAFS

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін

W: Триптофан

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як транспорт, транспорт білків, автофагія, ацетиляція. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, лізосомі, ендосомах.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Polgar J., Chung S.H., Reed G.L. (2002). Vesicle-associated membrane protein 3 (VAMP-3) and VAMP-8 are present in human platelets and are required for granule secretion. Blood. 100: 1081—1083. PMID 12130530 DOI:10.1182/blood.V100.3.1081
• Itakura E., Kishi-Itakura C., Mizushima N. (2012). The hairpin-type tail-anchored SNARE syntaxin 17 targets to autophagosomes for fusion with endosomes/lysosomes. Cell. 151: 1256—1269. PMID 23217709 DOI:10.1016/j.cell.2012.11.001

Див. також

• Хромосома 2