VCAN

VCAN
Ідентифікатори
Символи	VCAN, CSPG2, ERVR, GHAP, PG-M, WGN, WGN1, versican
Зовнішні ІД	OMIM: 118661 MGI: 102889 HomoloGene: 3228 GeneCards: VCAN
Пов'язані генетичні захворювання
Wagner's disease
Онтологія гена Молекулярна функція • calcium ion binding • glycosaminoglycan binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • carbohydrate binding • extracellular matrix structural constituent • hyaluronic acid binding • extracellular matrix structural constituent conferring compression resistance Клітинна компонента • мембрана • GO:0005578 Позаклітинна матриця • lysosomal lumen • Golgi lumen • міжклітинний простір • endoplasmic reticulum lumen • extracellular region • collagen-containing extracellular matrix • внутрішньоклітинна мембранна органела Біологічний процес • glycosaminoglycan metabolic process • skeletal system development • cell recognition • chondroitin sulfate biosynthetic process • extracellular matrix organization • multicellular organism development • central nervous system development • адгезія клітин • osteoblast differentiation • chondroitin sulfate catabolic process • dermatan sulfate biosynthetic process • glial cell migration • посттрансляційна модифікація Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	1462	13003
Ensembl	ENSG00000038427	ENSMUSG00000021614
UniProt	P13611 Q86W61	Q62059
RefSeq (мРНК)	NM_004385 NM_001126336 NM_001164097 NM_001164098	NM_001081249 NM_001134474 NM_001134475 NM_019389 NM_172955
RefSeq (білок)	NP_001119808 NP_001157569 NP_001157570 NP_004376 NP_001119808.1	н/д
Локус (UCSC)	Хр. 5: 83.47 – 83.58 Mb	Хр. 13: 89.8 – 89.89 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

VCAN (англ. Versican) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 3 396 амінокислот, а молекулярна маса — 372 820.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MFINIKSILW		MCSTLIVTHA		LHKVKVGKSP		PVRGSLSGKV		SLPCHFSTMP
TLPPSYNTSE		FLRIKWSKIE		VDKNGKDLKE		TTVLVAQNGN		IKIGQDYKGR
VSVPTHPEAV		GDASLTVVKL		LASDAGLYRC		DVMYGIEDTQ		DTVSLTVDGV
VFHYRAATSR		YTLNFEAAQK		ACLDVGAVIA		TPEQLFAAYE		DGFEQCDAGW
LADQTVRYPI		RAPRVGCYGD		KMGKAGVRTY		GFRSPQETYD		VYCYVDHLDG
DVFHLTVPSK		FTFEEAAKEC		ENQDARLATV		GELQAAWRNG		FDQCDYGWLS
DASVRHPVTV		ARAQCGGGLL		GVRTLYRFEN		QTGFPPPDSR		FDAYCFKPKE
ATTIDLSILA		ETASPSLSKE		PQMVSDRTTP		IIPLVDELPV		IPTEFPPVGN
IVSFEQKATV		QPQAITDSLA		TKLPTPTGST		KKPWDMDDYS		PSASGPLGKL
DISEIKEEVL		QSTTGVSHYA		TDSWDGVVED		KQTQESVTQI		EQIEVGPLVT
SMEILKHIPS		KEFPVTETPL		VTARMILESK		TEKKMVSTVS		ELVTTGHYGF
TLGEEDDEDR		TLTVGSDEST		LIFDQIPEVI		TVSKTSEDTI		HTHLEDLESV
SASTTVSPLI		MPDNNGSSMD		DWEERQTSGR		ITEEFLGKYL		STTPFPSQHR
TEIELFPYSG		DKILVEGIST		VIYPSLQTEM		THRRERTETL		IPEMRTDTYT
DEIQEEITKS		PFMGKTEEEV		FSGMKLSTSL		SEPIHVTESS		VEMTKSFDFP
TLITKLSAEP		TEVRDMEEDF		TATPGTTKYD		ENITTVLLAH		GTLSVEAATV
SKWSWDEDNT		TSKPLESTEP		SASSKLPPAL		LTTVGMNGKD		KDIPSFTEDG
ADEFTLIPDS		TQKQLEEVTD		EDIAAHGKFT		IRFQPTTSTG		IAEKSTLRDS
TTEEKVPPIT		STEGQVYATM		EGSALGEVED		VDLSKPVSTV		PQFAHTSEVE
GLAFVSYSST		QEPTTYVDSS		HTIPLSVIPK		TDWGVLVPSV		PSEDEVLGEP
SQDILVIDQT		RLEATISPET		MRTTKITEGT		TQEEFPWKEQ		TAEKPVPALS
STAWTPKEAV		TPLDEQEGDG		SAYTVSEDEL		LTGSERVPVL		ETTPVGKIDH
SVSYPPGAVT		EHKVKTDEVV		TLTPRIGPKV		SLSPGPEQKY		ETEGSSTTGF
TSSLSPFSTH		ITQLMEETTT		EKTSLEDIDL		GSGLFEKPKA		TELIEFSTIK
VTVPSDITTA		FSSVDRLHTT		SAFKPSSAIT		KKPPLIDREP		GEETTSDMVI
IGESTSHVPP		TTLEDIVAKE		TETDIDREYF		TTSSPPATQP		TRPPTVEDKE
AFGPQALSTP		QPPASTKFHP		DINVYIIEVR		ENKTGRMSDL		SVIGHPIDSE
SKEDEPCSEE		TDPVHDLMAE		ILPEFPDIIE		IDLYHSEENE		EEEEECANAT
DVTTTPSVQY		INGKHLVTTV		PKDPEAAEAR		RGQFESVAPS		QNFSDSSESD
THPFVIAKTE		LSTAVQPNES		TETTESLEVT		WKPETYPETS		EHFSGGEPDV
FPTVPFHEEF		ESGTAKKGAE		SVTERDTEVG		HQAHEHTEPV		SLFPEESSGE
IAIDQESQKI		AFARATEVTF		GEEVEKSTSV		TYTPTIVPSS		ASAYVSEEEA
VTLIGNPWPD		DLLSTKESWV		EATPRQVVEL		SGSSSIPITE		GSGEAEEDED
TMFTMVTDLS		QRNTTDTLIT		LDTSRIITES		FFEVPATTIY		PVSEQPSAKV
VPTKFVSETD		TSEWISSTTV		EEKKRKEEEG		TTGTASTFEV		YSSTQRSDQL
ILPFELESPN		VATSSDSGTR		KSFMSLTTPT		QSEREMTDST		PVFTETNTLE
NLGAQTTEHS		SIHQPGVQEG		LTTLPRSPAS		VFMEQGSGEA		AADPETTTVS
SFSLNVEYAI		QAEKEVAGTL		SPHVETTFST		EPTGLVLSTV		MDRVVAENIT
QTSREIVISE		RLGEPNYGAE		IRGFSTGFPL		EEDFSGDFRE		YSTVSHPIAK
EETVMMEGSG		DAAFRDTQTS		PSTVPTSVHI		SHISDSEGPS		STMVSTSAFP
WEEFTSSAEG		SGEQLVTVSS		SVVPVLPSAV		QKFSGTASSI		IDEGLGEVGT
VNEIDRRSTI		LPTAEVEGTK		APVEKEEVKV		SGTVSTNFPQ		TIEPAKLWSR
QEVNPVRQEI		ESETTSEEQI		QEEKSFESPQ		NSPATEQTIF		DSQTFTETEL
KTTDYSVLTT		KKTYSDDKEM		KEEDTSLVNM		STPDPDANGL		ESYTTLPEAT
EKSHFFLATA		LVTESIPAEH		VVTDSPIKKE		ESTKHFPKGM		RPTIQESDTE
LLFSGLGSGE		EVLPTLPTES		VNFTEVEQIN		NTLYPHTSQV		ESTSSDKIED
FNRMENVAKE		VGPLVSQTDI		FEGSGSVTST		TLIEILSDTG		AEGPTVAPLP
FSTDIGHPQN		QTVRWAEEIQ		TSRPQTITEQ		DSNKNSSTAE		INETTTSSTD
FLARAYGFEM		AKEFVTSAPK		PSDLYYEPSG		EGSGEVDIVD		SFHTSATTQA
TRQESSTTFV		SDGSLEKHPE		VPSAKAVTAD		GFPTVSVMLP		LHSEQNKSSP
DPTSTLSNTV		SYERSTDGSF		QDRFREFEDS		TLKPNRKKPT		ENIIIDLDKE
DKDLILTITE		STILEILPEL		TSDKNTIIDI		DHTKPVYEDI		LGMQTDIDTE
VPSEPHDSND		ESNDDSTQVQ		EIYEAAVNLS		LTEETFEGSA		DVLASYTQAT
HDESMTYEDR		SQLDHMGFHF		TTGIPAPSTE		TELDVLLPTA		TSLPIPRKSA
TVIPEIEGIK		AEAKALDDMF		ESSTLSDGQA		IADQSEIIPT		LGQFERTQEE
YEDKKHAGPS		FQPEFSSGAE		EALVDHTPYL		SIATTHLMDQ		SVTEVPDVME
GSNPPYYTDT		TLAVSTFAKL		SSQTPSSPLT		IYSGSEASGH		TEIPQPSALP
GIDVGSSVMS		PQDSFKEIHV		NIEATFKPSS		EEYLHITEPP		SLSPDTKLEP
SEDDGKPELL		EEMEASPTEL		IAVEGTEILQ		DFQNKTDGQV		SGEAIKMFPT
IKTPEAGTVI		TTADEIELEG		ATQWPHSTSA		SATYGVEAGV		VPWLSPQTSE
RPTLSSSPEI		NPETQAALIR		GQDSTIAASE		QQVAARILDS		NDQATVNPVE
FNTEVATPPF		SLLETSNETD		FLIGINEESV		EGTAIYLPGP		DRCKMNPCLN
GGTCYPTETS		YVCTCVPGYS		GDQCELDFDE		CHSNPCRNGA		TCVDGFNTFR
CLCLPSYVGA		LCEQDTETCD		YGWHKFQGQC		YKYFAHRRTW		DAAERECRLQ
GAHLTSILSH		EEQMFVNRVG		HDYQWIGLND		KMFEHDFRWT		DGSTLQYENW
RPNQPDSFFS		AGEDCVVIIW		HENGQWNDVP		CNYHLTYTCK		KGTVACGQPP
VVENAKTFGK		MKPRYEINSL		IRYHCKDGFI		QRHLPTIRCL		GNGRWAIPKI
TCMNPSAYQR		TYSMKYFKNS		SSAKDNSINT		SKHDHRWSRR		WQESRR

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іоном кальцію, лектинами. Локалізований у позаклітинному матриксі. Також секретований назовні.

Література

• Zako M., Shinomura T., Ujita M., Ito K., Kimata K. (1995). Expression of PG-M(V3), an alternatively spliced form of PG-M without a chondroitin sulfate attachment in region in mouse and human tissues. J. Biol. Chem. 270: 3914—3918. PMID 7876137 doi:10.1074/jbc.270.8.3914
• Yao L.Y., Moody C., Schoenherr E., Wight T.N., Sandell L.J. (1994). Identification of the proteoglycan versican in aorta and smooth muscle cells by DNA sequence analysis, in situ hybridization and immunohistochemistry. Matrix Biol. 14: 213—225. PMID 7921538 doi:10.1016/0945-053X(94)90185-6
• Iozzo R.V., Naso M.F., Cannizzaro L.A., Wasmuth J.J., McPherson J.D. (1992). Mapping of the versican proteoglycan gene (CSPG2) to the long arm of human chromosome 5 (5q12-5q14). Genomics. 14: 845—851. PMID 1478664 doi:10.1016/S0888-7543(05)80103-X
• Bignami A., Lane W.S., Andrews D., Dahl D. (1989). Structural similarity of hyaluronate binding proteins in brain and cartilage. Brain Res. Bull. 22: 67—70. PMID 2469524 doi:10.1016/0361-9230(89)90129-9
• Zimmermann D.R., Ruoslahti E. (1989). Multiple domains of the large fibroblast proteoglycan, versican. EMBO J. 8: 2975—2981. PMID 2583089
• Dours-Zimmermann M.T., Zimmermann D.R. (1994). A novel glycosaminoglycan attachment domain identified in two alternative splice variants of human versican. J. Biol. Chem. 269: 32992—32998. PMID 7806529

Див. також

• Хромосома 5