VRK2

VRK2
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	2V62
Ідентифікатори
Символи	VRK2, vaccinia related kinase 2, VRK serine/threonine kinase 2
Зовнішні ІД	OMIM: 602169 MGI: 1917172 HomoloGene: 55966 GeneCards: VRK2
шифр КФ	2.7.11.1
Пов'язані генетичні захворювання
	шизофренія
Онтологія гена
Молекулярна функція	• transferase activity; • nucleotide binding; • protein kinase activity; • protein domain specific binding; • kinase activity; • protein serine/threonine kinase activity; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • ATP binding; • protein kinase binding;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • integral component of membrane; • endoplasmic reticulum membrane; • мітохондріальна мембрана; • мембрана; • ендоплазматичний ретикулум; • мітохондрія; • клітинне ядро; • GO:0009327 protein-containing complex;
Біологічний процес	• regulation of MAPK cascade; • regulation of interleukin-1-mediated signaling pathway; • фосфорилювання; • protein phosphorylation; • GO:0035404 peptidyl-serine phosphorylation; • protein autophosphorylation; • cellular response to oxidative stress; • GO:0022415 viral process; • regulation of cell shape; • peptidyl-threonine phosphorylation;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	7444
	69922
	ENSG00000028116
	ENSMUSG00000064090
	Q86Y07
	Q8BN21
NM_001130480; NM_001130481; NM_001130482; NM_001130483; NM_001288836;
	NM_001288837; NM_001288838; NM_001288839; NM_006296
	NM_001252447; NM_027260
NP_001123952; NP_001123953; NP_001123954; NP_001123955; NP_001275765;
	NP_001275766; NP_001275767; NP_001275768; NP_006287
	NP_001239376; NP_081536
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

VRK2 (англ. Vaccinia related kinase 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 508 амінокислот, а молекулярна маса — 58 141^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MPPKRNEKYK	LPIPFPEGKV	LDDMEGNQWV	LGKKIGSGGF	GLIYLAFPTN
KPEKDARHVV	KVEYQENGPL	FSELKFYQRV	AKKDCIKKWI	ERKQLDYLGI
PLFYGSGLTE	FKGRSYRFMV	MERLGIDLQK	ISGQNGTFKK	STVLQLGIRM
LDVLEYIHEN	EYVHGDIKAA	NLLLGYKNPD	QVYLADYGLS	YRYCPNGNHK
QYQENPRKGH	NGTIEFTSLD	AHKGVALSRR	SDVEILGYCM	LRWLCGKLPW
EQNLKDPVAV	QTAKTNLLDE	LPQSVLKWAP	SGSSCCEIAQ	FLVCAHSLAY
DEKPNYQALK	KILNPHGIPL	GPLDFSTKGQ	SINVHTPNSQ	KVDSQKAATK
QVNKAHNRLI	EKKVHSERSA	ESCATWKVQK	EEKLIGLMNN	EAAQESTRRR
QKYQESQEPL	NEVNSFPQKI	SYTQFPNSFY	EPHQDFTSPD	IFKKSRSPSW
YKYTSTVSTG	ITDLESSTGL	WPTISQFTLS	EETNADVYYY	RIIIPVLLML
VFLALFFL

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, кіназ, серин/треонінових протеїнкіназ, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як взаємодія хазяїн-вірус, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами. Локалізований у цитоплазмі, ядрі, мембрані, мітохондрії, ендоплазматичному ретикулумі.

Література

Nezu J., Oku A., Jones M.H., Shimane M. (1997). Identification of two novel human putative serine/threonine kinases, VRK1 and VRK2, with structural similarity to Vaccinia virus B1R kinase. Genomics. 45: 327—331. PMID 9344656 DOI:10.1006/geno.1997.4938
Blanco S., Klimcakova L., Vega F.M., Lazo P.A. (2006). The subcellular localization of vaccinia-related kinase-2 (VRK2) isoforms determines their different effect on p53 stability in tumour cell lines. FEBS J. 273: 2487—2504. PMID 16704422 DOI:10.1111/j.1742-4658.2006.05256.x
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Nichols R.J., Traktman P. (2004). Characterization of three paralogous members of the Mammalian vaccinia related kinase family. J. Biol. Chem. 279: 7934—7946. PMID 14645249 DOI:10.1074/jbc.M310813200
Li L.Y., Liu M.Y., Shih H.M., Tsai C.H., Chen J.Y. (2006). Human cellular protein VRK2 interacts specifically with Epstein-Barr virus BHRF1, a homologue of Bcl-2, and enhances cell survival. J. Gen. Virol. 87: 2869—2878. PMID 16963744 DOI:10.1099/vir.0.81953-0
Nichols R.J., Wiebe M.S., Traktman P. (2006). The vaccinia-related kinases phosphorylate the N' terminus of BAF, regulating its interaction with DNA and its retention in the nucleus. Mol. Biol. Cell. 17: 2451—2464. PMID 16495336 DOI:10.1091/mbc.E05-12-1179