VTI1B

VTI1B
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2V8S
Ідентифікатори
Символи	VTI1B, VTI1, VTI1-LIKE, VTI1L, VTI2, v-SNARE, vti1-rp1, vesicle transport through interaction with t-SNAREs 1B
Зовнішні ІД	OMIM: 603207 MGI: 1855688 HomoloGene: 38178 GeneCards: VTI1B
Онтологія гена Молекулярна функція • SNAP receptor activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • chloride channel inhibitor activity • SNARE binding Клітинна компонента • integral component of membrane • recycling endosome • везикула • ендосома • комплекс Ґольджі • внутрішньоклітинна мембранна органела • late endosome membrane • Синаптичні бульбашки • мембрана • lysosomal membrane • neuronal cell body • perinuclear region of cytoplasm • лізосома • ER to Golgi transport vesicle membrane • SNARE complex • endoplasmic reticulum membrane • extracellular region • гіалоплазма • platelet alpha granule lumen • early endosome membrane • recycling endosome membrane Біологічний процес • membrane fusion • vesicle docking involved in exocytosis • GO:0000046 autophagosome maturation • protein transport • проліферація • intracellular protein transport • vesicle-mediated transport • regulation of protein localization to plasma membrane • Golgi to vacuole transport • vesicle fusion with Golgi apparatus • endoplasmic reticulum to Golgi vesicle-mediated transport • intra-Golgi vesicle-mediated transport • protein targeting to vacuole • retrograde transport, endosome to Golgi • platelet degranulation Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	10490	53612
Ensembl	ENSG00000100568	ENSMUSG00000021124
UniProt	Q9UEU0	O88384
RefSeq (мРНК)	NM_006370	NM_016800 NM_001364374
RefSeq (білок)	NP_006361	н/д
Локус (UCSC)	Хр. 14: 67.65 – 67.67 Mb	Хр. 12: 79.2 – 79.22 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

VTI1B (англ. Vesicle transport through interaction with t-SNAREs 1B) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 14-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 232 амінокислот, а молекулярна маса — 26 688.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MASSAASSEH		FEKLHEIFRG		LHEDLQGVPE		RLLGTAGTEE		KKKLIRDFDE
KQQEANETLA		EMEEELRYAP		LSFRNPMMSK		LRNYRKDLAK		LHREVRSTPL
TATPGGRGDM		KYGIYAVENE		HMNRLQSQRA		MLLQGTESLN		RATQSIERSH
RIATETDQIG		SEIIEELGEQ		RDQLERTKSR		LVNTSENLSK		SRKILRSMSR
KVTTNKLLLS		IIILLELAIL		GGLVYYKFFR		SH

A: Аланін
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт, транспорт білків, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Локалізований у мембрані, лізосомі, ендосомах.

Література

• Fischer von Mollard G., Stevens T.H. (1998). A human homolog can functionally replace the yeast vesicle-associated SNARE Vti1p in two vesicle transport pathways. J. Biol. Chem. 273: 2624—2630. PMID 9446565 DOI:10.1074/jbc.273.5.2624
• Li H.-C., Tahara H., Tsuyama N., Ide T. (1998). A hVti1 homologue: its expression depends on population doubling levels in both normal and SV40-transformed human fibroblasts. Biochem. Biophys. Res. Commun. 247: 70—74. PMID 9636656 DOI:10.1006/bbrc.1998.8737
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Itakura E., Kishi-Itakura C., Mizushima N. (2012). The hairpin-type tail-anchored SNARE syntaxin 17 targets to autophagosomes for fusion with endosomes/lysosomes. Cell. 151: 1256—1269. PMID 23217709 DOI:10.1016/j.cell.2012.11.001
• Miller S.E., Collins B.M., McCoy A.J., Robinson M.S., Owen D.J. (2007). A SNARE-adaptor interaction is a new mode of cargo recognition in clathrin-coated vesicles. Nature. 450: 570—574. PMID 18033301 DOI:10.1038/nature06353

Див. також

• Хромосома 14