ZFP42

ZFP42
Ідентифікатори
Символи	ZFP42, REX1, ZNF754, REX-1, zfp-42, Rex1, ZFP42 zinc finger protein
Зовнішні ІД	OMIM: 614572 MGI: 99187 HomoloGene: 7601 GeneCards: ZFP42
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • DNA binding • зв'язування з іоном металу • nucleic acid binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific • sequence-specific DNA binding Клітинна компонента • цитоплазма • клітинне ядро • transcription regulator complex • PcG protein complex Біологічний процес • male gonad development • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated • female gonad development • GO:0007126 мейоз • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	132625	22702
Ensembl	ENSG00000179059	ENSMUSG00000051176
UniProt	Q96MM3	P22227
RefSeq (мРНК)	NM_001304358 NM_174900	NM_009556
RefSeq (білок)	NP_001291287 NP_777560	NP_033582
Локус (UCSC)	Хр. 4: 188 – 188.01 Mb	Хр. 8: 43.75 – 43.76 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

ZFP42 (англ. ZFP42 zinc finger protein) — білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 4-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 310 амінокислот, а молекулярна маса — 34 802.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSQQLKKRAK		TRHQKGLGGR		APSGAKPRQG		KSSQDLQAEI		EPVSAVWALC
DGYVCYEPGP		QALGGDDFSD		CYIECVIRGE		FSQPILEEDS		LFESLEYLKK
GSEQQLSQKV		FEASSLECSL		EYMKKGVKKE		LPQKIVGENS		LEYSEYMTGK
KLPPGGIPGI		DLSDPKQLAE		FARKKPPINK		EYDSLSAIAC		PQSGCTRKLR
NRAALRKHLL		IHGPRDHVCA		ECGKAFVESS		KLKRHFLVHT		GEKPFRCTFE
GCGKRFSLDF		NLRTHVRIHT		GEKRFVCPFQ		GCNRRFIQSN		NLKAHILTHA
NTNKNEQEGK

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до активаторів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

• Mongan N.P., Martin K.M., Gudas L.J. (2006). The putative human stem cell marker, Rex-1 (Zfp42): structural classification and expression in normal human epithelial and carcinoma cell cultures. Mol. Carcinog. 45: 887—900. PMID 16865673 doi:10.1002/mc.20186

Див. також

• Хромосома 4