Горизонтальний триколор чорного, червоного та зеленого кольорів, розділених білими смугами із синім трикутником, у якому розташована п'ятипроменева золота зірка.
Прапор має прямокутне полотнище зі співвідношенням ширини до довжини 1:2, яке складається з чорної, червоної та зеленої горизонтальних смуг, розділених тонкими білими смужками, а від древка відходить синій клин із золотою п'ятипроменевою зіркою. Прапор Південного Судану має в собі елементи прапорів Кенії (кольори) та Судану (форма). Крім того, він містить золоту зірку в трикутнику. Кольори прапора означають: чорний – колір народів Південного Судану, червоний – кров народу, пролита за незалежність, зелений – земля, білий – мир, синій – води Нілу. Золота зірка уособлює Вифлеємську зірку і символізує єдність держави[2][3].