Циклін-залежна кіназа 9

Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.
Перейти до навігації Перейти до пошуку
CDK9
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Ідентифікатори
Символи CDK9, C-2k, CDC2L4, CTK1, PITALRE, TAK, cyclin-dependent kinase 9, cyclin dependent kinase 9
Зовнішні ІД OMIM: 603251 MGI: 1328368 HomoloGene: 55566 GeneCards: CDK9
Реагує на сполуку
dinaciclib, seliciclib[1]
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
NM_001261
NM_130860
RefSeq (білок)
NP_001252
NP_001252.1
NP_570930
Локус (UCSC) Хр. 9: 127.79 – 127.79 Mb Хр. 2: 32.6 – 32.6 Mb
PubMed search [2] [3]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

CDK9 (англ. Cyclin dependent kinase 9) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 9-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 372 амінокислот, а молекулярна маса — 42 778[5].

Послідовність амінокислот
1020304050
MAKQYDSVECPFCDEVSKYEKLAKIGQGTFGEVFKARHRKTGQKVALKKV
LMENEKEGFPITALREIKILQLLKHENVVNLIEICRTKASPYNRCKGSIY
LVFDFCEHDLAGLLSNVLVKFTLSEIKRVMQMLLNGLYYIHRNKILHRDM
KAANVLITRDGVLKLADFGLARAFSLAKNSQPNRYTNRVVTLWYRPPELL
LGERDYGPPIDLWGAGCIMAEMWTRSPIMQGNTEQHQLALISQLCGSITP
EVWPNVDNYELYEKLELVKGQKRKVKDRLKAYVRDPYALDLIDKLLVLDP
AQRIDSDDALNHDFFWSDPMPSDLKGMLSTHLTSMFEYLAPPRRKGSQIT
QQSTNQSRNPATTNQTEFERVF

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, кіназ, серин/треонінових протеїнкіназ, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, пошкодження ДНК, репарація ДНК, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

[ред. | ред. код]
  • Best J.L., Presky D.H., Swerlick R.A., Burns D.K., Chu W. (1995). Cloning of a full-length cDNA sequence encoding a cdc2-related protein kinase from human endothelial cells. Biochem. Biophys. Res. Commun. 208: 562—568. PMID 7695608 DOI:10.1006/bbrc.1995.1375
  • Liu H., Rice A.P. (2000). Genomic organization and characterization of promoter function of the human CDK9 gene. Gene. 252: 51—59. PMID 10903437 DOI:10.1016/S0378-1119(00)00215-8
  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Wei P., Garber M.E., Fang S.-M., Fischer W.H., Jones K.A. (1998). A novel CDK9-associated C-type cyclin interacts directly with HIV-1 Tat and mediates its high-affinity, loop-specific binding to TAR RNA. Cell. 92: 451—462. PMID 9491887 DOI:10.1016/S0092-8674(00)80939-3
  • Wada T., Takagi T., Yamaguchi Y., Watanabe D., Handa H. (1998). Evidence that P-TEFb alleviates the negative effect of DSIF on RNA polymerase II-dependent transcription in vitro. EMBO J. 17: 7395—7403. PMID 9857195 DOI:10.1093/emboj/17.24.7395
  • Peng J.-M., Zhu Y., Milton J.T., Price D.H. (1998). Identification of multiple cyclin subunits of human P-TEFb. Genes Dev. 12: 755—762. PMID 9499409 DOI:10.1101/gad.12.5.755

Примітки

[ред. | ред. код]

Див. також

[ред. | ред. код]