ABHD17B

ABHD17B
Ідентифікатори
Символи	ABHD17B, C9orf77, FAM108B1, CGI-67, abhydrolase domain containing 17B, abhydrolase domain containing 17B, depalmitoylase
Зовнішні ІД	OMIM: 617943 MGI: 1917816 HomoloGene: 41089 GeneCards: ABHD17B
Онтологія гена Молекулярна функція • hydrolase activity • palmitoyl-(protein) hydrolase activity Клітинна компонента • мембрана • extracellular region • клітинна мембрана • GO:0097483, GO:0097481 постсинаптичне ущільнення • recycling endosome membrane • ендосома • міжклітинні контакти • cell projection • dendritic spine • синапс • postsynaptic membrane • glutamatergic synapse • anchored component of postsynaptic density membrane • anchored component of postsynaptic recycling endosome membrane Біологічний процес • protein depalmitoylation • protein palmitoylation • regulation of protein localization to synapse • negative regulation of protein localization to microtubule • regulation of dendritic spine maintenance • positive regulation of protein localization to endosome • regulation of postsynapse organization Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	51104	226016
Ensembl	ENSG00000107362	ENSMUSG00000047368
UniProt	Q5VST6	Q7M759
RefSeq (мРНК)	NM_001025780 NM_016014	NM_146096
RefSeq (білок)	NP_001020951 NP_057098	NP_666208
Локус (UCSC)	Хр. 9: 71.86 – 71.91 Mb	Хр. 19: 21.63 – 21.66 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

ABHD17B (англ. Abhydrolase domain containing 17B) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 9-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 288 амінокислот, а молекулярна маса — 32 215.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MNNLSFSELC		CLFCCPPCPG		KIASKLAFLP		PDPTYTLMCD		ESGSRWTLHL
SERADWQYSS		REKDAIECFM		TRTSKGNRIA		CMFVRCSPNA		KYTLLFSHGN
AVDLGQMSSF		YIGLGSRINC		NIFSYDYSGY		GASSGKPTEK		NLYADIEAAW
LALRTRYGIR		PENVIIYGQS		IGTVPSVDLA		ARYESAAVIL		HSPLTSGMRV
AFPDTKKTYC		FDAFPNIDKI		SKITSPVLII		HGTEDEVIDF		SHGLALFERC
QRPVEPLWVE		GAGHNDVELY		GQYLERLKQF		VSQELVNL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Секретований назовні.

Література

• Lai C.-H., Chou C.-Y., Ch'ang L.-Y., Liu C.-S., Lin W.-C. (2000). Identification of novel human genes evolutionarily conserved in Caenorhabditis elegans by comparative proteomics. Genome Res. 10: 703—713. PMID 10810093 doi:10.1101/gr.10.5.703
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 9