AGTPBP1

AGTPBP1
Ідентифікатори
Символи	AGTPBP1, CCP1, NNA1, ATP/GTP binding protein 1, CONDCA, ATP/GTP binding carboxypeptidase 1
Зовнішні ІД	OMIM: 606830 MGI: 2159437 HomoloGene: 9067 GeneCards: AGTPBP1
Онтологія гена Молекулярна функція • carboxypeptidase activity • tubulin binding • zinc ion binding • GO:0070122 peptidase activity • metallopeptidase activity • hydrolase activity • зв'язування з іоном металу • metallocarboxypeptidase activity Клітинна компонента • цитоплазма • гіалоплазма • мітохондрія • клітинне ядро • ядерце • внутрішньоклітинна мембранна органела Біологічний процес • mitochondrion organization • olfactory bulb development • C-terminal protein deglutamylation • neuromuscular process • eye photoreceptor cell differentiation • protein side chain deglutamylation • протеоліз • cerebellar Purkinje cell differentiation Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	23287	67269
Ensembl	ENSG00000135049	ENSMUSG00000021557
UniProt	Q9UPW5	Q641K1
RefSeq (мРНК)	NM_001286715 NM_001286717 NM_015239 NM_001330701	NM_001048008 NM_001284218 NM_001284219 NM_001284221 NM_023328 NM_001377097
RefSeq (білок)	NP_001273644 NP_001273646 NP_001317630 NP_056054 NP_056054.2	NP_001041473 NP_001271147 NP_001271148 NP_001271150 NP_075817 NP_001364026
Локус (UCSC)	Хр. 9: 85.55 – 85.74 Mb	Хр. 13: 59.59 – 59.73 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

AGTPBP1 (англ. ATP/GTP binding protein 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 9-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 226 амінокислот, а молекулярна маса — 138 448.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSKLKVIPEK		SLTNNSRIVG		LLAQLEKINA		EPSESDTARY		VTSKILHLAQ
SQEKTRREMT		AKGSTGMEIL		LSTLENTKDL		QTTLNILSIL		VELVSAGGGR
RVSFLVTKGG		SQILLQLLMN		ASKESPPHED		LMVQIHSILA		KIGPKDKKFG
VKARINGALN		ITLNLVKQNL		QNHRLVLPCL		QLLRVYSANS		VNSVSLGKNG
VVELMFKIIG		PFSKKNSSLI		KVALDTLAAL		LKSKTNARRA		VDRGYVQVLL
TIYVDWHRHD		NRHRNMLIRK		GILQSLKSVT		NIKLGRKAFI		DANGMKILYN
TSQECLAVRT		LDPLVNTSSL		IMRKCFPKNR		LPLPTIKSSF		HFQLPVIPVT
GPVAQLYSLP		PEVDDVVDES		DDNDDIDVEA		ENETENEDDL		DQNFKNDDIE
TDINKLKPQQ		EPGRTIEDLK		MYEHLFPELV		DDFQDYDLIS		KEPKPFVFEG
KVRGPIVVPT		AGEETSGNSG		NLRKVVMKEN		ISSKGDEGEK		KSTFMDLAKE
DIKDNDRTLQ		QQPGDQNRTI		SSVHGLNNDI		VKALDRITLQ		NIPSQTAPGF
TAEMKKDCSL		PLTVLTCAKA		CPHMATCGNV		LFEGRTVQLG		KLCCTGVETE
DDEDTESNSS		VEQASVEVPD		GPTLHDPDLY		IEIVKNTKSV		PEYSEVAYPD
YFGHIPPPFK		EPILERPYGV		QRTKIAQDIE		RLIHQSDIID		RVVYDLDNPN
YTIPEEGDIL		KFNSKFESGN		LRKVIQIRKN		EYDLILNSDI		NSNHYHQWFY
FEVSGMRPGV		AYRFNIINCE		KSNSQFNYGM		QPLMYSVQEA		LNARPWWIRM
GTDICYYKNH		FSRSSVAAGG		QKGKSYYTIT		FTVNFPHKDD		VCYFAYHYPY
TYSTLQMHLQ		KLESAHNPQQ		IYFRKDVLCE		TLSGNSCPLV		TITAMPESNY
YEHICHFRNR		PYVFLSARVH		PGETNASWVM		KGTLEYLMSN		NPTAQSLRES
YIFKIVPMLN		PDGVINGNHR		CSLSGEDLNR		QWQSPSPDLH		PTIYHAKGLL
QYLAAVKRLP		LVYCDYHGHS		RKKNVFMYGC		SIKETVWHTN		DNATSCDVVE
DTGYRTLPKI		LSHIAPAFCM		SSCSFVVEKS		KESTARVVVW		REIGVQRSYT
MESTLCGCDQ		GKYKGLQIGT		RELEEMGAKF		CVGLLRLKRL		TSPLEYNLPS
SLLDFENDLI		ESSCKVTSPT		TYVLDEDEPR		FLEEVDYSAE		SNDELDIELA
ENVGDYEPSA		QEEVLSDSEL		SRTYLP

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеаз, металопротеаз, карбоксипептидаз, фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у цитоплазмі, ядрі, мітохондрії.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Rodriguez de la Vega Otazo M., Lorenzo J., Tort O., Aviles F.X., Bautista J.M. (2013). Functional segregation and emerging role of cilia-related cytosolic carboxypeptidases (CCPs). FASEB J. 27: 424—431. PMID 23085998 DOI:10.1096/fj.12-209080

Див. також

• Хромосома 9