ANKS6

ANKS6
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 4NL9
Ідентифікатори
Символи	ANKS6, ANKRD14, NPHP16, PKDR1, SAMD6, ankyrin repeat and sterile alpha motif domain containing 6
Зовнішні ІД	OMIM: 615370 MGI: 1922941 HomoloGene: 19545 GeneCards: ANKS6
Пов'язані генетичні захворювання
nephronophthisis 16
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	203286	75691
Ensembl	ENSG00000165138	ENSMUSG00000066191
UniProt	Q68DC2	Q6GQX6
RefSeq (мРНК)	NM_173551	NM_001024136 NM_001356426
RefSeq (білок)	NP_775822	NP_001019307 NP_001343355
Локус (UCSC)	Хр. 9: 98.73 – 98.8 Mb	Хр. 4: 47.02 – 47.06 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

ANKS6 (англ. Ankyrin repeat and sterile alpha motif domain containing 6) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 9-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 871 амінокислот, а молекулярна маса — 92 219.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MGEGGLPPAF		QLLLRACDQG		DTETARRLLE		PGAAEPAERG		AEPEAGAEPA
GAEVAGPGAA		AAGAVGAPVP		VDCSDEAGNT		ALQFAAAGGH		EPLVRFLLRR
GASVNSRNHY		GWSALMQAAR		FGHVSVAHLL		LDHGADVNAQ		NRLGASVLTV
ASRGGHLGVV		KLLLEAGAFV		DHHHPSGEQL		GLGGSRDEPL		DITALMAAIQ
HGHEAVVRLL		MEWGADPNHA		ARTVGWSPLM		LAALTGRLGV		AQQLVEKGAN
PDHLSVLEKT		AFEVALDCKH		RDLVDYLDPL		TTVRPKTDEE		KRRPDIFHAL
KMGNFQLVKE		IADEDPSHVN		LVNGDGATPL		MLAAVTGQLA		LVQLLVERHA
DVDKQDSVHG		WTALMQATYH		GNKEIVKYLL		NQGADVTLRA		KNGYTAFDLV
MLLNDPDTEL		VRLLASVCMQ		VNKDKGRPSH		QPPLPHSKVR		QPWSIPVLPD
DKGGLKSWWN		RMSNRFRKLK		LMQTLPRGLS		SNQPLPFSDE		PEPALDSTMR
AAPQDKTSRS		ALPDAAPVTK		DNGPGSTRGE		KEDTLLTTML		RNGAPLTRLP
SDKLKAVIPP		FLPPSSFELW		SSDRSRTRHN		GKADPMKTAL		PQRASRGHPV
GGGGTDTTPV		RPVKFPSLPR		SPASSANSGN		FNHSPHSSGG		SSGVGVSRHG
GELLNRSGGS		IDNVLSQIAA		QRKKAAGLLE		QKPSHRSSPV		GPAPGSSPSE
LPASPAGGSA		PVGKKLETSK		RPPSGTSTTS		KSTSPTLTPS		PSPKGHTAES
SVSSSSSHRQ		SKSSGGSSSG		TITDEDELTG		ILKKLSLEKY		QPIFEEQEVD
MEAFLTLTDG		DLKELGIKTD		GSRQQILAAI		SELNAGKGRE		RQILQETIHN
FHSSFESSAS		NTRAPGNSPC		A

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, клітинних відростках, війках.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Leettola C.N., Knight M.J., Cascio D., Hoffman S., Bowie J.U. (2014). Characterization of the SAM domain of the PKD-related protein ANKS6 and its interaction with ANKS3. BMC Struct. Biol. 14: 17—17. PMID 24998259 DOI:10.1186/1472-6807-14-17

Див. також

• Хромосома 9