BACE1

BACE1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1FKN, 1M4H, 1PY1, 1SGZ, 1TQF, 1UJJ, 1UJK, 1W50, 1W51, 1XN2, 1XN3, 1XS7, 1YM2, 1YM4, 2B8L, 2B8V, 2F3E, 2F3F, 2FDP, 2G94, 2HIZ, 2HM1, 2IQG, 2IRZ, 2IS0, 2NTR, 2OAH, 2OF0, 2OHK, 2OHL, 2OHM, 2OHN, 2OHP, 2OHQ, 2OHR, 2OHS, 2OHT, 2OHU, 2P4J, 2P83, 2P8H, 2PH6, 2PH8, 2Q11, 2Q15, 2QK5, 2QMD, 2QMF, 2QMG, 2QP8, 2QU2, 2QU3, 2QZK, 2QZL, 2VA5, 2VA6, 2VA7, 2VIE, 2VIJ, 2VIY, 2VIZ, 2VJ6, 2VJ7, 2VJ9, 2VKM, 2VNM, 2VNN, 2WEZ, 2WF0, 2WF1, 2WF2, 2WF3, 2WF4, 2WJO, 2XFI, 2XFJ, 2XFK, 2ZDZ, 2ZE1, 2ZHR, 2ZHS, 2ZHT, 2ZHU, 2ZHV, 2ZJH, 2ZJI, 2ZJJ, 2ZJK, 2ZJL, 2ZJM, 2ZJN, 3BRA, 3BUF, 3BUG, 3BUH, 3CIB, 3CIC, 3CID, 3CKP, 3CKR, 3DM6, 3DUY, 3DV1, 3DV5, 3EXO, 3FKT, 3H0B, 3HVG, 3HW1, 3I25, 3IGB, 3IN3, 3IN4, 3IND, 3INE, 3INF, 3INH, 3IVH, 3IVI, 3IXJ, 3IXK, 3KYR, 3L38, 3L3A, 3LHG, 3LNK, 3MSJ, 3MSK, 3MSL, 3N4L, 3NSH, 3OOZ, 3QI1, 3R1G, 3RSV, 3RTM, 3RVI, 3S2O, 3S7L, 3S7M, 3TPJ, 3TPL, 3TPP, 3TPR, 3UDH, 3UDJ, 3UDK, 3UDM, 3UDN, 3UDP, 3UDQ, 3UDR, 3UDY, 3UFL, 3UQP, 3UQR, 3UQU, 3UQW, 3UQX, 3VEU, 3VF3, 3VG1, 3VV6, 3VV7, 3ZMG, 3ZOV, 4ACU, 4ACX, 4AZY, 4B00, 4B05, 4B0Q, 4B1C, 4B1D, 4B1E, 4B70, 4B72, 4B77, 4B78, 4BEK, 4BFD, 4D83, 4D85, 4D88, 4D89, 4D8C, 4DH6, 4DI2, 4DJU, 4DJV, 4DJW, 4DJX, 4DJY, 4DPF, 4DPI, 4DUS, 4DV9, 4DVF, 4EWO, 4EXG, 4FCO, 4FGX, 4FM7, 4FM8, 4FRI, 4FRJ, 4FRK, 4FRS, 4FS4, 4FSE, 4FSL, 4GMI, 4H1E, 4H3F, 4H3G, 4H3I, 4H3J, 4HA5, 4HZT, 4I0E, 4I0F, 4I0G, 4I0H, 4I0J, 4I0Z, 4I10, 4I11, 4I12, 4I1C, 4J0T, 4J0V, 4J0Y, 4J0Z, 4J17, 4J1C, 4J1E, 4J1F, 4J1H, 4J1I, 4J1K, 4JOO, 4JP9, 4JPC, 4JPE, 4K8S, 4K9H, 4KE0, 4KE1, 3K5C, 3K5D, 3K5F, 3K5G, 3KMX, 3KMY, 3KN0, 3L58, 3L59, 3L5B, 3L5C, 3L5D, 3L5E, 3L5F, 3LPI, 3LPJ, 3LPK, 3OHF, 3OHH, 3PI5, 3QBH, 3R2F, 3RSX, 3RTH, 3RTN, 3RU1, 3SKF, 3SKG, 3U6A, 4GID, 4LXA, 4LXK, 4LXM, 3WB4, 3WB5, 4I0D, 4I0I, 4IVS, 4IVT, 4J0P, 4L7G, 4L7H, 4L7J, 4LC7, 4N00, 4PZW, 4PZX, 4R5N, 4R8Y, 4R91, 4R92, 4R93, 4R95, 4RCD, 4RCE, 4RCF, 4RRN, 4RRO, 4RRS, 4WY1, 4WY6, 4X2L, 4X7I, 4XKX, 4XXS, 4YBI, 4TRW, 4TRZ, 4ZSM, 4ZSP, 4ZSQ, 4ZSR, 4TRY, 4ZPF, 4ZPG, 5CLM, 5F01, 5EZZ, 5DQC, 5F00, 5EZX, 5HE7, 5HD0, 5HDX, 5HDV, 5HE5, 5HE4, 5HDU, 5HDZ, 5I3X, 5I3W, 5I3V, 5IE1, 5I3Y, 5ENK
Ідентифікатори
Символи	BACE1, ASP2, BACE, HSPC104, beta-secretase 1
Зовнішні ІД	OMIM: 604252 MGI: 1346542 HomoloGene: 8014 GeneCards: BACE1
шифр КФ	3.4.23.46
Онтологія гена Молекулярна функція • endopeptidase activity • amyloid-beta binding • beta-aspartyl-peptidase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • enzyme binding • hydrolase activity • GO:0070122 peptidase activity • aspartic-type endopeptidase activity Клітинна компонента • multivesicular body • late endosome • endoplasmic reticulum lumen • мембрана • клітинна мембрана • cell surface • аксон • ендоплазматичний ретикулум • Golgi-associated vesicle lumen • endosome membrane • cytoplasmic vesicle membrane • GO:0016023 cytoplasmic vesicle • integral component of plasma membrane • membrane raft • комплекс Ґольджі • integral component of membrane • ендосома • trans-Golgi network • лізосома • early endosome • Синаптичні бульбашки • дендрит (нейробіологія) • soma • recycling endosome • hippocampal mossy fiber to CA3 synapse • presynapse Біологічний процес • GO:0044257 protein catabolic process • протеоліз • amyloid-beta metabolic process • membrane protein ectodomain proteolysis • modulation of chemical synaptic transmission • response to radiation • response to lead ion • positive regulation of neuron apoptotic process • detection of mechanical stimulus involved in sensory perception of pain • prepulse inhibition • cellular response to copper ion • cellular response to manganese ion • cellular response to amyloid-beta • regulation of synaptic vesicle exocytosis Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	23621	23821
Ensembl	ENSG00000186318	ENSMUSG00000032086
UniProt	P56817	P56818
RefSeq (мРНК)	NM_138973 NM_001207048 NM_001207049 NM_012104 NM_138971 NM_138972	NM_001145947 NM_011792
RefSeq (білок)	NP_001193977 NP_001193978 NP_036236 NP_620427 NP_620428 NP_620429 NP_036236.1	NP_001139419 NP_035922
Локус (UCSC)	Хр. 11: 117.29 – 117.32 Mb	Хр. 9: 45.75 – 45.78 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

BACE1 (англ. Beta-secretase 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 501 амінокислот, а молекулярна маса — 55 764.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAQALPWLLL		WMGAGVLPAH		GTQHGIRLPL		RSGLGGAPLG		LRLPRETDEE
PEEPGRRGSF		VEMVDNLRGK		SGQGYYVEMT		VGSPPQTLNI		LVDTGSSNFA
VGAAPHPFLH		RYYQRQLSST		YRDLRKGVYV		PYTQGKWEGE		LGTDLVSIPH
GPNVTVRANI		AAITESDKFF		INGSNWEGIL		GLAYAEIARP		DDSLEPFFDS
LVKQTHVPNL		FSLQLCGAGF		PLNQSEVLAS		VGGSMIIGGI		DHSLYTGSLW
YTPIRREWYY		EVIIVRVEIN		GQDLKMDCKE		YNYDKSIVDS		GTTNLRLPKK
VFEAAVKSIK		AASSTEKFPD		GFWLGEQLVC		WQAGTTPWNI		FPVISLYLMG
EVTNQSFRIT		ILPQQYLRPV		EDVATSQDDC		YKFAISQSST		GTVMGAVIME
GFYVVFDRAR		KRIGFAVSAC		HVHDEFRTAA		VEGPFVTLDM		EDCGYNIPQT
DESTLMTIAY		VMAAICALFM		LPLCLMVCQW		RCLRCLRQQH		DDFADDISLL
K

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеаз, аспартилових протеаз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Локалізований у мембрані, ендоплазматичному ретикулумі, цитоплазматичних везикулах, апараті гольджі, ендосомах.

Література

• Tanahashi H., Tabira T. (2001). Three novel alternatively spliced isoforms of the human beta-site amyloid precursor protein cleaving enzyme (BACE) and their effect on amyloid beta-peptide production. Neurosci. Lett. 307: 9—12. PMID 11516562 doi:10.1016/S0304-3940(01)01912-7
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
• Yan R., Han P., Miao H., Greengard P., Xu H. (2001). The transmembrane domain of the Alzheimer's beta-secretase (BACE1) determines its late Golgi localization and access to beta -amyloid precursor protein (APP) substrate. J. Biol. Chem. 276: 36788—36796. PMID 11466313 doi:10.1074/jbc.M104350200
• Fischer F., Molinari M., Bodendorf U., Paganetti P. (2002). The disulphide bonds in the catalytic domain of BACE are critical but not essential for amyloid precursor protein processing activity. J. Neurochem. 80: 1079—1088. PMID 11953458 doi:10.1046/j.0022-3042.2002.00806.x
• Costantini C., Ko M.H., Jonas M.C., Puglielli L. (2007). A reversible form of lysine acetylation in the ER and Golgi lumen controls the molecular stabilization of BACE1. Biochem. J. 407: 383—395. PMID 17425515 doi:10.1042/BJ20070040
• Jonas M.C., Costantini C., Puglielli L. (2008). PCSK9 is required for the disposal of non-acetylated intermediates of the nascent membrane protein BACE1. EMBO Rep. 9: 916—922. PMID 18660751 doi:10.1038/embor.2008.132

Див. також

• Хромосома 11