BANF1

BANF1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1QCK, 2ODG, 1CI4, 2BZF, 2EZY, 2EZZ, 2EZX
Ідентифікатори
Символи	BANF1, BAF, BCRP1, D14S1460, NGPS, Barrier to autointegration factor 1, BAF nuclear assembly factor 1
Зовнішні ІД	OMIM: 603811 MGI: 1346330 HomoloGene: 2866 GeneCards: BANF1
Пов'язані генетичні захворювання
Nestor-Guillermo progeria syndrome
Онтологія гена Молекулярна функція • DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • protein C-terminus binding • enzyme binding • protein homodimerization activity • protein N-terminus binding • LEM domain binding • identical protein binding Клітинна компонента • цитоплазма • екзосома • condensed chromosome • клітинне ядро • хромосома • нуклеоплазма • гіалоплазма • nuclear envelope Біологічний процес • mitotic nuclear membrane reassembly • response to virus • mitotic nuclear membrane disassembly • DNA integration • establishment of integrated proviral latency • GO:0022415 viral process • nuclear transport • negative regulation of viral genome replication • chromosome segregation • chromosome condensation Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	8815	23825
Ensembl	ENSG00000175334	ENSMUSG00000024844
UniProt	O75531	O54962
RefSeq (мРНК)	NM_003860 NM_001143985	NM_001038231 NM_001286608 NM_011793
RefSeq (білок)	NP_001137457 NP_003851	NP_001033320 NP_001273537 NP_035923
Локус (UCSC)	Хр. 11: 66 – 66 Mb	Хр. 19: 5.41 – 5.42 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

BANF1 (англ. Barrier to autointegration factor 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 89 амінокислот, а молекулярна маса — 10 059.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MTTSQKHRDF		VAEPMGEKPV		GSLAGIGEVL		GKKLEERGFD		KAYVVLGQFL
VLKKDEDLFR		EWLKDTCGAN		AKQSRDCFGC		LREWCDAFL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як взаємодія хазяїн-вірус, ацетилювання. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі, хромосомах.

Література

• Lee M.S., Craigie R. (1998). A previously unidentified host protein protects retroviral DNA from autointegration. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 95: 1528—1533. PMID 9465049 DOI:10.1073/pnas.95.4.1528
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Harris D., Engelman A. (2000). Both the structure and DNA binding function of the barrier-to-autointegration factor contribute to reconstitution of HIV type 1 integration in vitro. J. Biol. Chem. 275: 39671—39677. PMID 11005805 DOI:10.1074/jbc.M002626200
• Segura-Totten M., Kowalski A.K., Craigie R., Wilson K.L. (2002). Barrier-to-autointegration factor: major roles in chromatin decondensation and nuclear assembly. J. Cell Biol. 158: 475—485. PMID 12163470 DOI:10.1083/jcb.200202019
• Lin C.W., Engelman A. (2003). The barrier-to-autointegration factor is a component of functional human immunodeficiency virus type 1 preintegration complexes. J. Virol. 77: 5030—5036. PMID 12663813 DOI:10.1128/JVI.77.8.5030-5036.2003
• Mansharamani M., Wilson K.L. (2005). Direct binding of nuclear membrane protein MAN1 to emerin in vitro and two modes of binding to barrier-to-autointegration factor. J. Biol. Chem. 280: 13863—13870. PMID 15681850 DOI:10.1074/jbc.M413020200

Див. також

• Хромосома 11