BARX1

BARX1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2DMT
Ідентифікатори
Символи	BARX1, BARX homeobox 1
Зовнішні ІД	OMIM: 603260 MGI: 103124 HomoloGene: 7241 GeneCards: BARX1
Пов'язані генетичні захворювання
стравохід Барретта
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • DNA binding • sequence-specific DNA binding • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific Клітинна компонента • клітинне ядро Біологічний процес • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • cell-cell signaling • negative regulation of Wnt signaling pathway • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • epithelial cell differentiation • spleen development • transcription, DNA-templated • anterior/posterior pattern specification • нейробіологія розвитку • GO:1903374 anatomical structure development • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • animal organ development • digestive system development • transcription by RNA polymerase II • гістогенез Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	56033	12022
Ensembl	ENSG00000131668	ENSMUSG00000021381
UniProt	Q9HBU1	Q9ER42
RefSeq (мРНК)	NM_021570	NM_007526
RefSeq (білок)	NP_067545	NP_031552
Локус (UCSC)	Хр. 9: 93.95 – 93.96 Mb	Хр. 13: 48.82 – 48.82 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

BARX1 (англ. BARX homeobox 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 9-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 254 амінокислот, а молекулярна маса — 27 298.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MQRPGEPGAA		RFGPPEGCAD		HRPHRYRSFM		IEEILTEPPG		PKGAAPAAAA
AAAGELLKFG		VQALLAARPF		HSHLAVLKAE		QAAVFKFPLA		PLGCSGLSSA
LLAAGPGLPG		AAGAPHLPLE		LQLRGKLEAA		GPGEPGTKAK		KGRRSRTVFT
ELQLMGLEKR		FEKQKYLSTP		DRIDLAESLG		LSQLQVKTWY		QNRRMKWKKI
VLQGGGLESP		TKPKGRPKKN		SIPTSEQLTE		QERAKDAEKP		AEVPGEPSDR
SRED

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

• Gould D.B., Walter M.A. (2000). Cloning, characterization, localization, and mutational screening of the human BARX1 gene. Genomics. 68: 336—342. PMID 10995576 DOI:10.1006/geno.2000.6307
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Tucker A.S., Matthews K.L., Sharpe P.T. (1998). Transformation of tooth type induced by inhibition of BMP signaling. Science. 282: 1136—1138. PMID 9804553 DOI:10.1126/science.282.5391.1136

Див. також

• Хромосома 9