C9orf78

C9orf78
Ідентифікатори
Символи	C9orf78, HCA59, HSPC220, bA409K20.3, chromosome 9 open reading frame 78, CSU2, TLS1
Зовнішні ІД	MGI: 2385132 HomoloGene: 9551 GeneCards: C9orf78
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding Клітинна компонента • нуклеоплазма • гіалоплазма • клітинне ядро • spliceosomal complex Біологічний процес • regulation of mRNA splicing, via spliceosome Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	51759	227707
Ensembl	ENSG00000136819	ENSMUSG00000026851
UniProt	Q9NZ63	Q3TQI7
RefSeq (мРНК)	NM_016520	NM_144885
RefSeq (білок)	NP_057604	NP_659134
Локус (UCSC)	Хр. 9: 129.83 – 129.84 Mb	Хр. 2: 30.86 – 30.87 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

C9orf78 (англ. Chromosome 9 open reading frame 78) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 9-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 289 амінокислот, а молекулярна маса — 33 688.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MPVVRKIFRR		RRGDSESEED		EQDSEEVRLK		LEETREVQNL		RKRPNGVSAV
ALLVGEKVQE		ETTLVDDPFQ		MKTGGMVDMK		KLKERGKDKI		SEEEDLHLGT
SFSAETNRRD		EDADMMKYIE		TELKKRKGIV		EHEEQKVKPK		NAEDCLYELP
ENIRVSSAKK		TEEMLSNQML		SGIPEVDLGI		DAKIKNIIST		EDAKARLLAE
QQNKKKDSET		SFVPTNMAVN		YVQHNRFYHE		ELNAPIRRNK		EEPKARPLRV
GDTEKPEPER		SPPNRKRPAN		EKATDDYHYE		KFKKMNRRY

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Carrascal M., Ovelleiro D., Casas V., Gay M., Abian J. (2008). Phosphorylation analysis of primary human T lymphocytes using sequential IMAC and titanium oxide enrichment. J. Proteome Res. 7: 5167—5176. PMID 19367720 DOI:10.1021/pr800500r

Див. також

• Хромосома 9