C9orf84

C9orf84
Ідентифікатори
Символи	SHOC1, chromosome 9 open reading frame 84, ZIP2H, ZIP2, shortage in chiasmata 1, C9orf84, MZIP2
Зовнішні ІД	OMIM: 618038 MGI: 2140313 HomoloGene: 79783 GeneCards: SHOC1
Онтологія гена Молекулярна функція • DNA binding • single-stranded DNA binding • hydrolase activity • ATPase activity Клітинна компонента • condensed nuclear chromosome • хромосома Біологічний процес • resolution of meiotic recombination intermediates • GO:0007126 мейоз Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	158401	100155
Ensembl	ENSG00000165181	ENSMUSG00000038598
UniProt	Q5VXU9	A2ALV5
RefSeq (мРНК)	NM_001080551 NM_173521 NM_001378211 NM_001378212	NM_001033200 NM_001370843
RefSeq (білок)	NP_001074020 NP_775792 NP_001365140 NP_001365141	NP_001357772
Локус (UCSC)	Хр. 9: 111.69 – 111.8 Mb	Хр. 4: 59.04 – 59.14 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

C9orf84 (англ. Chromosome 9 open reading frame 84) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 9-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 444 амінокислот, а молекулярна маса — 165 202.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MTDTSVLDQW		KASFFVEDFL		EKKTITRMVT		QINCEFEEVV		PSSNPDSQIE
VEEVSLYTHM		DYNEVFTPVS		CLEKCSALQN		QNQDLFIDDK		GILFVSSRKH
LPTLPTLLSR		LKLFLVKDPL		LDFKGQIFTE		ANFSRECFSL		QETLEAFVKE
DFCMDKVNFC		QEKLEDTICL		NEPSSFLIEY		EFLIPPSLKP		EIDIPSLSEL
KELLNPVPEI		INYVDEKEKL		FERDLTNKHG		IEDIGDIKFS		STEILTIQSQ
SEPEECSKPG		ELEMPLTPLF		LTCQHSSVNS		LRTELQTFPL		SPVCKINLLT
AEESANEYYM		MWQLERCRSP		LNPFLLTVPR		IQEPHSQYSV		TDLKKIFSVK
EESLVINLEK		AEWWKQAGLN		LKMMETLEHL		NTYLCHDNLS		SNDTKIEIFL
PTKVLQLESC		LEHKSHSSPI		ALIDEKSTNA		HLSLPQKSPS		LAKEVPDLCF
SDDYFSDKGA		AKEEKPKNDQ		EPVNRIIQKK		ENNDHFELDC		TGPSIKSPSS
SIIKKASFEH		GKKQENDLDL		LSDFIMLRNK		YKTCTSKTEV		TNSDEKHDKE
ACSLTLQEES		PIVHINKTLE		EINQERGTDS		VIEIQASDSQ		CQAFCLLEAA
ASPILKNLVS		LCTLPTANWK		FATVIFDQTR		FLLKEQEKVV		SDAVRQGTID
EREMTFKHAA		LLHLLVTIRD		VLLTCSLDTA		LGYLSKAKDI		YNSILGPYLG
DIWRQLEIVQ		FIRGKKPETN		YKIQELQCQI		LSWMQSQQQI		KVLIIIRMDS
DGEKHFLIKI		LNKIEGLTLT		VLHSNERKDF		LESEGVLRGT		SSCVVVHNQY
IGADFPWSNF		SFVVEYNYVE		DSCWTKHCKE		LNIPYMAFKV		ILPDTVLERS
TLLDRFGGFL		LEIQIPYVFF		ASEGLLNTPD		ILQLLESNYN		ISLVERGCSE
SLKLFGSSEC		YVVVTIDEHT		AIILQDLEEL		NYEKASDNII		MRLMALSLQY
RYCWIILYTK		ETLNSEYLLT		EKTLHHLALI		YAALVSFGLN		SEELDVKLII
APGVEATALI		IRQIADHSLM		TSKRDPHEWL		DKSWLKVSPS		EEEMYLLDFP
CINPLVAQLM		LNKGPSLHWI		LLATLCQLQE		LLPEVPEKVL		KHFCSITSLF
KIGSSSITKS		PQISSPQENR		NQISTLSSQS		SASDLDSVIQ		EHNEYYQYLG
LGETVQEDKT		TILNDNSSIM		ELKEISSFLP		PVTSYNQTSY		WKDSSCKSNI
GQNTPFLINI		ESRRPAYNSF		LNHSDSESDV		FSLGLTQMNC		ETIKSPTDTQ
KRVSVVPRFI		NSQKRRTHEA		KGFINKDVSD		PIFSLEGTQS		PLHWNFKKNI
WEQENHPFNL		QYGAQQTACN		KLYSQKGNLF		TDQQKCLSDE		SEGLTCESSK
DETFWRELPS		VPSLDLFRAS		DSNANQKEFN		SLYFYQRAGK		SLGQKRHHES
SFNSGDKESL		TGFMCSQLPQ		FKKRRLAYEK		VPGRVDGQTR		LRFF

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 9