CARD9

CARD9
Ідентифікатори
Символи	CARD9, CANDF2, hcaspase recruitment domain family member 9
Зовнішні ІД	OMIM: 607212 MGI: 2685628 HomoloGene: 14150 GeneCards: CARD9
Пов'язані генетичні захворювання
ожиріння, анкілозуючий спондилоартрит, неспецифічний виразковий коліт, chronic mucocutaneous candidiasis
Онтологія гена Молекулярна функція • protein homodimerization activity • protein domain specific binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • CARD domain binding Клітинна компонента • цитоплазма • гіалоплазма • клітинна мембрана • GO:0009327 protein-containing complex Біологічний процес • regulation of apoptotic process • response to exogenous dsRNA • процес імунної системи • response to muramyl dipeptide • stimulatory C-type lectin receptor signaling pathway • positive regulation of JNK cascade • response to fungus • defense response to virus • response to peptidoglycan • positive regulation of interleukin-6 production • positive regulation of innate immune response • positive regulation of tumor necrosis factor production • positive regulation of I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling • I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling • positive regulation of stress-activated MAPK cascade • GO:0051637 defense response to Gram-positive bacterium • вроджений імунітет • positive regulation of cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic process Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	64170	332579
Ensembl	ENSG00000187796	ENSMUSG00000026928
UniProt	Q9H257	A2AIV8
RefSeq (мРНК)	NM_052814 NM_052813 NM_022352	NM_001037747
RefSeq (білок)	NP_434700 NP_434701	NP_001032836
Локус (UCSC)	Хр. 9: 136.36 – 136.37 Mb	Хр. 2: 26.24 – 26.25 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

CARD9 (англ. Caspase recruitment domain family member 9) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 9-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 536 амінокислот, а молекулярна маса — 62 241.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSDYENDDEC		WSVLEGFRVT		LTSVIDPSRI		TPYLRQCKVL		NPDDEEQVLS
DPNLVIRKRK		VGVLLDILQR		TGHKGYVAFL		ESLELYYPQL		YKKVTGKEPA
RVFSMIIDAS		GESGLTQLLM		TEVMKLQKKV		QDLTALLSSK		DDFIKELRVK
DSLLRKHQER		VQRLKEECEA		GSRELKRCKE		ENYDLAMRLA		HQSEEKGAAL
MRNRDLQLEI		DQLKHSLMKA		EDDCKVERKH		TLKLRHAMEQ		RPSQELLWEL
QQEKALLQAR		VQELEASVQE		GKLDRSSPYI		QVLEEDWRQA		LRDHQEQANT
IFSLRKDLRQ		GEARRLRCME		EKEMFELQCL		ALRKDSKMYK		DRIEAILLQM
EEVAIERDQA		IATREELHAQ		HARGLQEKDA		LRKQVRELGE		KADELQLQVF
QCEAQLLAVE		GRLRRQQLET		LVLSSDLEDG		SPRRSQELSL		PQDLEDTQLS
DKGCLAGGGS		PKQPFAALHQ		EQVLRNPHDA		GLSSGEPPEK		ERRRLKESFE
NYRRKRALRK		MQKGWRQGEE		DRENTTGSDN		TDTEGS

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як імунітет, вроджений імунітет, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 9