CCDC88B

CCDC88B
Ідентифікатори
Символи	CCDC88B, BRLZ, CCDC88, HKRP3, gipie, coiled-coil domain containing 88B
Зовнішні ІД	OMIM: 611205 MGI: 1925567 HomoloGene: 49992 GeneCards: CCDC88B
Онтологія гена Молекулярна функція • microtubule binding • dynein light intermediate chain binding Клітинна компонента • мембрана • цитоплазма • ендоплазматичний ретикулум • комплекс Ґольджі • центросома • цитоскелет Біологічний процес • positive regulation of T cell activation • positive regulation of T cell proliferation • GO:0032737 positive regulation of cytokine production • defense response to protozoan • cytoskeleton-dependent intracellular transport • cytoplasmic microtubule organization Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	283234	78317
Ensembl	ENSG00000168071	ENSMUSG00000047810
UniProt	A6NC98	Q4QRL3
RefSeq (мРНК)	NM_032251	NM_001081291 NM_198008
RefSeq (білок)	NP_115627	NP_001074760
Локус (UCSC)	Хр. 11: 64.34 – 64.36 Mb	Хр. 19: 6.82 – 6.84 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

CCDC88B (англ. Coiled-coil domain containing 88B) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 11-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 476 амінокислот, а молекулярна маса — 164 809.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MEGGKGPRLR		DFLSGSLATW		ALGLAGLVGE		AEDSEGEEEE		EEEEPPLWLE
KRFLRLSDGA		LLLRVLGIIA		PSSRGGPRML		RGLDGPAAWR		VWNLNHLWGR
LRDFYQEELQ		LLILSPPPDL		QTLGFDPLSE		EAVEQLEGVL		RLLLGASVQC
EHRELFIRHI		QGLSLEVQSE		LAAAIQEVTQ		PGAGVVLALS		GPDPGELAPA
ELEMLSRSLM		GTLSKLARER		DLGAQRLAEL		LLEREPLCLR		PEAPSRAPAE
GPSHHLALQL		ANAKAQLRRL		RQELEEKAEL		LLDSQAEVQG		LEAEIRRLRQ
EAQALSGQAK		RAELYREEAE		ALRERAGRLP		RLQEELRRCR		ERLQAAEAYK
SQLEEERVLS		GVLEASKALL		EEQLEAARER		CARLHETQRE		NLLLRTRLGE
AHAELDSLRH		QVDQLAEENV		ELELELQRSL		EPPPGSPGEA		PLAGAAPSLQ
DEVREAEAGR		LRTLERENRE		LRGLLQVLQG		QPGGQHPLLE		APREDPVLPV
LEEAPQTPVA		FDHSPQGLVQ		KARDGGPQAL		DLAPPALDSV		LEASAECPQA
PDSDPQEAES		PLQAAAMDPQ		ASDWSPQESG		SPVETQESPE		KAGRRSSLQS
PASVAPPQGP		GTKIQAPQLL		GGETEGREAP		QGELVPEAWG		LRQEGPEHKP
GPSEPSSVQL		EEQEGPNQGL		DLATGQAEAR		EHDQRLEGTV		RDPAWQKPQQ
KSEGALEVQV		WEGPIPGESL		ASGVAEQEAL		REEVAQLRRK		AEALGDELEA
QARKLEAQNT		EAARLSKELA		QARRAEAEAH		REAEAQAWEQ		ARLREAVEAA
GQELESASQE		REALVEALAA		AGRERRQWER		EGSRLRAQSE		AAEERMQVLE
SEGRQHLEEA		ERERREKEAL		QAELEKAVVR		GKELGDRLEH		LQRELEQAAL
ERQEFLREKE		SQHQRYQGLE		QRLEAELQAA		ATSKEEALME		LKTRALQLEE
ELFQLRQGPA		GLGPKKRAEP		QLVETQNVRL		IEVERSNAML		VAEKAALQGQ
LQHLEGQLGS		LQGRAQELLL		QSQRAQEHSS		RLQAEKSVLE		IQGQELHRKL
EVLEEEVRAA		RQSQEETRGQ		QQALLRDHKA		LAQLQRRQEA		ELEGLLVRHR
DLKANMRALE		LAHRELQGRH		EQLQAQRASV		EAQEVALLAE		RERLMQDGHR
QRGLEEELRR		LQSEHDRAQM		LLAELSRERG		ELQGERGELR		GRLARLELER
AQLEMQSQQL		RESNQQLDLS		ACRLTTQCEL		LTQLRSAQEE		ENRQLLAEVQ
ALSRENRELL		ERSLESRDHL		HREQREYLDQ		LNALRREKQK		LVEKIMDQYR
VLEPVPLPRT		KKGSWLADKV		KRLMRPRREG		GPPGGLRLGA		DGAGSTESLG
GPPETELPEG		READGTGSPS		PAPMRRAQSS		LCLRDETLAG		GQRRKLSSRF
PVGRSSESFS		PGDTPRQRFR		QRHPGPLGAP		VSHSKGPGVG		WENSAETLQE
HETDANREGP		EVQEPEKRPL		TPSLSQ

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як відповідь на стрес, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті, мембрані, ендоплазматичному ретикулумі, апараті гольджі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Ham H., Huynh W., Schoon R.A., Vale R.D., Billadeau D.D. (2015). HkRP3 is a microtubule-binding protein regulating lytic granule clustering and NK cell killing. J. Immunol. 194: 3984—3996. PMID 25762780 DOI:10.4049/jimmunol.1402897

Див. також

• Хромосома 11