CELF1

CELF1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2CPZ, 2DHS, 2RQ4, 2RQC, 3NMR, 3NNA, 3NNC, 3NNH
Ідентифікатори
Символи	CELF1, BRUNOL2, CUG-BP, CUGBP, CUGBP1, EDEN-BP, NAB50, NAPOR, hNab50, CUGBP, Elav-like family member 1, CUGBP Elav-like family member 1
Зовнішні ІД	OMIM: 601074 MGI: 1342295 HomoloGene: 136342 GeneCards: CELF1
Пов'язані генетичні захворювання
хвороба Альцгеймера
Онтологія гена Молекулярна функція • translation repressor activity, mRNA regulatory element binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • RNA binding • nucleic acid binding • BRE binding • mRNA binding • pre-mRNA binding Клітинна компонента • цитоплазма • мембрана • нуклеоплазма • клітинне ядро • Рибонуклеопротеїни Біологічний процес • germ cell development • embryo development • mRNA processing • GO:0035194 РНК-інтерференція • regulation of RNA splicing • Сплайсинг РНК • negative regulation of translation • mRNA splice site selection • regulation of alternative mRNA splicing, via spliceosome • embryo development ending in birth or egg hatching Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	10658	13046
Ensembl	ENSG00000149187	ENSMUSG00000005506
UniProt	Q92879	P28659
RefSeq (мРНК)	NM_001025596 NM_001172639 NM_001172640 NM_006560 NM_198700 NM_001330272	NM_001244891 NM_001244903 NM_017368 NM_198683
RefSeq (білок)	NP_001020767 NP_001166110 NP_001166111 NP_001317201 NP_006551 NP_941989 NP_001363298 NP_001363299 NP_001363300 NP_001363301 NP_001363302 NP_001363303 NP_001363305 NP_001363306 NP_001363307 NP_001363308 NP_001363309 NP_001363310 NP_001363311 NP_001363312 NP_001363313 NP_001363314 NP_001363315 NP_001363316 NP_001363317 NP_001363318 NP_001363319 NP_001363320 NP_001363322 NP_001363324 NP_001363325 NP_001363326 NP_001363328 NP_001363335 NP_001363336 NP_001363337 NP_001363338 NP_001363339 NP_001363340 NP_001363341 NP_001363342 NP_001363343 NP_001363344 NP_001363346 NP_001363347 NP_001363348 NP_001363349 NP_001363350 NP_001363351 NP_001363352 NP_001363353 NP_001363354 NP_001363355 NP_001363356 NP_001363357 NP_001363358 NP_001363359 NP_001363360 NP_001363361 NP_001363362 NP_001363363 NP_001363364 NP_001363365 NP_001363366 NP_001363367 NP_001363368 NP_001363369 NP_001363370 NP_001363371 NP_001363372 NP_001363373 NP_001363374 NP_001363375 NP_001363376 NP_001363377 NP_001363378 NP_001363379 NP_001363380 NP_001363381 NP_001363382 NP_001363383 NP_001363384 NP_001363385 NP_001363386 NP_001363387 NP_001363388 NP_001363389 NP_001363390 NP_001363391 NP_001363392 NP_001363304	NP_001231820 NP_001231832 NP_059064 NP_941955 NP_001393093 NP_001393094 NP_001393095 NP_001393096 NP_001393097 NP_001393098 NP_001393099 NP_001393100 NP_001393101 NP_001393102 NP_001393103 NP_001393104 NP_001393105 NP_001393106 NP_001393107 NP_001393108 NP_001393109 NP_001393110 NP_001393111 NP_001393112 NP_001393113
Локус (UCSC)	Хр. 11: 47.47 – 47.57 Mb	н/д
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

CELF1 (англ. CUGBP Elav-like family member 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 486 амінокислот, а молекулярна маса — 52 063.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MNGTLDHPDQ		PDLDAIKMFV		GQVPRTWSEK		DLRELFEQYG		AVYEINVLRD
RSQNPPQSKG		CCFVTFYTRK		AALEAQNALH		NMKVLPGMHH		PIQMKPADSE
KNNAVEDRKL		FIGMISKKCT		ENDIRVMFSS		FGQIEECRIL		RGPDGLSRGC
AFVTFTTRAM		AQTAIKAMHQ		AQTMEGCSSP		MVVKFADTQK		DKEQKRMAQQ
LQQQMQQISA		ASVWGNLAGL		NTLGPQYLAL		YLQLLQQTAS		SGNLNTLSSL
HPMGGLNAMQ		LQNLAALAAA		ASAAQNTPSG		TNALTTSSSP		LSVLTSSGSS
PSSSSSNSVN		PIASLGALQT		LAGATAGLNV		GSLAGMAALN		GGLGSSGLSN
GTGSTMEALT		QAYSGIQQYA		AAALPTLYNQ		NLLTQQSIGA		AGSQKEGPEG
ANLFIYHLPQ		EFGDQDLLQM		FMPFGNVVSA		KVFIDKQTNL		SKCFGFVSYD
NPVSAQAAIQ		SMNGFQIGMK		RLKVQLKRSK		NDSKPY

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до активаторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як процесинг мРНК, сплайсинг мРНК, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

• Good P.J., Chen Q., Warner S.J., Herring D.C. (2000). A family of human RNA-binding proteins related to the Drosophila Bruno translational regulator. J. Biol. Chem. 275: 28583—28592. PMID 10893231 DOI:10.1074/jbc.M003083200
• Paillard L., Legagneux V., Maniey D., Osborne H.B. (2002). c-Jun ARE targets mRNA deadenylation by an EDEN-BP (embryo deadenylation element-binding protein)-dependent pathway. J. Biol. Chem. 277: 3232—3235. PMID 11707455 DOI:10.1074/jbc.M109362200
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Timchenko N.A., Welm A.L., Lu X., Timchenko L.T. (1999). CUG repeat binding protein (CUGBP1) interacts with the 5' region of C/EBPbeta mRNA and regulates translation of C/EBPbeta isoforms. Nucleic Acids Res. 27: 4517—4525. PMID 10536163 DOI:10.1093/nar/27.22.4517
• Ladd A.N., Charlet-B N., Cooper T.A. (2001). The CELF family of RNA binding proteins is implicated in cell-specific and developmentally regulated alternative splicing. Mol. Cell. Biol. 21: 1285—1296. PMID 11158314 DOI:10.1128/MCB.21.4.1285-1296.2001
• Paillard L., Legagneux V., Beverley Osborne H. (2003). A functional deadenylation assay identifies human CUG-BP as a deadenylation factor. Biol. Cell. 95: 107—113. PMID 12799066 DOI:10.1016/S0248-4900(03)00010-8

Див. також

• Хромосома 11