DCPS

DCPS
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1ST0, 1ST4, 1XML, 1XMM, 3BL7, 3BL9, 3BLA, 4QDE, 4QDV, 4QEB
Ідентифікатори
Символи	DCPS, DCS1, HINT-5, HINT5, HSL1, ARS, HSPC015, decapping enzyme, scavenger
Зовнішні ІД	OMIM: 610534 MGI: 1916555 HomoloGene: 32202 GeneCards: DCPS
Пов'язані генетичні захворювання
Al-Raqad syndrome
Онтологія гена Молекулярна функція • m7G(5')pppN diphosphatase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • hydrolase activity • RNA 7-methylguanosine cap binding • exoribonuclease activity Клітинна компонента • цитоплазма • мітохондрія • клітинне ядро • нуклеоплазма • P-body • гіалоплазма Біологічний процес • mRNA cis splicing, via spliceosome • negative regulation of programmed cell death • mRNA processing • nuclear-transcribed mRNA catabolic process, deadenylation-dependent decay • cellular response to menadione • Сплайсинг РНК • exonucleolytic catabolism of deadenylated mRNA • RNA phosphodiester bond hydrolysis, exonucleolytic • deadenylation-dependent decapping of nuclear-transcribed mRNA Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	28960	69305
Ensembl	ENSG00000110063	ENSMUSG00000032040
UniProt	Q96C86	Q9DAR7
RefSeq (мРНК)	NM_014026 NM_001350236	NM_027030
RefSeq (білок)	NP_054745 NP_001337165	NP_081306
Локус (UCSC)	Хр. 11: 126.3 – 126.35 Mb	Хр. 9: 35.04 – 35.09 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

DCPS (англ. Decapping enzyme, scavenger) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 337 амінокислот, а молекулярна маса — 38 609.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MADAAPQLGK		RKRELDVEEA		HAASTEEKEA		GVGNGTCAPV		RLPFSGFRLQ
KVLRESARDK		IIFLHGKVNE		ASGDGDGEDA		VVILEKTPFQ		VEQVAQLLTG
SPELQLQFSN		DIYSTYHLFP		PRQLNDVKTT		VVYPATEKHL		QKYLRQDLRL
IRETGDDYRN		ITLPHLESQS		LSIQWVYNIL		DKKAEADRIV		FENPDPSDGF
VLIPDLKWNQ		QQLDDLYLIA		ICHRRGIRSL		RDLTPEHLPL		LRNILHQGQE
AILQRYRMKG		DHLRVYLHYL		PSYYHLHVHF		TALGFEAPGS		GVERAHLLAE
VIENLECDPR		HYQQRTLTFA		LRADDPLLKL		LQEAQQS

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як процесинг мРНК, сплайсинг мРНК, ацетилювання. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

• Liu H., Rodgers N.D., Jiao X., Kiledjian M. (2002). The scavenger mRNA decapping enzyme DcpS is a member of the HIT family of pyrophosphatases. EMBO J. 21: 4699—4708. PMID 12198172 DOI:10.1093/emboj/cdf448
• Kwasnicka D.A., Krakowiak A., Thacker C., Brenner C., Vincent S.R. (2003). Coordinate expression of NADPH-dependent flavin reductase, Fre-1, and Hint-related 7meGMP-directed hydrolase, DCS-1. J. Biol. Chem. 278: 39051—39058. PMID 12871939 DOI:10.1074/jbc.M306355200
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Wang Z., Kiledjian M. (2001). Functional link between the mammalian exosome and mRNA decapping. Cell. 107: 751—762. PMID 11747811 DOI:10.1016/S0092-8674(01)00592-X
• van Dijk E., Le Hir H., Seraphin B. (2003). DcpS can act in the 5'-3' mRNA decay pathway in addition to the 3'-5' pathway. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 100: 12081—12086. PMID 14523240 DOI:10.1073/pnas.1635192100
• Kwasnicka-Crawford D.A., Vincent S.R. (2005). Role of a novel dual flavin reductase (NR1) and an associated histidine triad protein (DCS-1) in menadione-induced cytotoxicity. Biochem. Biophys. Res. Commun. 336: 565—571. PMID 16140270 DOI:10.1016/j.bbrc.2005.08.129

Див. також

• Хромосома 11