ECM2

ECM2
Ідентифікатори
Символи	ECM2, extracellular matrix protein 2
Зовнішні ІД	OMIM: 603479 MGI: 3039578 HomoloGene: 1064 GeneCards: ECM2
Онтологія гена Молекулярна функція • collagen V binding • integrin binding • heparin binding • collagen binding Клітинна компонента • extracellular region • interstitial matrix • міжклітинний простір • GO:0005578 Позаклітинна матриця Біологічний процес • cell-matrix adhesion • extracellular matrix organization • аксоноґенеза • positive regulation of cell-substrate adhesion Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	1842	407800
Ensembl	ENSG00000106823	ENSMUSG00000043631
UniProt	O94769	Q5FW85
RefSeq (мРНК)	NM_001393 NM_001197295 NM_001197296	NM_001012324
RefSeq (білок)	NP_001184224 NP_001184225 NP_001384	NP_001012324
Локус (UCSC)	Хр. 9: 92.49 – 92.54 Mb	Хр. 13: 49.66 – 49.69 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

ECM2 (англ. Extracellular matrix protein 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 9-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 699 амінокислот, а молекулярна маса — 79 789.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MKIAVLFCFF		LLIIFQTDFG		KNEEIPRKQR		RKIYHRRLRK		SSTSHKHRSN
RQLGIQQTTV		FTPVARLPIV		NFDYSMEEKF		ESFSSFPGVE		SSYNVLPGKK
GHCLVKGITM		YNKAVWSPEP		CTTCLCSDGR		VLCDETMCHP		QRCPQTVIPE
GECCPVCSAT		VSYSLLSGIA		LNDRNEFSGD		SSEQREPTNL		LHKQLPPPQV
GMDRIVRKEA		LQSEEDEEVK		EEDTEQKRET		PESRNQGQLY		SEGDSRGGDR
KQRPGEERRL		AHQQQRQGRE		EEEDEEEEGE		EGEEDEEDEE		DPVRGDMFRM
PSRSPLPAPP		RGTLRLPSGC		SLSYRTISCI		NAMLTQIPPL		TAPQITSLEL
TGNSIASIPD		EAFNGLPNLE		RLDLSKNNIT		SSGIGPKAFK		LLKKLMRLNM
DGNNLIQIPS		QLPSTLEELK		VNENNLQAID		EESLSDLNQL		VTLELEGNNL
SEANVNPLAF		KPLKSLAYLR		LGKNKFRIIP		QGLPGSIEEL		YLENNQIEEI
TEICFNHTRK		INVIVLRYNK		IEENRIAPLA		WINQENLESI		DLSYNKLYHV
PSYLPKSLLH		LVLLGNQIER		IPGYVFGHME		PGLEYLYLSF		NKLADDGMDR
VSFYGAYHSL		RELFLDHNDL		KSIPPGIQEM		KALHFLRLNN		NKIRNILPEE
ICNAEEDDDS		NLEHLHLENN		YIKIREIPSY		TFSCIRSYSS		IVLKPQNIK

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Локалізований у позаклітинному матриксі. Також секретований назовні.

Література

• Nishiu J., Tanaka T., Nakamura Y. (1998). Identification of a novel gene (ECM2) encoding a putative extracellular matrix protein expressed predominantly in adipose and female-specific tissues and its chromosomal localization to 9q22.3. Genomics. 52: 378—381. PMID 9790758 DOI:10.1006/geno.1998.5455
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 9