EMSY

EMSY
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1UTU, 1UZ3, 2FMM
Ідентифікатори
Символи	EMSY, GL002, C11orf30, BRCA2 interacting transcriptional repressor, EMSY transcriptional repressor, BRCA2 interacting
Зовнішні ІД	OMIM: 608574 MGI: 1924203 HomoloGene: 32465 GeneCards: EMSY
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • protein homodimerization activity Клітинна компонента • клітинне ядро • нуклеоплазма Біологічний процес • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • GO:0100026 Репарація ДНК • transcription, DNA-templated • cellular response to DNA damage stimulus • GO:0031497, GO:0006336, GO:0034724, GO:0001301, GO:0007580, GO:0034652, GO:0010847 chromatin organization Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	56946	233545
Ensembl	ENSG00000158636	ENSMUSG00000035401
UniProt	Q7Z589	Q8BMB0
RefSeq (мРНК)	NM_001300942 NM_001300943 NM_001300944 NM_020193	NM_172280 NM_001381867 NM_001381868 NM_001381869 NM_001381870
RefSeq (білок)	NP_001287871 NP_001287872 NP_001287873 NP_064578	NP_758484 NP_001368796 NP_001368797 NP_001368798 NP_001368799
Локус (UCSC)	Хр. 11: 76.44 – 76.55 Mb	Хр. 7: 98.24 – 98.31 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

EMSY (англ. EMSY, BRCA2 interacting transcriptional repressor) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 322 амінокислот, а молекулярна маса — 141 468.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MPVVWPTLLD		LSRDECKRIL		RKLELEAYAG		VISALRAQGD		LTKEKKDLLG
ELSKVLSIST		ERHRAEVRRA		VNDERLTTIA		HNMSGPNSSS		EWSIEGRRLV
PLMPRLVPQT		AFTVTANAVA		NAAIQHNASL		PVPAETGSKE		VVCYSYTSTT
STPTSTPVPS		GSIATVKSPR		PASPASNVVV		LPSGSTVYVK		SVSCSDEDEK
PRKRRRTNSS		SSSPVVLKEV		PKAVVPVSKT		ITVPVSGSPK		MSNIMQSIAN
SLPPHMSPVK		ITFTKPSTQT		TNTTTQKVII		VTTSPSSTFV		PNILSKSHNY
AAVTKLVPTS		VIASTTQKPP		VVITASQSSL		VSNSSSGSSS		STPSPIPNTV
AVTAVVSSTP		SVVMSTVAQG		VSTSAIKMAS		TRLPSPKSLV		SAPTQILAQF
PKQHQQSPKQ		QLYQVQQQTQ		QQVAQPSPVS		HQQQPQQSPL		PPGIKPTIQI
KQESGVKIIT		QQVQPSKILP		KPVTATLPTS		SNSPIMVVSS		NGAIMTTKLV
TTPTGTQATY		TRPTVSPSIG		RMAATPGAAT		YVKTTSGSII		TVVPKSLATL
GGKIISSNIV		SGTTTKITTI		PMTSKPNVIV		VQKTTGKGTT		IQGLPGKNVV
TTLLNAGGEK		TIQTVPTGAK		PAILTATRPI		TKMIVTQPKG		IGSTVQPAAK
IIPTKIVYGQ		QGKTQVLIKP		KPVTFQATVV		SEQTRQLVTE		TLQQASRVAE
AGNSSIQEGK		EEPQNYTDSS		SSSTESSQSS		QDSQPVVHVI		ASRRQDWSEH
EIAMETSPTI		IYQDVSSESQ		SATSTIKALL		ELQQTTVKEK		LESKPRQPTI
DLSQMAVPIQ		MTQEKRHSPE		SPSIAVVESE		LVAEYITTER		TDEGTEVAFP
LLVSHRSQPQ		QPSQPQRTLL		QHVAQSQTAT		QTSVVVKSIP		ASSPGAITHI
MQQALSSHTA		FTKHSEELGT		EEGEVEEMDT		LDPQTGLFYR		SALTQSQSAK
QQKLSQPPLE		QTQLQVKTLQ		CFQTKQKQTI		HLQADQLQHK		LPQMPQLSIR
HQKLTPLQQE		QAQPKPDVQH		TQHPMVAKDR		QLPTLMAQPP		QTVVQVLAVK
TTQQLPKLQQ		APNQPKIYVQ		PQTPQSQMSL		PASSEKQTAS		QVEQPIITQG
SSVTKITFEG		RQPPTVTKIT		GGSSVPKLTS		PVTSISPIQA		SEKTAVSDIL
KMSLMEAQID		TNVEHMIVDP		PKKALATSML		TGEAGSLPST		HMVVAGMANS
TPQQQKCRES		CSSPSTVGSS		LTTRKIDPPA		VPATGQFMRI		QNVGQKKAEE
SPAEIIIQAI		PQYAIPCHSS		SNVVVEPSGL		LELNNFTSQQ		LDDEETAMEQ
DIDSSTEDGT		EPSPSQSSAE		RS

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, регуляторів хроматину, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, пошкодження ДНК, репарація ДНК, альтернативний сплайсинг. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 DOI:10.1038/nbt1240
• Huang Y., Myers M.P., Xu R.-M. (2006). Crystal structure of the HP1-EMSY complex reveals an unusual mode of HP1 binding. Structure. 14: 703—712. PMID 16615912 DOI:10.1016/j.str.2006.01.007

Див. також

• Хромосома 11