GCNT1

GCNT1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2GAK, 2GAM, 3OTK
Ідентифікатори
Символи	GCNT1, C2GNT, C2GNT-L, C2GNT1, G6NT, NACGT2, NAGCT2, glucosaminyl (N-acetyl) transferase 1, core 2, glucosaminyl (N-acetyl) transferase 1
Зовнішні ІД	OMIM: 600391 MGI: 95676 HomoloGene: 37486 GeneCards: GCNT1
Онтологія гена Молекулярна функція • transferase activity • acetylglucosaminyltransferase activity • glycosyltransferase activity • beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding Клітинна компонента • integral component of membrane • комплекс Ґольджі • мембрана • Golgi cisterna • trans-Golgi network • Golgi membrane • міжклітинний простір Біологічний процес • glycoprotein biosynthetic process • tissue morphogenesis • response to insulin • GO:0033578, GO:0033577, GO:0033575, GO:0033576 protein glycosylation • kidney morphogenesis • O-glycan processing • leukocyte tethering or rolling • cell adhesion molecule production Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	2650	14537
Ensembl	ENSG00000187210	ENSMUSG00000038843
UniProt	Q02742	Q09324
RefSeq (мРНК)	NM_001097633 NM_001097634 NM_001097635 NM_001097636 NM_001490	NM_001136484 NM_010265 NM_173442
RefSeq (білок)	NP_001091102 NP_001091103 NP_001091104 NP_001091105 NP_001481	NP_001129956 NP_034395 NP_775618
Локус (UCSC)	Хр. 9: 76.42 – 76.65 Mb	Хр. 19: 17.3 – 17.35 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

GCNT1 (англ. Glucosaminyl (N-acetyl) transferase 1, core 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 9-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 428 амінокислот, а молекулярна маса — 49 799.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MLRTLLRRRL		FSYPTKYYFM		VLVLSLITFS		VLRIHQKPEF		VSVRHLELAG
ENPSSDINCT		KVLQGDVNEI		QKVKLEILTV		KFKKRPRWTP		DDYINMTSDC
SSFIKRRKYI		VEPLSKEEAE		FPIAYSIVVH		HKIEMLDRLL		RAIYMPQNFY
CIHVDTKSED		SYLAAVMGIA		SCFSNVFVAS		RLESVVYASW		SRVQADLNCM
KDLYAMSANW		KYLINLCGMD		FPIKTNLEIV		RKLKLLMGEN		NLETERMPSH
KEERWKKRYE		VVNGKLTNTG		TVKMLPPLET		PLFSGSAYFV		VSREYVGYVL
QNEKIQKLME		WAQDTYSPDE		YLWATIQRIP		EVPGSLPASH		KYDLSDMQAV
ARFVKWQYFE		GDVSKGAPYP		PCDGVHVRSV		CIFGAGDLNW		MLRKHHLFAN
KFDVDVDLFA		IQCLDEHLRH		KALETLKH

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, глікозилтрансфераз. Локалізований у мембрані, апараті гольджі.

Література

• Bierhuizen M.F.A., Fukuda M. (1992). Expression cloning of a cDNA encoding UDP-GlcNAc:Gal beta 1-3-GalNAc-R (GlcNAc to GalNAc) beta 1-6GlcNAc transferase by gene transfer into CHO cells expressing polyoma large tumor antigen. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 89: 9326—9330. PMID 1329093 doi:10.1073/pnas.89.19.9326
• Bierhuizen M.F.A., Maemura K., Kudo S., Fukuda M. (1995). Genomic organization of core 2 and I branching beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferases. Implication for evolution of the beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase gene family. Glycobiology. 5: 417—425. PMID 7579796 doi:10.1093/glycob/5.4.417
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
• Ali M.F., Chachadi V.B., Petrosyan A., Cheng P.W. (2012). Golgi phosphoprotein 3 determines cell binding properties under dynamic flow by controlling Golgi localization of core 2 N-acetylglucosaminyltransferase 1. J. Biol. Chem. 287: 39564—39577. PMID 23027862 doi:10.1074/jbc.M112.346528

Див. також

• Хромосома 9