KDM2A

KDM2A
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2YU1, 2YU2, 4BBQ
Ідентифікатори
Символи	KDM2A, CXXC8, FBL11, FBL7, FBXL11, JHDM1A, LILINA, lysine demethylase 2A
Зовнішні ІД	OMIM: 605657 MGI: 1354736 HomoloGene: 56564 GeneCards: KDM2A
Реагує на сполуку
daminozide
Онтологія гена Молекулярна функція • DNA binding • oxidoreductase activity • zinc ion binding • dioxygenase activity • зв'язування з іоном металу • histone demethylase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • histone H3-methyl-lysine-36 demethylase activity • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific Клітинна компонента • нуклеоплазма • клітинне ядро Біологічний процес • double-strand break repair via nonhomologous end joining • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • histone H3-K36 demethylation • transcription, DNA-templated • GO:0031497, GO:0006336, GO:0034724, GO:0001301, GO:0007580, GO:0034652, GO:0010847 chromatin organization • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • negative regulation of transcription by competitive promoter binding • circadian regulation of gene expression • regulation of circadian rhythm • ритмічний процес Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	22992	225876
Ensembl	ENSG00000173120	ENSMUSG00000054611
UniProt	Q9Y2K7	P59997
RefSeq (мРНК)	NM_001256405 NM_012308	NM_001001984
RefSeq (білок)	NP_001243334 NP_036440	NP_001001984
Локус (UCSC)	Хр. 11: 67.12 – 67.26 Mb	Хр. 19: 4.36 – 4.45 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

KDM2A (англ. Lysine demethylase 2A) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 162 амінокислот, а молекулярна маса — 132 793.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MEPEEERIRY		SQRLRGTMRR		RYEDDGISDD		EIEGKRTFDL		EEKLHTNKYN
ANFVTFMEGK		DFNVEYIQRG		GLRDPLIFKN		SDGLGIKMPD		PDFTVNDVKM
CVGSRRMVDV		MDVNTQKGIE		MTMAQWTRYY		ETPEEEREKL		YNVISLEFSH
TRLENMVQRP		STVDFIDWVD		NMWPRHLKES		QTESTNAILE		MQYPKVQKYC
LMSVRGCYTD		FHVDFGGTSV		WYHIHQGGKV		FWLIPPTAHN		LELYENWLLS
GKQGDIFLGD		RVSDCQRIEL		KQGYTFVIPS		GWIHAVYTPT		DTLVFGGNFL
HSFNIPMQLK		IYNIEDRTRV		PNKFRYPFYY		EMCWYVLERY		VYCITNRSHL
TKEFQKESLS		MDLELNGLES		GNGDEEAVDR		EPRRLSSRRS		VLTSPVANGV
NLDYDGLGKT		CRSLPSLKKT		LAGDSSSDCS		RGSHNGQVWD		PQCAPRKDRQ
VHLTHFELEG		LRCLVDKLES		LPLHKKCVPT		GIEDEDALIA		DVKILLEELA
NSDPKLALTG		VPIVQWPKRD		KLKFPTRPKV		RVPTIPITKP		HTMKPAPRLT
PVRPAAASPI		VSGARRRRVR		CRKCKACVQG		ECGVCHYCRD		MKKFGGPGRM
KQSCVLRQCL		APRLPHSVTC		SLCGEVDQNE		ETQDFEKKLM		ECCICNEIVH
PGCLQMDGEG		LLNEELPNCW		ECPKCYQEDS		SEKAQKRKME		ESDEEAVQAK
VLRPLRSCDE		PLTPPPHSPT		SMLQLIHDPV		SPRGMVTRSS		PGAGPSDHHS
ASRDERFKRR		QLLRLQATER		TMVREKENNP		SGKKELSEVE		KAKIRGSYLT
VTLQRPTKEL		HGTSIVPKLQ		AITASSANLR		HSPRVLVQHC		PARTPQRGDE
EGLGGEEEEE		EEEEEEDDSA		EEGGAARLNG		RGSWAQDGDE		SWMQREVWMS
VFRYLSRREL		CECMRVCKTW		YKWCCDKRLW		TKIDLSRCKA		IVPQALSGII
KRQPVSLDLS		WTNISKKQLT		WLVNRLPGLK		DLLLAGCSWS		AVSALSTSSC
PLLRTLDLRW		AVGIKDPQIR		DLLTPPADKP		GQDNRSKLRN		MTDFRLAGLD
ITDATLRLII		RHMPLLSRLD		LSHCSHLTDQ		SSNLLTAVGS		STRYSLTELN
MAGCNKLTDQ		TLIYLRRIAN		VTLIDLRGCK		QITRKACEHF		ISDLSINSLY
CLSDEKLIQK		IS

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до оксидоредуктаз, репресорів, регуляторів хроматину, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, убіквітинування білків, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, іоном заліза, ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

• Ilyin G.P., Rialland M., Pigeon C., Guguen-Guillouzo C. (2000). cDNA cloning and expression analysis of new members of the mammalian F-box protein family. Genomics. 67: 40—47. PMID 10945468 DOI:10.1006/geno.2000.6211
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Carrascal M., Ovelleiro D., Casas V., Gay M., Abian J. (2008). Phosphorylation analysis of primary human T lymphocytes using sequential IMAC and titanium oxide enrichment. J. Proteome Res. 7: 5167—5176. PMID 19367720 DOI:10.1021/pr800500r

Див. також

• Хромосома 11