MMP16

MMP16
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1RM8
Ідентифікатори
Символи	MMP16, C8orf57, MMP-X2, MT-MMP2, MT-MMP3, MT3-MMP, matrix metallopeptidase 16
Зовнішні ІД	OMIM: 602262 MGI: 1276107 HomoloGene: 55939 GeneCards: MMP16
Онтологія гена
Молекулярна функція	• зв'язування з іоном металу; • GO:0070122 peptidase activity; • GO:0010577 enzyme activator activity; • hydrolase activity; • metallopeptidase activity; • metalloendopeptidase activity; • zinc ion binding; • metalloaminopeptidase activity;
Клітинна компонента	• integral component of membrane; • мембрана; • GO:0005578 Позаклітинна матриця; • клітинна мембрана; • extracellular region; • cell surface; • Golgi lumen; • integral component of plasma membrane; • міжклітинний простір;
Біологічний процес	• осифікація; • extracellular matrix disassembly; • осифікація ендохондральна; • craniofacial suture morphogenesis; • chondrocyte proliferation; • collagen catabolic process; • embryonic cranial skeleton morphogenesis; • bone development; • GO:0048554 positive regulation of catalytic activity; • протеоліз; • protein processing; • GO:0044267 protein metabolic process; • skeletal system development; • extracellular matrix organization;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ; ; ;
	Більше даних
Ортологи
	4325
	17389
	ENSG00000156103
	ENSMUSG00000028226
	P51512
	Q9WTR0
	NM_005941; NM_022564; NM_032297
	NM_019724; NM_001379518; NM_001379519
	NP_005932
	NP_062698; NP_001366447; NP_001366448
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

MMP16 (англ. Matrix metallopeptidase 16) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 8-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 607 амінокислот, а молекулярна маса — 69 521^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MILLTFSTGR	RLDFVHHSGV	FFLQTLLWIL	CATVCGTEQY	FNVEVWLQKY
GYLPPTDPRM	SVLRSAETMQ	SALAAMQQFY	GINMTGKVDR	NTIDWMKKPR
CGVPDQTRGS	SKFHIRRKRY	ALTGQKWQHK	HITYSIKNVT	PKVGDPETRK
AIRRAFDVWQ	NVTPLTFEEV	PYSELENGKR	DVDITIIFAS	GFHGDSSPFD
GEGGFLAHAY	FPGPGIGGDT	HFDSDEPWTL	GNPNHDGNDL	FLVAVHELGH
ALGLEHSNDP	TAIMAPFYQY	METDNFKLPN	DDLQGIQKIY	GPPDKIPPPT
RPLPTVPPHR	SIPPADPRKN	DRPKPPRPPT	GRPSYPGAKP	NICDGNFNTL
AILRREMFVF	KDQWFWRVRN	NRVMDGYPMQ	ITYFWRGLPP	SIDAVYENSD
GNFVFFKGNK	YWVFKDTTLQ	PGYPHDLITL	GSGIPPHGID	SAIWWEDVGK
TYFFKGDRYW	RYSEEMKTMD	PGYPKPITVW	KGIPESPQGA	FVHKENGFTY
FYKGKEYWKF	NNQILKVEPG	YPRSILKDFM	GCDGPTDRVK	EGHSPPDDVD
IVIKLDNTAS	TVKAIAIVIP	CILALCLLVL	VYTVFQFKRK	GTPRHILYCK
RSMQEWV

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеаз, металопротеаз. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, іоном кальцію. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, позаклітинному матриксі. Також секретований назовні.

Література

Takino T., Sato H., Shinagawa A., Seiki M. (1995). Identification of the second membrane-type matrix metalloproteinase (MT-MMP-2) gene from a human placenta cDNA library. MT-MMPs form a unique membrane-type subclass in the MMP family. J. Biol. Chem. 270: 23013—23020. PMID 7559440 DOI:10.1074/jbc.270.39.23013
Matsumoto S., Katoh M., Saito S., Watanabe T., Masuho Y. (1997). Identification of soluble type of membrane-type matrix metalloproteinase-3 formed by alternatively spliced mRNA. Biochim. Biophys. Acta. 1354: 159—170. PMID 9396633 DOI:10.1016/S0167-4781(97)00120-6
Shofuda K., Yasumitsu H., Nishihashi A., Miki K., Miyazaki K. (1997). Expression of three membrane-type matrix metalloproteinases (MT-MMPs) in rat vascular smooth muscle cells and characterization of MT3-MMPs with and without transmembrane domain. J. Biol. Chem. 272: 9749—9754. PMID 9092507 DOI:10.1074/jbc.272.15.9749
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504