MMP16

MMP16
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1RM8
Ідентифікатори
Символи	MMP16, C8orf57, MMP-X2, MT-MMP2, MT-MMP3, MT3-MMP, matrix metallopeptidase 16
Зовнішні ІД	OMIM: 602262 MGI: 1276107 HomoloGene: 55939 GeneCards: MMP16
Онтологія гена Молекулярна функція • зв'язування з іоном металу • GO:0070122 peptidase activity • GO:0010577 enzyme activator activity • hydrolase activity • metallopeptidase activity • metalloendopeptidase activity • zinc ion binding • metalloaminopeptidase activity Клітинна компонента • integral component of membrane • мембрана • GO:0005578 Позаклітинна матриця • клітинна мембрана • extracellular region • cell surface • Golgi lumen • integral component of plasma membrane • міжклітинний простір Біологічний процес • осифікація • extracellular matrix disassembly • осифікація ендохондральна • craniofacial suture morphogenesis • chondrocyte proliferation • collagen catabolic process • embryonic cranial skeleton morphogenesis • bone development • GO:0048554 positive regulation of catalytic activity • протеоліз • protein processing • GO:0044267 protein metabolic process • skeletal system development • extracellular matrix organization Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	4325	17389
Ensembl	ENSG00000156103	ENSMUSG00000028226
UniProt	P51512	Q9WTR0
RefSeq (мРНК)	NM_005941 NM_022564 NM_032297	NM_019724 NM_001379518 NM_001379519
RefSeq (білок)	NP_005932	NP_062698 NP_001366447 NP_001366448
Локус (UCSC)	Хр. 8: 88.03 – 88.33 Mb	Хр. 4: 17.85 – 18.12 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

MMP16 (англ. Matrix metallopeptidase 16) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 8-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 607 амінокислот, а молекулярна маса — 69 521.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MILLTFSTGR		RLDFVHHSGV		FFLQTLLWIL		CATVCGTEQY		FNVEVWLQKY
GYLPPTDPRM		SVLRSAETMQ		SALAAMQQFY		GINMTGKVDR		NTIDWMKKPR
CGVPDQTRGS		SKFHIRRKRY		ALTGQKWQHK		HITYSIKNVT		PKVGDPETRK
AIRRAFDVWQ		NVTPLTFEEV		PYSELENGKR		DVDITIIFAS		GFHGDSSPFD
GEGGFLAHAY		FPGPGIGGDT		HFDSDEPWTL		GNPNHDGNDL		FLVAVHELGH
ALGLEHSNDP		TAIMAPFYQY		METDNFKLPN		DDLQGIQKIY		GPPDKIPPPT
RPLPTVPPHR		SIPPADPRKN		DRPKPPRPPT		GRPSYPGAKP		NICDGNFNTL
AILRREMFVF		KDQWFWRVRN		NRVMDGYPMQ		ITYFWRGLPP		SIDAVYENSD
GNFVFFKGNK		YWVFKDTTLQ		PGYPHDLITL		GSGIPPHGID		SAIWWEDVGK
TYFFKGDRYW		RYSEEMKTMD		PGYPKPITVW		KGIPESPQGA		FVHKENGFTY
FYKGKEYWKF		NNQILKVEPG		YPRSILKDFM		GCDGPTDRVK		EGHSPPDDVD
IVIKLDNTAS		TVKAIAIVIP		CILALCLLVL		VYTVFQFKRK		GTPRHILYCK
RSMQEWV

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеаз, металопротеаз. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, іоном кальцію. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, позаклітинному матриксі. Також секретований назовні.

Література

• Takino T., Sato H., Shinagawa A., Seiki M. (1995). Identification of the second membrane-type matrix metalloproteinase (MT-MMP-2) gene from a human placenta cDNA library. MT-MMPs form a unique membrane-type subclass in the MMP family. J. Biol. Chem. 270: 23013—23020. PMID 7559440 DOI:10.1074/jbc.270.39.23013
• Matsumoto S., Katoh M., Saito S., Watanabe T., Masuho Y. (1997). Identification of soluble type of membrane-type matrix metalloproteinase-3 formed by alternatively spliced mRNA. Biochim. Biophys. Acta. 1354: 159—170. PMID 9396633 DOI:10.1016/S0167-4781(97)00120-6
• Shofuda K., Yasumitsu H., Nishihashi A., Miki K., Miyazaki K. (1997). Expression of three membrane-type matrix metalloproteinases (MT-MMPs) in rat vascular smooth muscle cells and characterization of MT3-MMPs with and without transmembrane domain. J. Biol. Chem. 272: 9749—9754. PMID 9092507 DOI:10.1074/jbc.272.15.9749
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 8