NUP160

NUP160
Наявні структури PDB Пошук для людей: PDBe RCSB Список кодів PDB 5A9Q
Ідентифікатори
Символи	NUP160, nucleoporin 160, Nup160, 160kDa, 2810011M03Rik, AA414952, AU020188, Gtl-13, Gtl1-13, Gtl13, mKIAA0197, NPHS19
Зовнішні ІД	OMIM: 607614 HomoloGene: 32509 GeneCards: NUP160
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0005487 structural constituent of nuclear pore Клітинна компонента • гіалоплазма • nuclear envelope • ядерна пора • nuclear pore outer ring • клітинне ядро • кінетохор • host cell Біологічний процес • mRNA transport • protein transport • GO:0022415 viral process • mRNA export from nucleus • regulation of glycolytic process • tRNA export from nucleus • protein sumoylation • viral transcription • GO:1905616 regulation of gene silencing by miRNA • nephron development • GO:0046795 intracellular transport of virus • regulation of cellular response to heat Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	23279	311182
Ensembl	ENSG00000030066	ENSRNOG00000028215
UniProt	Q12769	н/д
RefSeq (мРНК)	NM_015231 NM_001318399	NM_001107744
RefSeq (білок)	NP_001305328 NP_056046	н/д
Локус (UCSC)	Хр. 11: 47.78 – 47.85 Mb	н/д
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

NUP160 (англ. Nucleoporin 160) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 436 амінокислот, а молекулярна маса — 162 121.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MLHLSAAPPA		PPPEVTATAR		PCLCSVGRRG		DGGKMAAAGA		LERSFVELSG
AERERPRHFR		EFTVCSIGTA		NAVAGAVKYS		ESAGGFYYVE		SGKLFSVTRN
RFIHWKTSGD		TLELMEESLD		INLLNNAIRL		KFQNCSVLPG		GVYVSETQNR
VIILMLTNQT		VHRLLLPHPS		RMYRSELVVD		SQMQSIFTDI		GKVDFTDPCN
YQLIPAVPGI		SPNSTASTAW		LSSDGEALFA		LPCASGGIFV		LKLPPYDIPG
MVSVVELKQS		SVMQRLLTGW		MPTAIRGDQS		PSDRPLSLAV		HCVEHDAFIF
ALCQDHKLRM		WSYKEQMCLM		VADMLEYVPV		KKDLRLTAGT		GHKLRLAYSP
TMGLYLGIYM		HAPKRGQFCI		FQLVSTESNR		YSLDHISSLF		TSQETLIDFA
LTSTDIWALW		HDAENQTVVK		YINFEHNVAG		QWNPVFMQPL		PEEEIVIRDD
QDPREMYLQS		LFTPGQFTNE		ALCKALQIFC		RGTERNLDLS		WSELKKEVTL
AVENELQGSV		TEYEFSQEEF		RNLQQEFWCK		FYACCLQYQE		ALSHPLALHL
NPHTNMVCLL		KKGYLSFLIP		SSLVDHLYLL		PYENLLTEDE		TTISDDVDIA
RDVICLIKCL		RLIEESVTVD		MSVIMEMSCY		NLQSPEKAAE		QILEDMITID
VENVMEDICS		KLQEIRNPIH		AIGLLIREMD		YETEVEMEKG		FNPAQPLNIR
MNLTQLYGSN		TAGYIVCRGV		HKIASTRFLI		CRDLLILQQL		LMRLGDAVIW
GTGQLFQAQQ		DLLHRTAPLL		LSYYLIKWGS		ECLATDVPLD		TLESNLQHLS
VLELTDSGAL		MANRFVSSPQ		TIVELFFQEV		ARKHIISHLF		SQPKAPLSQT
GLNWPEMITA		ITSYLLQLLW		PSNPGCLFLE		CLMGNCQYVQ		LQDYIQLLHP
WCQVNVGSCR		FMLGRCYLVT		GEGQKALECF		CQAASEVGKE		EFLDRLIRSE
DGEIVSTPRL		QYYDKVLRLL		DVIGLPELVI		QLATSAITEA		GDDWKSQATL
RTCIFKHHLD		LGHNSQAYEA		LTQIPDSSRQ		LDCLRQLVVV		LCERSQLQDL
VEFPYVNLHN		EVVGIIESRA		RAVDLMTHNY		YELLYAFHIY		RHNYRKAGTV
MFEYGMRLGR		EVRTLRGLEK		QGNCYLAALN		CLRLIRPEYA		WIVQPVSGAV
YDRPGASPKR		NHDGECTAAP		TNRQIEILEL		EDLEKECSLA		RIRLTLAQHD
PSAVAVAGSS		SAEEMVTLLV		QAGLFDTAIS		LCQTFKLPLT		PVFEGLAFKC
IKLQFGGEAA		QAEAWAWLAA		NQLSSVITTK		ESSATDEAWR		LLSTYLERYK
VQNNLYHHCV		INKLLSHGVP		LPNWLINSYK		KVDAAELLRL		YLNYDLLEEA
VDLVSEYVDA		VLGKGHQYFG		IEFPLSATAP		MVWLPYSSID		QLLQALGENS
ANSHNIALSQ		KILDKLEDYQ		QKVDKATRDL		LYRRTL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт, транспорт білків, транспорт мРНК, транслокація, альтернативний сплайсинг. Локалізований у ядрі, комплексі ядерної пори.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Nagase T., Seki N., Ishikawa K., Tanaka A., Nomura N. (1996). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. V. The coding sequences of 40 new genes (KIAA0161-KIAA0200) deduced by analysis of cDNA clones from human cell line KG-1. DNA Res. 3: 17—24. PMID 8724849 DOI:10.1093/dnares/3.1.17

Див. також

• Хромосома 11