NUP214

NUP214
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2OIT, 3FHC, 3FMO, 3FMP, 5DIS
Ідентифікатори
Символи	NUP214, CAIN, CAN, D9S46E, N214, p250, nucleoporin 214kDa, nucleoporin 214, IIAE9
Зовнішні ІД	OMIM: 114350 MGI: 1095411 HomoloGene: 38008 GeneCards: NUP214
Реагує на сполуку
Viroporin 3a
Онтологія гена Молекулярна функція • nuclear export signal receptor activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • nuclear localization sequence binding • GO:0005487 structural constituent of nuclear pore Клітинна компонента • гіалоплазма • внутрішньоклітинна мембранна органела • focal adhesion • нуклеоплазма • клітинне ядро • cytoplasmic side of nuclear pore • nuclear pore nuclear basket • nuclear pore central transport channel • ядерна пора • nuclear envelope • host cell Біологічний процес • mRNA transport • regulation of mRNA stability • regulation of cell cycle • protein export from nucleus • protein transport • GO:0022415 viral process • protein import into nucleus • RNA export from nucleus • mRNA export from nucleus • regulation of nucleocytoplasmic transport • GO:0007067 мітоз • regulation of glycolytic process • tRNA export from nucleus • protein sumoylation • viral transcription • GO:1905616 regulation of gene silencing by miRNA • GO:0046795 intracellular transport of virus • regulation of cellular response to heat Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	8021	227720
Ensembl	ENSG00000126883	ENSMUSG00000001855
UniProt	P35658	Q80U93
RefSeq (мРНК)	NM_005085 NM_001318324 NM_001318325	NM_172268
RefSeq (білок)	NP_001305253 NP_001305254 NP_005076	NP_758472 NP_001395026
Локус (UCSC)	Хр. 9: 131.13 – 131.23 Mb	Хр. 2: 31.86 – 31.94 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

NUP214 (англ. Nucleoporin 214) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 9-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 2 090 амінокислот, а молекулярна маса — 213 620.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MGDEMDAMIP		EREMKDFQFR		ALKKVRIFDS		PEELPKERSS		LLAVSNKYGL
VFAGGASGLQ		IFPTKNLLIQ		NKPGDDPNKI		VDKVQGLLVP		MKFPIHHLAL
SCDNLTLSAC		MMSSEYGSII		AFFDVRTFSN		EAKQQKRPFA		YHKLLKDAGG
MVIDMKWNPT		VPSMVAVCLA		DGSIAVLQVT		ETVKVCATLP		STVAVTSVCW
SPKGKQLAVG		KQNGTVVQYL		PTLQEKKVIP		CPPFYESDHP		VRVLDVLWIG
TYVFAIVYAA		ADGTLETSPD		VVMALLPKKE		EKHPEIFVNF		MEPCYGSCTE
RQHHYYLSYI		EEWDLVLAAS		AASTEVSILA		RQSDQINWES		WLLEDSSRAE
LPVTDKSDDS		LPMGVVVDYT		NQVEITISDE		KTLPPAPVLM		LLSTDGVLCP
FYMINQNPGV		KSLIKTPERL		SLEGERQPKS		PGSTPTTPTS		SQAPQKLDAS
AAAAPASLPP		SSPAAPIATF		SLLPAGGAPT		VFSFGSSSLK		SSATVTGEPP
SYSSGSDSSK		AAPGPGPSTF		SFVPPSKASL		APTPAASPVA		PSAASFSFGS
SGFKPTLEST		PVPSVSAPNI		AMKPSFPPST		SAVKVNLSEK		FTAAATSTPV
SSSQSAPPMS		PFSSASKPAA		SGPLSHPTPL		SAPPSSVPLK		SSVLPSPSGR
SAQGSSSPVP		SMVQKSPRIT		PPAAKPGSPQ		AKSLQPAVAE		KQGHQWKDSD
PVMAGIGEEI		AHFQKELEEL		KARTSKACFQ		VGTSEEMKML		RTESDDLHTF
LLEIKETTES		LHGDISSLKT		TLLEGFAGVE		EAREQNERNR		DSGYLHLLYK
RPLDPKSEAQ		LQEIRRLHQY		VKFAVQDVND		VLDLEWDQHL		EQKKKQRHLL
VPERETLFNT		LANNREIINQ		QRKRLNHLVD		SLQQLRLYKQ		TSLWSLSSAV
PSQSSIHSFD		SDLESLCNAL		LKTTIESHTK		SLPKVPAKLS		PMKQAQLRNF
LAKRKTPPVR		STAPASLSRS		AFLSQRYYED		LDEVSSTSSV		SQSLESEDAR
TSCKDDEAVV		QAPRHAPVVR		TPSIQPSLLP		HAAPFAKSHL		VHGSSPGVMG
TSVATSASKI		IPQGADSTML		ATKTVKHGAP		SPSHPISAPQ		AAAAAALRRQ
MASQAPAVNT		LTESTLKNVP		QVVNVQELKN		NPATPSTAMG		SSVPYSTAKT
PHPVLTPVAA		NQAKQGSLIN		SLKPSGPTPA		SGQLSSGDKA		SGTAKIETAV
TSTPSASGQF		SKPFSFSPSG		TGFNFGIITP		TPSSNFTAAQ		GATPSTKESS
QPDAFSSGGG		SKPSYEAIPE		SSPPSGITSA		SNTTPGEPAA		SSSRPVAPSG
TALSTTSSKL		ETPPSKLGEL		LFPSSLAGET		LGSFSGLRVG		QADDSTKPTN
KASSTSLTST		QPTKTSGVPS		GFNFTAPPVL		GKHTEPPVTS		SATTTSVAPP
AATSTSSTAV		FGSLPVTSAG		SSGVISFGGT		SLSAGKTSFS		FGSQQTNSTV
PPSAPPPTTA		ATPLPTSFPT		LSFGSLLSSA		TTPSLPMSAG		RSTEEATSSA
LPEKPGDSEV		SASAASLLEE		QQSAQLPQAP		PQTSDSVKKE		PVLAQPAVSN
SGTAASSTSL		VALSAEATPA		TTGVPDARTE		AVPPASSFSV		PGQTAVTAAA
ISSAGPVAVE		TSSTPIASST		TSIVAPGPSA		EAAAFGTVTS		GSSVFAQPPA
ASSSSAFNQL		TNNTATAPSA		TPVFGQVAAS		TAPSLFGQQT		GSTASTAAAT
PQVSSSGFSS		PAFGTTAPGV		FGQTTFGQAS		VFGQSASSAA		SVFSFSQPGF
SSVPAFGQPA		SSTPTSTSGS		VFGAASSTSS		SSSFSFGQSS		PNTGGGLFGQ
SNAPAFGQSP		GFGQGGSVFG		GTSAATTTAA		TSGFSFCQAS		GFGSSNTGSV
FGQAASTGGI		VFGQQSSSSS		GSVFGSGNTG		RGGGFFSGLG		GKPSQDAANK
NPFSSASGGF		GSTATSNTSN		LFGNSGAKTF		GGFASSSFGE		QKPTGTFSSG
GGSVASQGFG		FSSPNKTGGF		GAAPVFGSPP		TFGGSPGFGG		VPAFGSAPAF
TSPLGSTGGK		VFGEGTAAAS		AGGFGFGSSS		NTTSFGTLAS		QNAPTFGSLS
QQTSGFGTQS		SGFSGFGSGT		GGFSFGSNNS		SVQGFGGWRS

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт, транспорт білків, транспорт мРНК, транслокація, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Локалізований у ядрі, комплексі ядерної пори.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Kraemer D., Wozniak R.W., Blobel G., Radu A. (1994). The human CAN protein, a putative oncogene product associated with myeloid leukemogenesis, is a nuclear pore complex protein that faces the cytoplasm. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 91: 1519—1523. PMID 8108440 DOI:10.1073/pnas.91.4.1519
• Brownawell A.M., Macara I.G. (2002). Exportin-5, a novel karyopherin, mediates nuclear export of double-stranded RNA binding proteins. J. Cell Biol. 156: 53—64. PMID 11777942 DOI:10.1083/jcb.200110082
• Carman J.A., Nadler S.G. (2004). Direct association of tristetraprolin with the nucleoporin CAN/Nup214. Biochem. Biophys. Res. Commun. 315: 445—449. PMID 14766228 DOI:10.1016/j.bbrc.2004.01.080
• Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 DOI:10.1038/nbt1240
• Pasdeloup D., Blondel D., Isidro A.L., Rixon F.J. (2009). Herpesvirus capsid association with the nuclear pore complex and viral DNA release involve the nucleoporin CAN/Nup214 and the capsid protein pUL25. J. Virol. 83: 6610—6623. PMID 19386703 DOI:10.1128/JVI.02655-08

Див. також

• Хромосома 9