PAXX

PAXX
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 3WTD, 3WTF, 4WJA
Ідентифікатори
Символи	PAXX, C9orf142, chromosome 9 open reading frame 142, XLS, non-homologous end joining factor, PAXX non-homologous end joining factor
Зовнішні ІД	OMIM: 616315 MGI: 2442831 HomoloGene: 17788 GeneCards: PAXX
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0032947 molecular adaptor activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • protein homodimerization activity • identical protein binding Клітинна компонента • site of double-strand break • Ku70:Ku80 complex • nonhomologous end joining complex • клітинне ядро Біологічний процес • DNA ligation involved in DNA repair • double-strand break repair via nonhomologous end joining • GO:0100026 Репарація ДНК • cellular response to DNA damage stimulus Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	286257	227622
Ensembl	ENSG00000148362	ENSMUSG00000047617
UniProt	Q9BUH6	Q8K0Y7
RefSeq (мРНК)	NM_001329678 NM_183241	NM_153557
RefSeq (білок)	NP_001316607 NP_899064	NP_705785
Локус (UCSC)	Хр. 9: 136.99 – 136.99 Mb	Хр. 2: 25.35 – 25.35 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

PAXX (англ. PAXX, non-homologous end joining factor) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 9-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 204 амінокислот, а молекулярна маса — 21 640.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MDPLSPPLCT		LPPGPEPPRF		VCYCEGEESG		EGDRGGFNLY		VTDAAELWST
CFTPDSLAAL		KARFGLSAAE		DITPRFRAAC		EQQAVALTLQ		EDRASLTLSG
GPSALAFDLS		KVPGPEAAPR		LRALTLGLAK		RVWSLERRLA		AAEETAVSPR
KSPRPAGPQL		FLPDPDPQRG		GPGPGVRRRC		PGESLINPGF		KSKKPAGGVD
FDET

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як пошкодження ДНК, репарація ДНК, альтернативний сплайсинг. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
• Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 doi:10.1038/nbt1240

Див. також

• Хромосома 9