PMPCA

PMPCA
Ідентифікатори
Символи	PMPCA, Alpha-MPP, INPP5E, P-55, SCAR2, peptidase, mitochondrial processing alpha subunit, CLA1, CPD3, peptidase, mitochondrial processing subunit alpha, MAS2
Зовнішні ІД	OMIM: 613036 MGI: 1918568 HomoloGene: 6078 GeneCards: PMPCA
Пов'язані генетичні захворювання
autosomal recessive spinocerebellar ataxia 2
Реагує на сполуку
Viroporin 3a
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0070122 peptidase activity • hydrolase activity • metallopeptidase activity • metalloendopeptidase activity • zinc ion binding • зв'язування з іоном металу • каталітична активність • endopeptidase activity Клітинна компонента • мітохондріальний матрикс • мітохондрія • мембрана • мітохондріальна внутрішня мембрана • міжклітинний простір • mitochondrial processing peptidase complex Біологічний процес • протеоліз • protein processing involved in protein targeting to mitochondrion • mitochondrial calcium ion transmembrane transport Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	23203	66865
Ensembl	ENSG00000165688	ENSMUSG00000026926
UniProt	Q10713 Q5SXN9	Q9DC61
RefSeq (мРНК)	NM_001282944 NM_001282946 NM_015160	NM_173180
RefSeq (білок)	NP_001269873 NP_001269875 NP_055975	NP_775272
Локус (UCSC)	Хр. 9: 136.41 – 136.42 Mb	Хр. 2: 26.28 – 26.29 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

PMPCA (англ. Peptidase, mitochondrial processing alpha subunit) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 9-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 525 амінокислот, а молекулярна маса — 58 253.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAAVVLAATR		LLRGSGSWGC		SRLRFGPPAY		RRFSSGGAYP		NIPLSSPLPG
VPKPVFATVD		GQEKFETKVT		TLDNGLRVAS		QNKFGQFCTV		GILINSGSRY
EAKYLSGIAH		FLEKLAFSST		ARFDSKDEIL		LTLEKHGGIC		DCQTSRDTTM
YAVSADSKGL		DTVVALLADV		VLQPRLTDEE		VEMTRMAVQF		ELEDLNLRPD
PEPLLTEMIH		EAAYRENTVG		LHRFCPTENV		AKINREVLHS		YLRNYYTPDR
MVLAGVGVEH		EHLVDCARKY		LLGVQPAWGS		AEAVDIDRSV		AQYTGGIAKL
ERDMSNVSLG		PTPIPELTHI		MVGLESCSFL		EEDFIPFAVL		NMMMGGGGSF
SAGGPGKGMF		SRLYLNVLNR		HHWMYNATSY		HHSYEDTGLL		CIHASADPRQ
VREMVEIITK		EFILMGGTVD		TVELERAKTQ		LTSMLMMNLE		SRPVIFEDVG
RQVLATRSRK		LPHELCTLIR		NVKPEDVKRV		ASKMLRGKPA		VAALGDLTDL
PTYEHIQTAL		SSKDGRLPRT		YRLFR

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеаз, металопротеаз. Задіяний у таких біологічних процесах, як ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Локалізований у мембрані, мітохондрії, внутрішній мембрані мітохондрії.

Література

• Nagase T., Seki N., Tanaka A., Ishikawa K., Nomura N. (1995). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. IV. The coding sequences of 40 new genes (KIAA0121-KIAA0160) deduced by analysis of cDNA clones from human cell line KG-1. DNA Res. 2: 167—174. PMID 8590280 DOI:10.1093/dnares/2.4.167
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 9