PTPDC1

PTPDC1
Ідентифікатори
Символи	PTPDC1, PTP9Q22, protein tyrosine phosphatase domain containing 1
Зовнішні ІД	MGI: 2145430 HomoloGene: 17576 GeneCards: PTPDC1
Онтологія гена Молекулярна функція • protein tyrosine phosphatase activity • GO:0098519, GO:0098518 phosphatase activity • phosphoprotein phosphatase activity • hydrolase activity • protein tyrosine/serine/threonine phosphatase activity Клітинна компонента • цитоплазма • клітинне ядро • нуклеоплазма Біологічний процес • cilium assembly • GO:0016576 protein dephosphorylation • cell projection organization • GO:0098501, GO:0098502, GO:0006286 дефосфорилювання • peptidyl-tyrosine dephosphorylation Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	138639	218232
Ensembl	ENSG00000158079	ENSMUSG00000038042
UniProt	A2A3K4	Q6NZK8
RefSeq (мРНК)	NM_001253829 NM_001253830 NM_152422 NM_177995	NM_001301781 NM_207232 NM_001374755
RefSeq (білок)	NP_001240758 NP_001240759 NP_689635 NP_818931	NP_001288710 NP_997115 NP_001361684
Локус (UCSC)	Хр. 9: 94.03 – 94.11 Mb	Хр. 13: 48.73 – 48.78 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

PTPDC1 (англ. Protein tyrosine phosphatase domain containing 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 9-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 754 амінокислот, а молекулярна маса — 84 457.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAAGVLPQNE		QPYSTLVNNS		ECVANMKGNL		ERPTPKYTKV		GERLRHVIPG
HMACSMACGG		RACKYENPAR		WSEQEQAIKG		VYSSWVTDNI		LAMARPSSEL
LEKYHIIDQF		LSHGIKTIIN		LQRPGEHASC		GNPLEQESGF		TYLPEAFMEA
GIYFYNFGWK		DYGVASLTTI		LDMVKVMTFA		LQEGKVAIHC		HAGLGRTGVL
IACYLVFATR		MTADQAIIFV		RAKRPNSIQT		RGQLLCVREF		TQFLTPLRNI
FSCCDPKAHA		VTLPQYLIRQ		RHLLHGYEAR		LLKHVPKIIH		LVCKLLLDLA
ENRPVMMKDV		SEGPGLSAEI		EKTMSEMVTM		QLDKELLRHD		SDVSNPPNPT
AVAADFDNRG		MIFSNEQQFD		PLWKRRNVEC		LQPLTHLKRR		LSYSDSDLKR
AENLLEQGET		PQTVPAQILV		GHKPRQQKLI		SHCYIPQSPE		PDLHKEALVR
STLSFWSQSK		FGGLEGLKDN		GSPIFHGRII		PKEAQQSGAF		SADVSGSHSP
GEPVSPSFAN		VHKDPNPAHQ		QVSHCQCKTH		GVGSPGSVRQ		NSRTPRSPLD
CGSSPKAQFL		VEHETQDSKD		LSEAASHSAL		QSELSAEARR		ILAAKALANL
NESVEKEELK		RKVEMWQKEL		NSRDGAWERI		CGERDPFILC		SLMWSWVEQL
KEPVITKEDV		DMLVDRRADA		AEALFLLEKG		QHQTILCVLH		CIVNLQTIPV
DVEEAFLAHA		IKAFTKVNFD		SENGPTVYNT		LKKIFKHTLE		EKRKMTKDGP
KPGL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеїн-фосфатаз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як біогенез та деградація війок, альтернативний сплайсинг.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 9