PTPN5

PTPN5
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2BIJ, 2BV5, 2CJZ
Ідентифікатори
Символи	PTPN5, PTPSTEP, STEP, STEP61, protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 5, protein tyrosine phosphatase non-receptor type 5
Зовнішні ІД	OMIM: 176879 MGI: 97807 HomoloGene: 8423 GeneCards: PTPN5
Онтологія гена Молекулярна функція • phosphoprotein phosphatase activity • GO:0098519, GO:0098518 phosphatase activity • phosphotyrosine residue binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • protein tyrosine phosphatase activity • hydrolase activity Клітинна компонента • integral component of membrane • endoplasmic reticulum membrane • мембрана • ендоплазматичний ретикулум • нуклеоплазма Біологічний процес • GO:0016576 protein dephosphorylation • peptidyl-tyrosine dephosphorylation • GO:0098501, GO:0098502, GO:0006286 дефосфорилювання • cellular response to cytokine stimulus Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	84867	19259
Ensembl	ENSG00000110786	ENSMUSG00000030854
UniProt	P54829	P54830
RefSeq (мРНК)	NM_001039970 NM_001278236 NM_001278238 NM_001278239 NM_006906 NM_032781	NM_001163565 NM_013643
RefSeq (білок)	NP_001035059 NP_001265165 NP_001265167 NP_001265168 NP_008837 NP_116170	NP_001157037 NP_038671
Локус (UCSC)	Хр. 11: 18.73 – 18.79 Mb	Хр. 7: 46.73 – 46.78 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

PTPN5 (англ. Protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 5) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 565 амінокислот, а молекулярна маса — 63 538.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MNYEGARSER		ENHAADDSEG		GALDMCCSER		LPGLPQPIVM		EALDEAEGLQ
DSQREMPPPP		PPSPPSDPAQ		KPPPRGAGSH		SLTVRSSLCL		FAASQFLLAC
GVLWFSGYGH		IWSQNATNLV		SSLLTLLKQL		EPTAWLDSGT		WGVPSLLLVF
LSVGLVLVTT		LVWHLLRTPP		EPPTPLPPED		RRQSVSRQPS		FTYSEWMEEK
IEDDFLDLDP		VPETPVFDCV		MDIKPEADPT		SLTVKSMGLQ		ERRGSNVSLT
LDMCTPGCNE		EGFGYLMSPR		EESAREYLLS		ASRVLQAEEL		HEKALDPFLL
QAEFFEIPMN		FVDPKEYDIP		GLVRKNRYKT		ILPNPHSRVC		LTSPDPDDPL
SSYINANYIR		GYGGEEKVYI		ATQGPIVSTV		ADFWRMVWQE		HTPIIVMITN
IEEMNEKCTE		YWPEEQVAYD		GVEITVQKVI		HTEDYRLRLI		SLKSGTEERG
LKHYWFTSWP		DQKTPDRAPP		LLHLVREVEE		AAQQEGPHCA		PIIVHCSAGI
GRTGCFIATS		ICCQQLRQEG		VVDILKTTCQ		LRQDRGGMIQ		TCEQYQFVHH
VMSLYEKQLS		HQSPE

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеїн-фосфатаз, фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Локалізований у мембрані, ендоплазматичному ретикулумі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
• Li X., Luna J., Lombroso P.J., Francke U. (1995). Molecular cloning of the human homolog of a striatum-enriched phosphatase (STEP) gene and chromosomal mapping of the human and murine loci. Genomics. 28: 442—449. PMID 7490079 doi:10.1006/geno.1995.1173
• Mukherjee S., Poddar R., Deb I., Paul S. (2011). Dephosphorylation of specific sites in the kinase-specificity sequence domain leads to ubiquitin-mediated degradation of the tyrosine phosphatase STEP. Biochem. J. 440: 115—125. PMID 21777200 doi:10.1042/BJ20110240

Див. також

• Хромосома 11