PTPRD

PTPRD
Наявні структури PDB Пошук для людей: PDBe RCSB Список кодів PDB 1X5Z, 2DLH, 2YD6, 2YD7, 4RCA
Ідентифікатори
Символи	PTPRD, HPTP, HPTPD, HPTPDELTA, PTPD, RPTPDELTA, protein tyrosine phosphatase, receptor type D, protein tyrosine phosphatase receptor type D, R-PTP-delta
Зовнішні ІД	OMIM: 601598 HomoloGene: 88669 GeneCards: PTPRD
Пов'язані генетичні захворювання
епілепсія, ожиріння, короткозорість, синдром неспокійних ніг, цукровий діабет 2-го типу, focal epilepsy
Онтологія гена Молекулярна функція • transmembrane receptor protein tyrosine phosphatase activity • phosphoprotein phosphatase activity • protein tyrosine phosphatase activity • hydrolase activity • signaling receptor binding • cell adhesion molecule binding • GO:0098519, GO:0098518 phosphatase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding Клітинна компонента • екзосома • мембрана • integral component of membrane • integral component of plasma membrane • клітинна мембрана • glutamatergic synapse Біологічний процес • presynaptic membrane assembly • transmembrane receptor protein tyrosine phosphatase signaling pathway • neuron differentiation • positive regulation of dendrite morphogenesis • GO:0016576 protein dephosphorylation • phosphate-containing compound metabolic process • heterophilic cell-cell adhesion via plasma membrane cell adhesion molecules • GO:0098501, GO:0098502, GO:0006286 дефосфорилювання • peptidyl-tyrosine dephosphorylation • positive regulation of synapse assembly • regulation of postsynaptic density assembly • trans-synaptic signaling by trans-synaptic complex • synaptic membrane adhesion • regulation of presynapse assembly Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	5789	313278
Ensembl	ENSG00000153707 ENSG00000282932	ENSRNOG00000005711
UniProt	P23468 Q3KPI9	н/д
RefSeq (мРНК)	NM_001040712 NM_001171025 NM_002839 NM_130391 NM_130392 NM_130393 NM_001377946 NM_001377947 NM_001377958 NM_001378058	XM_001067936 XM_003754043 XM_006225346 XM_006225347 XM_006225348 XM_006225349 XM_006225350 XM_006225351 XM_006225352 XM_006225353 XM_006225354 XM_006225356 XM_006225357 XM_006225358 XM_006225359 XM_006225360 XM_006225362 XM_006225363 XM_006225366 XM_006225370 XM_006225371 XM_006225372 XM_006225373 XM_006225375 XM_006225376 XM_006225377 XM_006225378 XM_006225379 XM_006225380 XM_008763819 XM_008763820 XM_008763821 XM_008763822 XM_008763823 XM_008763824 XM_008763825 XM_008763826 XM_008763827 XM_008763828 XM_008763829 XM_008763830 XM_008763831 XM_017593938 XM_017593939 XM_017593940 XM_017593941 XM_017593942 XM_017593943 XM_017593944 XM_017593945 XM_017593946 XM_017593947 XM_017593948 XM_017593949 XM_017593950 XM_017593951 XM_017593952 XM_017593953 XM_017593954 XM_017593955 XM_017593956 XM_017593957 XM_017602893 XM_017602894 XM_017602895 XM_017602896
RefSeq (білок)	NP_001035802 NP_001164496 NP_002830 NP_569075 NP_569076 NP_569077 NP_001364875 NP_001364876 NP_001364887 NP_001364987 NP_569077.2	н/д
Локус (UCSC)	Хр. 9: 8.31 – 10.61 Mb	н/д
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

PTPRD (англ. Protein tyrosine phosphatase, receptor type D) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 9-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 912 амінокислот, а молекулярна маса — 214 760.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MVHVARLLLL		LLTFFLRTDA		ETPPRFTRTP		VDQTGVSGGV		ASFICQATGD
PRPKIVWNKK		GKKVSNQRFE		VIEFDDGSGS		VLRIQPLRTP		RDEAIYECVA
SNNVGEISVS		TRLTVLREDQ		IPRGFPTIDM		GPQLKVVERT		RTATMLCAAS
GNPDPEITWF		KDFLPVDTSN		NNGRIKQLRS		ESIGGTPIRG		ALQIEQSEES
DQGKYECVAT		NSAGTRYSAP		ANLYVRELRE		VRRVPPRFSI		PPTNHEIMPG
GSVNITCVAV		GSPMPYVKWM		LGAEDLTPED		DMPIGRNVLE		LNDVRQSANY
TCVAMSTLGV		IEAIAQITVK		ALPKPPGTPV		VTESTATSIT		LTWDSGNPEP
VSYYIIQHKP		KNSEELYKEI		DGVATTRYSV		AGLSPYSDYE		FRVVAVNNIG
RGPPSEPVLT		QTSEQAPSSA		PRDVQARMLS		STTILVQWKE		PEEPNGQIQG
YRVYYTMDPT		QHVNNWMKHN		VADSQITTIG		NLVPQKTYSV		KVLAFTSIGD
GPLSSDIQVI		TQTGVPGQPL		NFKAEPESET		SILLSWTPPR		SDTIANYELV
YKDGEHGEEQ		RITIEPGTSY		RLQGLKPNSL		YYFRLAARSP		QGLGASTAEI
SARTMQSKPS		APPQDISCTS		PSSTSILVSW		QPPPVEKQNG		IITEYSIKYT
AVDGEDDKPH		EILGIPSDTT		KYLLEQLEKW		TEYRITVTAH		TDVGPGPESL
SVLIRTNEDV		PSGPPRKVEV		EAVNSTSVKV		SWRSPVPNKQ		HGQIRGYQVH
YVRMENGEPK		GQPMLKDVML		ADAQWEFDDT		TEHDMIISGL		QPETSYSLTV
TAYTTKGDGA		RSKPKLVSTT		GAVPGKPRLV		INHTQMNTAL		IQWHPPVDTF
GPLQGYRLKF		GRKDMEPLTT		LEFSEKEDHF		TATDIHKGAS		YVFRLSARNK
VGFGEEMVKE		ISIPEEVPTG		FPQNLHSEGT		TSTSVQLSWQ		PPVLAERNGI
ITKYTLLYRD		INIPLLPMEQ		LIVPADTTMT		LTGLKPDTTY		DVKVRAHTSK
GPGPYSPSVQ		FRTLPVDQVF		AKNFHVKAVM		KTSVLLSWEI		PENYNSAMPF
KILYDDGKMV		EEVDGRATQK		LIVNLKPEKS		YSFVLTNRGN		SAGGLQHRVT
AKTAPDVLRT		KPAFIGKTNL		DGMITVQLPE		VPANENIKGY		YIIIVPLKKS
RGKFIKPWES		PDEMELDELL		KEISRKRRSI		RYGREVELKP		YIAAHFDVLP
TEFTLGDDKH		YGGFTNKQLQ		SGQEYVFFVL		AVMEHAESKM		YATSPYSDPV
VSMDLDPQPI		TDEEEGLIWV		VGPVLAVVFI		ICIVIAILLY		KRKRAESDSR
KSSIPNNKEI		PSHHPTDPVE		LRRLNFQTPG		MASHPPIPIL		ELADHIERLK
ANDNLKFSQE		YESIDPGQQF		TWEHSNLEVN		KPKNRYANVI		AYDHSRVLLS
AIEGIPGSDY		VNANYIDGYR		KQNAYIATQG		SLPETFGDFW		RMIWEQRSAT
VVMMTKLEER		SRVKCDQYWP		SRGTETHGLV		QVTLLDTVEL		ATYCVRTFAL
YKNGSSEKRE		VRQFQFTAWP		DHGVPEHPTP		FLAFLRRVKT		CNPPDAGPMV
VHCSAGVGRT		GCFIVIDAML		ERIKHEKTVD		IYGHVTLMRA		QRNYMVQTED
QYIFIHDALL		EAVTCGNTEV		PARNLYAYIQ		KLTQIETGEN		VTGMELEFKR
LASSKAHTSR		FISANLPCNK		FKNRLVNIMP		YESTRVCLQP		IRGVEGSDYI
NASFIDGYRQ		QKAYIATQGP		LAETTEDFWR		MLWEHNSTIV		VMLTKLREMG
REKCHQYWPA		ERSARYQYFV		VDPMAEYNMP		QYILREFKVT		DARDGQSRTV
RQFQFTDWPE		QGVPKSGEGF		IDFIGQVHKT		KEQFGQDGPI		SVHCSAGVGR
TGVFITLSIV		LERMRYEGVV		DIFQTVKMLR		TQRPAMVQTE		DQYQFSYRAA
LEYLGSFDHY		AT

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, рецепторів, протеїн-фосфатаз. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Локалізований у мембрані.

Література

• Pulido R., Krueger N.X., Serra-Pages C., Saito H., Streuli M. (1995). Molecular characterization of the human transmembrane protein-tyrosine phosphatase delta. Evidence for tissue-specific expression of alternative human transmembrane protein-tyrosine phosphatase delta isoforms. J. Biol. Chem. 270: 6722—6728. PMID 7896816 DOI:10.1074/jbc.270.12.6722
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Serra-Pages C., Medley Q.G., Tang M., Hart A., Streuli M. (1998). Liprins, a family of LAR transmembrane protein-tyrosine phosphatase-interacting proteins. J. Biol. Chem. 273: 15611—15620. PMID 9624153 DOI:10.1074/jbc.273.25.15611
• Hillman R.T., Green R.E., Brenner S.E. (2004). An unappreciated role for RNA surveillance. Genome Biol. 5: R8.1—R8.16. PMID 14759258 DOI:10.1186/gb-2004-5-2-r8
• Krueger N.X., Streuli M., Saito H. (1990). Structural diversity and evolution of human receptor-like protein tyrosine phosphatases. EMBO J. 9: 3241—3252. PMID 2170109

Див. також

• Хромосома 9