RAB1B

RAB1B
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 3JZA, 3NKV, 4HLQ, 4I1O
Ідентифікатори
Символи	RAB1B, member RAS oncogene family
Зовнішні ІД	OMIM: 612565 MGI: 1923558 HomoloGene: 128838 GeneCards: RAB1B
Онтологія гена Молекулярна функція • nucleotide binding • GTP binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0006184 GTPase activity Клітинна компонента • цитоплазма • phagophore assembly site membrane • комплекс Ґольджі • мембрана • Golgi membrane • transport vesicle • мітохондрія • екзосома • endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment membrane • endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment • endoplasmic reticulum membrane • гіалоплазма • perinuclear region of cytoplasm Біологічний процес • establishment of endothelial intestinal barrier • positive regulation of glycoprotein metabolic process • автофагія • regulation of autophagosome assembly • endoplasmic reticulum to Golgi vesicle-mediated transport • COPII vesicle coating • protein transport • retrograde vesicle-mediated transport, Golgi to endoplasmic reticulum • посттрансляційна модифікація • GO:0015915 транспорт • intracellular protein transport • Rab protein signal transduction Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	81876	76308
Ensembl	ENSG00000174903	ENSMUSG00000024870
UniProt	Q9H0U4	Q9D1G1
RefSeq (мРНК)	NM_030981	NM_029576
RefSeq (білок)	NP_112243	NP_083852
Локус (UCSC)	Хр. 11: 66.27 – 66.28 Mb	Хр. 19: 5.15 – 5.16 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

RAB1B (англ. RAB1B, member RAS oncogene family) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 201 амінокислот, а молекулярна маса — 22 171.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MNPEYDYLFK		LLLIGDSGVG		KSCLLLRFAD		DTYTESYIST		IGVDFKIRTI
ELDGKTIKLQ		IWDTAGQERF		RTITSSYYRG		AHGIIVVYDV		TDQESYANVK
QWLQEIDRYA		SENVNKLLVG		NKSDLTTKKV		VDNTTAKEFA		DSLGIPFLET
SAKNATNVEQ		AFMTMAAEIK		KRMGPGAASG		GERPNLKIDS		TPVKPAGGGC
C

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах як транспорт, транспорт білків, автофагія. Білок має сайт для зв'язування з нуклеотидами, ГТФ. Локалізований у цитоплазмі, мембрані.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Wilson A.L., Sheridan K.M., Erdman R.A., Maltese W.A. (1996). Prenylation of a Rab1B mutant with altered GTPase activity is impaired in cell-free systems but not in intact mammalian cells. Biochem. J. 318: 1007—1014. PMID 8836150 DOI:10.1042/bj3181007
• Overmeyer J.H., Wilson A.L., Erdman R.A., Maltese W.A. (1998). The putative 'switch 2' domain of the Ras-related GTPase, Rab1B, plays an essential role in the interaction with Rab escort protein. Mol. Biol. Cell. 9: 223—235. PMID 9437002 DOI:10.1091/mbc.9.1.223
• Overmeyer J.H., Wilson A.L., Maltese W.A. (2001). Membrane targeting of a Rab GTPase that fails to associate with Rab escort protein (REP) or guanine nucleotide dissociation inhibitor (GDI). J. Biol. Chem. 276: 20379—20386. PMID 11389151 DOI:10.1074/jbc.M101511200
• Fischer J., Weide T., Barnekow A. (2005). The MICAL proteins and rab1: a possible link to the cytoskeleton?. Biochem. Biophys. Res. Commun. 328: 415—423. PMID 15694364 DOI:10.1016/j.bbrc.2004.12.182
• Zoppino F.C., Militello R.D., Slavin I., Alvarez C., Colombo M.I. (2010). Autophagosome formation depends on the small GTPase Rab1 and functional ER exit sites. Traffic. 11: 1246—1261. PMID 20545908 DOI:10.1111/j.1600-0854.2010.01086.x

Див. також

• Хромосома 11