RAB6A

RAB6A
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1YZQ, 2GIL, 3BBP, 3CWZ, 4DKX
Ідентифікатори
Символи	RAB6A, RAB6, member RAS oncogene family
Зовнішні ІД	OMIM: 179513 MGI: 894313 HomoloGene: 55697 GeneCards: RAB6A
Онтологія гена
Молекулярна функція	• nucleotide binding; • protein domain specific binding; • GTP binding; • myosin V binding; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • GO:0006184 GTPase activity;
Клітинна компонента	• комплекс Ґольджі; • мембрана; • endosome to plasma membrane transport vesicle; • trans-Golgi network; • екзосома; • GO:0016023 cytoplasmic vesicle; • trans-Golgi network membrane; • гіалоплазма; • endoplasmic reticulum membrane; • Golgi membrane; • клітинна мембрана; • secretory granule membrane;
Біологічний процес	• antigen processing and presentation; • early endosome to Golgi transport; • peptidyl-cysteine methylation; • protein localization to Golgi apparatus; • protein transport; • minus-end-directed organelle transport along microtubule; • GO:0022415 viral process; • vesicle-mediated transport; • retrograde vesicle-mediated transport, Golgi to endoplasmic reticulum; • neutrophil degranulation; • GO:0015915 транспорт; • intracellular protein transport; • intra-Golgi vesicle-mediated transport; • Rab protein signal transduction; • retrograde transport, endosome to Golgi;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ; ; ;
	Більше даних
Ортологи
	5870
	19346
	ENSG00000175582
	ENSMUSG00000030704
	P20340
	P35279
	NM_198896; NM_001243718; NM_001243719; NM_002869
	NM_001163663; NM_024287
	NP_001230647; NP_001230648; NP_002860; NP_942599
	NP_001157135; NP_077249
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

RAB6A (англ. RAB6A, member RAS oncogene family) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 208 амінокислот, а молекулярна маса — 23 593^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MSTGGDFGNP	LRKFKLVFLG	EQSVGKTSLI	TRFMYDSFDN	TYQATIGIDF
LSKTMYLEDR	TVRLQLWDTA	GQERFRSLIP	SYIRDSTVAV	VVYDITNVNS
FQQTTKWIDD	VRTERGSDVI	IMLVGNKTDL	ADKRQVSIEE	GERKAKELNV
MFIETSAKAG	YNVKQLFRRV	AAALPGMEST	QDRSREDMID	IKLEKPQEQP
VSEGGCSC

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як взаємодія хазяїн-вірус, транспорт, транспорт білків, транспорт між ендоплазматичним ретикулумом і апаратом Гольджі, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з нуклеотидами, ГТФ. Локалізований у мембрані, апараті гольджі.

Література

Caillol N., Pasqualini E., Lloubes R., Lombardo D. (2000). Impairment of bile salt-dependent lipase secretion in human pancreatic tumoral SOJ-6 cells. J. Cell. Biochem. 79: 628—647. PMID 10996854 DOI:10.1002/1097-4644(20001215)79:4<628::AID-JCB120>3.0.CO;2-T
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Indran S.V., Britt W.J. (2011). A role for the small GTPase Rab6 in assembly of human cytomegalovirus. J. Virol. 85: 5213—5219. PMID 21411515 DOI:10.1128/JVI.02605-10
Pusapati G.V., Luchetti G., Pfeffer S.R. (2012). Ric1-Rgp1 complex is a guanine nucleotide exchange factor for the late Golgi Rab6A GTPase and an effector of the medial Golgi Rab33B GTPase. J. Biol. Chem. 287: 42129—42137. PMID 23091056 DOI:10.1074/jbc.M112.414565
Matsuto M., Kano F., Murata M. (2015). Reconstitution of the targeting of Rab6A to the Golgi apparatus in semi-intact HeLa cells: A role of BICD2 in stabilizing Rab6A on Golgi membranes and a concerted role of Rab6A/BICD2 interactions in Golgi-to-ER retrograde transport. Biochim. Biophys. Acta. 1853: 2592—2609. PMID 25962623 DOI:10.1016/j.bbamcr.2015.05.005
Bergbrede T., Pylypenko O., Rak A., Alexandrov K. (2005). Structure of the extremely slow GTPase Rab6A in the GTP bound form at 1.8A resolution. J. Struct. Biol. 152: 235—238. PMID 16332443 DOI:10.1016/j.jsb.2005.10.001