RDX

RDX
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1GC6, 1GC7, 1J19, 2D10, 2D11, 2D2Q, 2EMS, 2EMT, 2YVC, 2ZPY
Ідентифікатори
Символи	RDX, DFNB24, radixin
Зовнішні ІД	OMIM: 179410 MGI: 97887 HomoloGene: 37707 GeneCards: RDX
Пов'язані генетичні захворювання
	autosomal recessive nonsyndromic deafness 24, nonsyndromic deafness
Реагує на сполуку
	Viroporin 3a
Онтологія гена
Молекулярна функція	• protein homodimerization activity; • protein domain specific binding; • ATPase binding; • protein kinase A binding; • cytoskeletal protein binding; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • actin binding; • RNA binding; • cadherin binding;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • мембрана; • focal adhesion; • Філоподія; • ruffle; • myelin sheath; • клітинна мембрана; • apical part of cell; • stereocilium; • Мікроворсинки; • apical plasma membrane; • cortical actin cytoskeleton; • Борозна розщеплення; • екзосома; • цитоскелет; • cell periphery; • lamellipodium; • midbody; • T-tubule; • cell tip; • міжклітинний простір; • cell projection;
Біологічний процес	• regulation of cell size; • establishment of endothelial barrier; • microvillus assembly; • regulation of organelle assembly; • establishment of protein localization; • positive regulation of cell migration; • GO:0043087, GO:0032313, GO:0032319, GO:0032314, GO:0043088 regulation of GTPase activity; • positive regulation of G1/S transition of mitotic cell cycle; • negative regulation of homotypic cell-cell adhesion; • regulation of actin filament bundle assembly; • GO:1901313 positive regulation of gene expression; • GO:0034259 negative regulation of GTPase activity; • negative regulation of adherens junction organization; • apical protein localization; • actin filament capping; • cellular response to thyroid hormone stimulus; • regulation of cell shape; • protein kinase A signaling; • regulation of ruffle assembly; • positive regulation of protein localization to early endosome; • positive regulation of early endosome to late endosome transport; • negative regulation of cell size; • regulation of Rap protein signal transduction; • cellular response to platelet-derived growth factor stimulus; • barbed-end actin filament capping; • protein localization to plasma membrane;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ; ; ;
	Більше даних
Ортологи
	5962
	19684
	ENSG00000137710
	ENSMUSG00000032050
	P35241
	P26043
NM_002906; NM_001260492; NM_001260493; NM_001260494; NM_001260495;
	NM_001260496
	NM_001104616; NM_001104617; NM_009041
NP_001247421; NP_001247422; NP_001247423; NP_001247424; NP_001247425;
	NP_002897
	NP_001098086; NP_001098087; NP_033067
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

RDX (англ. Radixin) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми.^[5] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 583 амінокислот, а молекулярна маса — 68 564^[6].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MPKPINVRVT	TMDAELEFAI	QPNTTGKQLF	DQVVKTVGLR	EVWFFGLQYV
DSKGYSTWLK	LNKKVTQQDV	KKENPLQFKF	RAKFFPEDVS	EELIQEITQR
LFFLQVKEAI	LNDEIYCPPE	TAVLLASYAV	QAKYGDYNKE	IHKPGYLAND
RLLPQRVLEQ	HKLTKEQWEE	RIQNWHEEHR	GMLREDSMME	YLKIAQDLEM
YGVNYFEIKN	KKGTELWLGV	DALGLNIYEH	DDKLTPKIGF	PWSEIRNISF
NDKKFVIKPI	DKKAPDFVFY	APRLRINKRI	LALCMGNHEL	YMRRRKPDTI
EVQQMKAQAR	EEKHQKQLER	AQLENEKKKR	EIAEKEKERI	EREKEELMER
LKQIEEQTIK	AQKELEEQTR	KALELDQERK	RAKEEAERLE	KERRAAEEAK
SAIAKQAADQ	MKNQEQLAAE	LAEFTAKIAL	LEEAKKKKEE	EATEWQHKAF
AAQEDLEKTK	EELKTVMSAP	PPPPPPPVIP	PTENEHDEHD	ENNAEASAEL
SNEGVMNHRS	EEERVTETQK	NERVKKQLQA	LSSELAQARD	ETKKTQNDVL
HAENVKAGRD	KYKTLRQIRQ	GNTKQRIDEF	EAM

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до кепінгів актину, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з молекулою актину. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, цитоскелеті, мембрані.

Література

Wilgenbus K.K., Milatovich A., Francke U., Furthmayr H. (1993). Molecular cloning, cDNA sequence, and chromosomal assignment of the human radixin gene and two dispersed pseudogenes. Genomics. 16: 199—206. PMID 8486357 DOI:10.1006/geno.1993.1159
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з RDX переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Сполуки, які фізично взаємодіють з Radixin переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9944 (англ.) . Архів оригіналу за 5 квітня 2016. Процитовано 8 вересня 2017.
↑ UniProt, P35241 (англ.) . Архів оригіналу за 9 вересня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 11

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

[1] Захворювання, генетично пов'язані з RDX переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[2] Сполуки, які фізично взаємодіють з Radixin переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[3] Human PubMed Reference:.

[4] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-5] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9944 (англ.) . Архів оригіналу за 5 квітня 2016. Процитовано 8 вересня 2017.

[UniProt-6] UniProt, P35241 (англ.) . Архів оригіналу за 9 вересня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

RDX

Література

Примітки

Див. також

Навігаційне меню

Пошук