TOP2A

TOP2A
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1ZXM, 1ZXN, 4FM9, 4R1F
Ідентифікатори
Символи	TOP2A, TOP2, TP2A, topoisomerase (DNA) II alpha, DNA topoisomerase II alpha, TOPIIA, TOP2alpha
Зовнішні ІД	OMIM: 126430 MGI: 98790 HomoloGene: 830 GeneCards: TOP2A
Реагує на сполуку
доксорубіцин, етопозид, мітоксантрон, ідарубіцин, vosaroxin, доксорубіцин, adoxorubicin, мітоксантрон, doxorubicin hydrochloride
Онтологія гена Молекулярна функція • DNA binding • nucleotide binding • ATP-dependent activity, acting on DNA • protein homodimerization activity • histone deacetylase binding • chromatin binding • isomerase activity • зв'язування з іоном металу • DNA topoisomerase activity • protein C-terminus binding • ubiquitin binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • protein heterodimerization activity • enzyme binding • ATP binding • protein kinase C binding • magnesium ion binding • DNA binding, bending • RNA binding • GO:0003918 DNA topoisomerase type II (double strand cut, ATP-hydrolyzing) activity Клітинна компонента • цитоплазма • DNA topoisomerase type II (double strand cut, ATP-hydrolyzing) complex • нуклеоплазма • nuclear chromosome • ядерце • Центріоль • condensed chromosome • клітинне ядро • viral integration complex • GO:0009327 protein-containing complex • Рибонуклеопротеїни Біологічний процес • resolution of meiotic recombination intermediates • apoptotic chromosome condensation • embryonic cleavage • ритмічний процес • chromosome segregation • DNA metabolic process • protein sumoylation • cellular response to DNA damage stimulus • DNA ligation • chromosome condensation • regulation of circadian rhythm • hematopoietic progenitor cell differentiation • positive regulation of apoptotic process • mitotic DNA integrity checkpoint signaling • positive regulation of viral genome replication • positive regulation of single stranded viral RNA replication via double stranded DNA intermediate • sister chromatid segregation • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • DNA topological change • negative regulation of DNA duplex unwinding • female meiotic nuclear division Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	7153	21973
Ensembl	ENSG00000131747	ENSMUSG00000020914
UniProt	P11388	Q01320
RefSeq (мРНК)	NM_001067	NM_011623
RefSeq (білок)	NP_001058	NP_035753
Локус (UCSC)	Хр. 17: 40.39 – 40.42 Mb	Хр. 11: 98.88 – 98.92 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

TOP2A (англ. DNA topoisomerase II alpha) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 531 амінокислот, а молекулярна маса — 174 385.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MEVSPLQPVN		ENMQVNKIKK		NEDAKKRLSV		ERIYQKKTQL		EHILLRPDTY
IGSVELVTQQ		MWVYDEDVGI		NYREVTFVPG		LYKIFDEILV		NAADNKQRDP
KMSCIRVTID		PENNLISIWN		NGKGIPVVEH		KVEKMYVPAL		IFGQLLTSSN
YDDDEKKVTG		GRNGYGAKLC		NIFSTKFTVE		TASREYKKMF		KQTWMDNMGR
AGEMELKPFN		GEDYTCITFQ		PDLSKFKMQS		LDKDIVALMV		RRAYDIAGST
KDVKVFLNGN		KLPVKGFRSY		VDMYLKDKLD		ETGNSLKVIH		EQVNHRWEVC
LTMSEKGFQQ		ISFVNSIATS		KGGRHVDYVA		DQIVTKLVDV		VKKKNKGGVA
VKAHQVKNHM		WIFVNALIEN		PTFDSQTKEN		MTLQPKSFGS		TCQLSEKFIK
AAIGCGIVES		ILNWVKFKAQ		VQLNKKCSAV		KHNRIKGIPK		LDDANDAGGR
NSTECTLILT		EGDSAKTLAV		SGLGVVGRDK		YGVFPLRGKI		LNVREASHKQ
IMENAEINNI		IKIVGLQYKK		NYEDEDSLKT		LRYGKIMIMT		DQDQDGSHIK
GLLINFIHHN		WPSLLRHRFL		EEFITPIVKV		SKNKQEMAFY		SLPEFEEWKS
STPNHKKWKV		KYYKGLGTST		SKEAKEYFAD		MKRHRIQFKY		SGPEDDAAIS
LAFSKKQIDD		RKEWLTNFME		DRRQRKLLGL		PEDYLYGQTT		TYLTYNDFIN
KELILFSNSD		NERSIPSMVD		GLKPGQRKVL		FTCFKRNDKR		EVKVAQLAGS
VAEMSSYHHG		EMSLMMTIIN		LAQNFVGSNN		LNLLQPIGQF		GTRLHGGKDS
ASPRYIFTML		SSLARLLFPP		KDDHTLKFLY		DDNQRVEPEW		YIPIIPMVLI
NGAEGIGTGW		SCKIPNFDVR		EIVNNIRRLM		DGEEPLPMLP		SYKNFKGTIE
ELAPNQYVIS		GEVAILNSTT		IEISELPVRT		WTQTYKEQVL		EPMLNGTEKT
PPLITDYREY		HTDTTVKFVV		KMTEEKLAEA		ERVGLHKVFK		LQTSLTCNSM
VLFDHVGCLK		KYDTVLDILR		DFFELRLKYY		GLRKEWLLGM		LGAESAKLNN
QARFILEKID		GKIIIENKPK		KELIKVLIQR		GYDSDPVKAW		KEAQQKVPDE
EENEESDNEK		ETEKSDSVTD		SGPTFNYLLD		MPLWYLTKEK		KDELCRLRNE
KEQELDTLKR		KSPSDLWKED		LATFIEELEA		VEAKEKQDEQ		VGLPGKGGKA
KGKKTQMAEV		LPSPRGQRVI		PRITIEMKAE		AEKKNKKKIK		NENTEGSPQE
DGVELEGLKQ		RLEKKQKREP		GTKTKKQTTL		AFKPIKKGKK		RNPWSDSESD
RSSDESNFDV		PPRETEPRRA		ATKTKFTMDL		DSDEDFSDFD		EKTDDEDFVP
SDASPPKTKT		SPKLSNKELK		PQKSVVSDLE		ADDVKGSVPL		SSSPPATHFP
DETEITNPVP		KKNVTVKKTA		AKSQSSTSTT		GAKKRAAPKG		TKRDPALNSG
VSQKPDPAKT		KNRRKRKPST		SDDSDSNFEK		IVSKAVTSKK		SKGESDDFHM
DFDSAVAPRA		KSVRAKKPIK		YLEESDEDDL		F

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до ізомераз, топоізомераз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як біологічні ритми, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами, іонами металів, ДНК, іоном магнію. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Escargueil A.E., Plisov S.Y., Filhol O., Cochet C., Larsen A.K. (2000). Mitotic phosphorylation of DNA topoisomerase II alpha by protein kinase CK2 creates the MPM-2 phosphoepitope on Ser-1469. J. Biol. Chem. 275: 34710—34718. PMID 10942766 DOI:10.1074/jbc.M005179200
• Mirski S.E., Bielawski J.C., Cole S.P. (2003). Identification of functional nuclear export sequences in human topoisomerase IIalpha and beta. Biochem. Biophys. Res. Commun. 306: 905—911. PMID 12821127 DOI:10.1016/S0006-291X(03)01077-5
• Yun J., Tomida A., Andoh T., Tsuruo T. (2004). Interaction between glucose-regulated destruction domain of DNA topoisomerase IIalpha and MPN domain of Jab1/CSN5. J. Biol. Chem. 279: 31296—31303. PMID 15126503 DOI:10.1074/jbc.M401411200
• Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 DOI:10.1038/nbt1240
• Iida M., Matsuda M., Komatani H. (2008). Plk3 phosphorylates topoisomerase IIalpha at Thr(1342), a site that is not recognized by Plk1. Biochem. J. 411: 27—32. PMID 18062778 DOI:10.1042/BJ20071394

Див. також

• Хромосома 17