XDH

XDH
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2CKJ, 2E1Q
Ідентифікатори
Символи	XDH, XO, XOR, xanthine dehydrogenase, XAN1
Зовнішні ІД	OMIM: 607633 MGI: 98973 HomoloGene: 324 GeneCards: XDH
Пов'язані генетичні захворювання
ожиріння
Реагує на сполуку
алопуринол, topiroxostat
Онтологія гена Молекулярна функція • iron ion binding • protein homodimerization activity • xanthine oxidase activity • flavin adenine dinucleotide binding • oxidoreductase activity, acting on CH-OH group of donors • iron-sulfur cluster binding • зв'язування з іоном металу • каталітична активність • molybdopterin cofactor binding • electron transfer activity • xanthine dehydrogenase activity • oxidoreductase activity • 2 iron, 2 sulfur cluster binding • oxidoreductase activity, acting on the aldehyde or oxo group of donors • FAD binding Клітинна компонента • цитоплазма • гіалоплазма • пероксисома • sarcoplasmic reticulum • extracellular region • міжклітинний простір Біологічний процес • positive regulation of p38MAPK cascade • GO:0033128 negative regulation of protein phosphorylation • negative regulation of protein kinase B signaling • purine nucleotide catabolic process • negative regulation of endothelial cell differentiation • negative regulation of gene expression • negative regulation of endothelial cell proliferation • positive regulation of reactive oxygen species metabolic process • negative regulation of vasculogenesis • negative regulation of vascular endothelial growth factor signaling pathway • лактація • regulation of epithelial cell differentiation • xanthine catabolic process • activation of cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic process • Електронтранспортний ланцюг Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	7498	22436
Ensembl	ENSG00000158125	ENSMUSG00000024066
UniProt	P47989	Q00519
RefSeq (мРНК)	NM_000379	NM_011723
RefSeq (білок)	NP_000370	NP_035853
Локус (UCSC)	Хр. 2: 31.33 – 31.41 Mb	Хр. 17: 74.19 – 74.26 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

XDH (англ. Xanthine dehydrogenase) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 333 амінокислот, а молекулярна маса — 146 424.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MTADKLVFFV		NGRKVVEKNA		DPETTLLAYL		RRKLGLSGTK		LGCGEGGCGA
CTVMLSKYDR		LQNKIVHFSA		NACLAPICSL		HHVAVTTVEG		IGSTKTRLHP
VQERIAKSHG		SQCGFCTPGI		VMSMYTLLRN		QPEPTMEEIE		NAFQGNLCRC
TGYRPILQGF		RTFARDGGCC		GGDGNNPNCC		MNQKKDHSVS		LSPSLFKPEE
FTPLDPTQEP		IFPPELLRLK		DTPRKQLRFE		GERVTWIQAS		TLKELLDLKA
QHPDAKLVVG		NTEIGIEMKF		KNMLFPMIVC		PAWIPELNSV		EHGPDGISFG
AACPLSIVEK		TLVDAVAKLP		AQKTEVFRGV		LEQLRWFAGK		QVKSVASVGG
NIITASPISD		LNPVFMASGA		KLTLVSRGTR		RTVQMDHTFF		PGYRKTLLSP
EEILLSIEIP		YSREGEYFSA		FKQASRREDD		IAKVTSGMRV		LFKPGTTEVQ
ELALCYGGMA		NRTISALKTT		QRQLSKLWKE		ELLQDVCAGL		AEELHLPPDA
PGGMVDFRCT		LTLSFFFKFY		LTVLQKLGQE		NLEDKCGKLD		PTFASATLLF
QKDPPADVQL		FQEVPKGQSE		EDMVGRPLPH		LAADMQASGE		AVYCDDIPRY
ENELSLRLVT		STRAHAKIKS		IDTSEAKKVP		GFVCFISADD		VPGSNITGIC
NDETVFAKDK		VTCVGHIIGA		VVADTPEHTQ		RAAQGVKITY		EELPAIITIE
DAIKNNSFYG		PELKIEKGDL		KKGFSEADNV		VSGEIYIGGQ		EHFYLETHCT
IAVPKGEAGE		MELFVSTQNT		MKTQSFVAKM		LGVPANRIVV		RVKRMGGGFG
GKETRSTVVS		TAVALAAYKT		GRPVRCMLDR		DEDMLITGGR		HPFLARYKVG
FMKTGTVVAL		EVDHFSNVGN		TQDLSQSIME		RALFHMDNCY		KIPNIRGTGR
LCKTNLPSNT		AFRGFGGPQG		MLIAECWMSE		VAVTCGMPAE		EVRRKNLYKE
GDLTHFNQKL		EGFTLPRCWE		ECLASSQYHA		RKSEVDKFNK		ENCWKKRGLC
IIPTKFGISF		TVPFLNQAGA		LLHVYTDGSV		LLTHGGTEMG		QGLHTKMVQV
ASRALKIPTS		KIYISETSTN		TVPNTSPTAA		SVSADLNGQA		VYAACQTILK
RLEPYKKKNP		SGSWEDWVTA		AYMDTVSLSA		TGFYRTPNLG		YSFETNSGNP
FHYFSYGVAC		SEVEIDCLTG		DHKNLRTDIV		MDVGSSLNPA		IDIGQVEGAF
VQGLGLFTLE		ELHYSPEGSL		HTRGPSTYKI		PAFGSIPIEF		RVSLLRDCPN
KKAIYASKAV		GEPPLFLAAS		IFFAIKDAIR		AARAQHTGNN		VKELFRLDSP
ATPEKIRNAC		VDKFTTLCVT		GVPENCKPWS		VRV

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до оксидоредуктаз. Задіяний у такому біологічному процесі як поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з НАД, іонами металів, іоном заліза, ФАД, флавопротеїном, залізо-сірчаною групою, групою 2fe-2s. Локалізований у цитоплазмі, пероксисомах. Також секретований назовні.

Література

• Xu P., Huecksteadt T.P., Harrison R., Hoidal J.R. (1994). Molecular cloning, tissue expression of human xanthine dehydrogenase. Biochem. Biophys. Res. Commun. 199: 998—1004. PMID 8135849 DOI:10.1006/bbrc.1994.1328
• Xu P., Huecksteadt T.P., Harrison R., Hoidal J.R. (1995). Biochem. Biophys. Res. Commun. 215: 429—429. {{cite journal}}: Пропущений або порожній |title= (довідка) PMID 7575623 DOI:10.1006/bbrc.1995.2482
• Saksela M., Raivio K.O. (1996). Cloning and expression in vitro of human xanthine dehydrogenase/oxidase. Biochem. J. 315: 235—239. PMID 8670112 DOI:10.1042/bj3150235
• Picariello G., Ferranti P., Mamone G., Roepstorff P., Addeo F. (2008). Identification of N-linked glycoproteins in human milk by hydrophilic interaction liquid chromatography and mass spectrometry. Proteomics. 8: 3833—3847. PMID 18780401 DOI:10.1002/pmic.200701057
• Yamaguchi Y., Matsumura T., Ichida K., Okamoto K., Nishino T. (2007). Human xanthine oxidase changes its substrate specificity to aldehyde oxidase type upon mutation of amino acid residues in the active site: roles of active site residues in binding and activation of purine substrate. J. Biochem. 141: 513—524. PMID 17301077 DOI:10.1093/jb/mvm053
• Gok F., Ichida K., Topaloglu R. (2003). Mutational analysis of the xanthine dehydrogenase gene in a Turkish family with autosomal recessive classical xanthinuria. Nephrol. Dial. Transplant. 18: 2278—2283. PMID 14551354 DOI:10.1093/ndt/gfg385

Див. також

• Хромосома 2