Рибосомний білок L5

Рибосомний білок L5
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 4UG0, 4V6X, 5AJ0, 4UJD, 4D67, 4D5Y, 4UJE, 4UJC
Ідентифікатори
Символи	RPL5, DBA6, L5, PPP1R135, MSTP030, Ribosomal protein L5, uL18
Зовнішні ІД	OMIM: 603634 MGI: 102854 HomoloGene: 110649 GeneCards: RPL5
Пов'язані генетичні захворювання
Diamond-Blackfan anemia
Онтологія гена Молекулярна функція • rRNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • RNA binding • structural constituent of ribosome • mRNA 3'-UTR binding • 5S rRNA binding • ubiquitin protein ligase binding • mRNA 5'-UTR binding • GO:0090645, GO:0061637 ubiquitin ligase inhibitor activity Клітинна компонента • цитоплазма • гіалоплазма • рибосома • мембрана • focal adhesion • внутрішньоклітинний • ядерце • cytosolic large ribosomal subunit • екзосома • клітинне ядро • нуклеоплазма • ендоплазматичний ретикулум • GO:0009327 protein-containing complex • синапс • Рибонуклеопротеїни Біологічний процес • viral transcription • SRP-dependent cotranslational protein targeting to membrane • ribosomal large subunit biogenesis • translational initiation • nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay • rRNA processing • ribosomal large subunit assembly • Біосинтез білків • GO:1901313 positive regulation of gene expression • positive regulation of translation • protein stabilization • GO:0060564, GO:1904190 negative regulation of ubiquitin protein ligase activity • negative regulation of ubiquitin-dependent protein catabolic process • negative regulation of protein neddylation • regulation of signal transduction by p53 class mediator Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	6125	100503670
Ensembl	ENSG00000122406	ENSMUSG00000058558
UniProt	P46777 Q5T7N0	P47962
RefSeq (мРНК)	NM_000969	NM_016980
RefSeq (білок)	NP_000960	NP_058676
Локус (UCSC)	Хр. 1: 92.83 – 92.84 Mb	Хр. 5: 108.05 – 108.06 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Рибосомний білок L5 (англ. Ribosomal protein L5) – білок, який кодується геном RPL5, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 297 амінокислот, а молекулярна маса — 34 363.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MGFVKVVKNK		AYFKRYQVKF		RRRREGKTDY		YARKRLVIQD		KNKYNTPKYR
MIVRVTNRDI		ICQIAYARIE		GDMIVCAAYA		HELPKYGVKV		GLTNYAAAYC
TGLLLARRLL		NRFGMDKIYE		GQVEVTGDEY		NVESIDGQPG		AFTCYLDAGL
ARTTTGNKVF		GALKGAVDGG		LSIPHSTKRF		PGYDSESKEF		NAEVHRKHIM
GQNVADYMRY		LMEEDEDAYK		KQFSQYIKNS		VTPDMMEEMY		KKAHAAIREN
PVYEKKPKKE		VKKKRWNRPK		MSLAQKKDRV		AQKKASFLRA		QERAAES

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Цей білок за функціями належить до рибонуклеопротеїнів, рибосомних білків. Білок має сайт для зв'язування з РНК, рРНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

• Frigerio J.-M., Dagorn J.-C., Iovanna J.L. (1995). Cloning, sequencing and expression of the L5, L21, L27a, L28, S5, S9, S10 and S29 human ribosomal protein mRNAs. Biochim. Biophys. Acta. 1262: 64—68. PMID 7772601 DOI:10.1016/0167-4781(95)00045-I
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Kim J.-M., Cha J.-Y., Marshak D.R., Bae Y.-S. (1996). Interaction of the beta subunit of casein kinase II with the ribosomal protein L5. Biochem. Biophys. Res. Commun. 226: 180—186. PMID 8806611 DOI:10.1006/bbrc.1996.1330
• Impens F., Radoshevich L., Cossart P., Ribet D. (2014). Mapping of SUMO sites and analysis of SUMOylation changes induced by external stimuli. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 111: 12432—12437. PMID 25114211 DOI:10.1073/pnas.1413825111

Див. також

• Хромосома 1