EIF4B

EIF4B
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1WI8, 2J76
Ідентифікатори
Символи	EIF4B, EIF-4B, PRO1843, eukaryotic translation initiation factor 4B
Зовнішні ІД	OMIM: 603928 MGI: 95304 HomoloGene: 83162 GeneCards: EIF4B
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • nucleic acid binding • ribosomal small subunit binding • GO:0008026 helicase activity • RNA strand-exchange activity • RNA strand annealing activity • RNA binding • translation initiation factor activity Клітинна компонента • гіалоплазма • eukaryotic translation initiation factor 4F complex • Полісома Біологічний процес • nuclear-transcribed mRNA poly(A) tail shortening • regulation of translational initiation • formation of translation preinitiation complex • eukaryotic translation initiation factor 4F complex assembly • Біосинтез білків • translational initiation • cytoplasmic translation Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	1975	75705
Ensembl	ENSG00000063046	ENSMUSG00000058655
UniProt	P23588	Q8BGD9
RefSeq (мРНК)	NM_001300821 NM_001417 NM_018507 NM_001330654	NM_145625
RefSeq (білок)	NP_001287750 NP_001317583 NP_001408	NP_663600
Локус (UCSC)	Хр. 12: 53.01 – 53.04 Mb	Хр. 15: 101.98 – 102.01 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

EIF4B (англ. Eukaryotic translation initiation factor 4B) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 611 амінокислот, а молекулярна маса — 69 151.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAASAKKKNK		KGKTISLTDF		LAEDGGTGGG		STYVSKPVSW		ADETDDLEGD
VSTTWHSNDD		DVYRAPPIDR		SILPTAPRAA		REPNIDRSRL		PKSPPYTAFL
GNLPYDVTEE		SIKEFFRGLN		ISAVRLPREP		SNPERLKGFG		YAEFEDLDSL
LSALSLNEES		LGNRRIRVDV		ADQAQDKDRD		DRSFGRDRNR		DSDKTDTDWR
ARPATDSFDD		YPPRRGDDSF		GDKYRDRYDS		DRYRDGYRDG		YRDGPRRDMD
RYGGRDRYDD		RGSRDYDRGY		DSRIGSGRRA		FGSGYRRDDD		YRGGGDRYED
RYDRRDDRSW		SSRDDYSRDD		YRRDDRGPPQ		RPKLNLKPRS		TPKEDDSSAS
TSQSTRAASI		FGGAKPVDTA		AREREVEERL		QKEQEKLQRQ		LDEPKLERRP
RERHPSWRSE		ETQERERSRT		GSESSQTGTS		TTSSRNARRR		ESEKSLENET
LNKEEDCHSP		TSKPPKPDQP		LKVMPAPPPK		ENAWVKRSSN		PPARSQSSDT
EQQSPTSGGG		KVAPAQPSEE		GPGRKDENKV		DGMNAPKGQT		GNSSRGPGDG
GNRDHWKESD		RKDGKKDQDS		RSAPEPKKPE		ENPASKFSSA		SKYAALSVDG
EDENEGEDYA		E

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до факторів ініціації, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як біосинтез білків, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з РНК.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Methot N., Pause A., Hershey J.W., Sonenberg N. (1994). The translation initiation factor eIF-4B contains an RNA-binding region that is distinct and independent from its ribonucleoprotein consensus sequence. Mol. Cell. Biol. 14: 2307—2316. PMID 8139536 DOI:10.1128/MCB.14.4.2307
• Methot N., Song M.S., Sonenberg N. (1996). A region rich in aspartic acid, arginine, tyrosine, and glycine (DRYG) mediates eukaryotic initiation factor 4B (eIF4B) self-association and interaction with eIF3. Mol. Cell. Biol. 16: 5328—5334. PMID 8816444 DOI:10.1128/MCB.16.10.5328
• Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 DOI:10.1038/nbt1240
• Milburn S.C., Hershey J.W.B., Davies M.V., Kelleher K., Kaufman R.J. (1990). Cloning and expression of eukaryotic initiation factor 4B cDNA: sequence determination identifies a common RNA recognition motif. EMBO J. 9: 2783—2790. PMID 2390971

Див. також

• Хромосома 12