Рибосомний білок S13

Рибосомний білок S13
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	4UG0, 4V6X, 5A2Q, 5AJ0, 4KZY, 3J7R, 4D61, 4KZX, 4D5L, 5FLX, 4UJD, 3J7P, 4KZZ, 4UJE, 4UJC
Ідентифікатори
Символи	RPS13, S13, ribosomal protein S13
Зовнішні ІД	OMIM: 180476 MGI: 1915302 HomoloGene: 128182 GeneCards: RPS13
Онтологія гена
Молекулярна функція	• small ribosomal subunit rRNA binding; • structural constituent of ribosome; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • mRNA binding; • 5.8S rRNA binding; • RNA binding; • mRNA 5'-UTR binding;
Клітинна компонента	• гіалоплазма; • рибосома; • мембрана; • focal adhesion; • внутрішньоклітинний; • cytosolic small ribosomal subunit; • ядерце; • екзосома; • клітинне ядро; • нуклеоплазма; • GO:0005578 Позаклітинна матриця; • GO:0097483, GO:0097481 постсинаптичне ущільнення;
Біологічний процес	• viral transcription; • SRP-dependent cotranslational protein targeting to membrane; • translational initiation; • nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay; • negative regulation of RNA splicing; • Біосинтез білків; • rRNA processing;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
	6207
	68052
	ENSG00000110700
	ENSMUSG00000090862
	P62277
	P62301
	NM_001017
	NM_026533
	NP_001008
	NP_080809
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

Рибосомний білок S13 (англ. Ribosomal protein S13) – білок, який кодується геном RPS13, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 151 амінокислот, а молекулярна маса — 17 222^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MGRMHAPGKG	LSQSALPYRR	SVPTWLKLTS	DDVKEQIYKL	AKKGLTPSQI
GVILRDSHGV	AQVRFVTGNK	ILRILKSKGL	APDLPEDLYH	LIKKAVAVRK
HLERNRKDKD	AKFRLILIES	RIHRLARYYK	TKRVLPPNWK	YESSTASALV
A

A: Аланін

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Цей білок за функціями належить до рибонуклеопротеїнів, рибосомних білків.

Література

Chadeneau C., Lemoullac B., Denis M.G. (1993). Cloning and analysis of the human S13 ribosomal protein cDNA. Nucleic Acids Res. 21: 2945—2945. PMID 8332508 DOI:10.1093/nar/21.12.2945
Kenmochi N., Higa S., Yoshihama M., Tanaka T. (1996). U14 snoRNAs are encoded in introns of human ribosomal protein S13 gene. Biochem. Biophys. Res. Commun. 228: 371—374. PMID 8920921 DOI:10.1006/bbrc.1996.1668
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:10386 (англ.) . Процитовано 6 лютого 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, P62277 (англ.) . Процитовано 6 лютого 2017.