EEF1D

EEF1D
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	2MVM, 2MVN, 2N51
Ідентифікатори
Символи	EEF1D, EF-1D, EF1D, FP1047, eukaryotic translation elongation factor 1 delta
Зовнішні ІД	OMIM: 130592 MGI: 1913906 HomoloGene: 23404 GeneCards: EEF1D
Онтологія гена
Молекулярна функція	• DNA binding; • heat shock protein binding; • translation factor activity, RNA binding; • signal transducer activity; • translation elongation factor activity; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • cadherin binding;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • ендоплазматичний ретикулум; • клітинне ядро; • eukaryotic translation elongation factor 1 complex; • fibrillar center; • гіалоплазма;
Біологічний процес	• GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated; • regulation of cell death; • translational elongation; • mRNA transcription; • transcription, DNA-templated; • cellular response to ionizing radiation; • positive regulation of I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling; • GO:0072468 сигнальна трансдукція; • Біосинтез білків;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ;
	Більше даних
Ортологи
	1936
	66656
	ENSG00000104529; ENSG00000273594
	ENSMUSG00000055762
	P29692
	P57776
NM_001130053; NM_001130054; NM_001130055; NM_001130056; NM_001130057;
	NM_001195203; NM_001289950; NM_001960; NM_032378; NM_001317743; NM_001330646
NM_001285429; NM_001285430; NM_001285431; NM_001285432; NM_001285433;
	NM_001285434; NM_023240; NM_029663
NP_001123525; NP_001123527; NP_001123528; NP_001123529; NP_001182132;
	NP_001276879; NP_001304672; NP_001317575; NP_001951; NP_115754
NP_001272358; NP_001272359; NP_001272360; NP_001272361; NP_001272362;
	NP_001272363; NP_075729; NP_083939
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

EEF1D (англ. Eukaryotic translation elongation factor 1 delta) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 8-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 281 амінокислот, а молекулярна маса — 31 122^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MATNFLAHEK	IWFDKFKYDD	AERRFYEQMN	GPVAGASRQE	NGASVILRDI
ARARENIQKS	LAGSSGPGAS	SGTSGDHGEL	VVRIASLEVE	NQSLRGVVQE
LQQAISKLEA	RLNVLEKSSP	GHRATAPQTQ	HVSPMRQVEP	PAKKPATPAE
DDEDDDIDLF	GSDNEEEDKE	AAQLREERLR	QYAEKKAKKP	ALVAKSSILL
DVKPWDDETD	MAQLEACVRS	IQLDGLVWGA	SKLVPVGYGI	RKLQIQCVVE
DDKVGTDLLE	EEITKFEEHV	QSVDIAAFNK	I

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до факторів елонгації, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, біосинтез білка, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

Sanders J.P., Raggiaschi R., Morales J., Moeller W. (1993). The human leucine zipper-containing guanine-nucleotide exchange protein elongation factor-1 delta. Biochim. Biophys. Acta. 1174: 87—90. PMID 8334168 DOI:10.1016/0167-4781(93)90097-W
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Chacko G., Ling Q., Hajjar K.A. (1998). Induction of acute translational response genes by homocysteine. Elongation factors-1alpha, -beta, and -delta. J. Biol. Chem. 273: 19840—19846. PMID 9677419 DOI:10.1074/jbc.273.31.19840
Beranova-Giorgianni S., Zhao Y., Desiderio D.M., Giorgianni F. (2006). Phosphoproteomic analysis of the human pituitary. Pituitary. 9: 109—120. PMID 16807684 DOI:10.1007/s11102-006-8916-x
Giorgianni F., Zhao Y., Desiderio D.M., Beranova-Giorgianni S. (2007). Toward a global characterization of the phosphoproteome in prostate cancer cells: identification of phosphoproteins in the LNCaP cell line. Electrophoresis. 28: 2027—2034. PMID 17487921 DOI:10.1002/elps.200600782
Carrascal M., Ovelleiro D., Casas V., Gay M., Abian J. (2008). Phosphorylation analysis of primary human T lymphocytes using sequential IMAC and titanium oxide enrichment. J. Proteome Res. 7: 5167—5176. PMID 19367720 DOI:10.1021/pr800500r

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:3211 (англ.) . Процитовано 7 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, P29692 (англ.) . Архів оригіналу за 12 січня 2018. Процитовано 7 вересня 2017.