NIN

NIN
Ідентифікатори
Символи	NIN, SCKL7, ninein
Зовнішні ІД	OMIM: 608684 MGI: 105108 HomoloGene: 40632 GeneCards: NIN
Пов'язані генетичні захворювання
Seckel syndrome 7
Реагує на сполуку
Viroporin 3a
Онтологія гена Молекулярна функція • nucleotide binding • calcium ion binding • GTP binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • kinase binding Клітинна компонента • цитоплазма • центр організації мікротрубочок • spindle pole • ядерце • pericentriolar material • мікротрубочка • цитоскелет • mitotic spindle pole • microtubule minus-end • центросома • ciliary transition fiber • клітинне ядро • Центріоль • mitotic spindle • centriolar subdistal appendage • клітинна мембрана • аксон • дендрит (нейробіологія) • axonal growth cone • apical part of cell Біологічний процес • centrosome localization • centrosome-templated microtubule nucleation • microtubule anchoring at centrosome • GO:0034613 protein localization • centriole-centriole cohesion • corpus callosum morphogenesis • corticospinal tract morphogenesis • positive regulation of microtubule polymerization • collateral sprouting • positive regulation of axonogenesis Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	51199	18080
Ensembl	ENSG00000100503	ENSMUSG00000021068
UniProt	Q8N4C6	Q61043
RefSeq (мРНК)	NM_016350 NM_020921 NM_182944 NM_182945 NM_182946	NM_001081453 NM_001286079 NM_001286080 NM_008697
RefSeq (білок)	NP_057434 NP_065972 NP_891989 NP_891991	NP_001074922 NP_001273008 NP_001273009 NP_032723 NP_001390761
Локус (UCSC)	Хр. 14: 50.72 – 50.83 Mb	Хр. 12: 70.06 – 70.16 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

NIN (англ. Ninein) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 14-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 2 090 амінокислот, а молекулярна маса — 243 249.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MDEVEQDQHE		ARLKELFDSF		DTTGTGSLGQ		EELTDLCHML		SLEEVAPVLQ
QTLLQDNLLG		RVHFDQFKEA		LILILSRTLS		NEEHFQEPDC		SLEAQPKYVR
GGKRYGRRSL		PEFQESVEEF		PEVTVIEPLD		EEARPSHIPA		GDCSEHWKTQ
RSEEYEAEGQ		LRFWNPDDLN		ASQSGSSPPQ		DWIEEKLQEV		CEDLGITRDG
HLNRKKLVSI		CEQYGLQNVD		GEMLEEVFHN		LDPDGTMSVE		DFFYGLFKNG
KSLTPSASTP		YRQLKRHLSM		QSFDESGRRT		TTSSAMTSTI		GFRVFSCLDD
GMGHASVERI		LDTWQEEGIE		NSQEILKALD		FSLDGNINLT		ELTLALENEL
LVTKNSIHQA		ALASFKAEIR		HLLERVDQVV		REKEKLRSDL		DKAEKLKSLM
ASEVDDHHAA		IERRNEYNLR		KLDEEYKERI		AALKNELRKE		REQILQQAGK
QRLELEQEIE		KAKTEENYIR		DRLALSLKEN		SRLENELLEN		AEKLAEYENL
TNKLQRNLEN		VLAEKFGDLD		PSSAEFFLQE		ERLTQMRNEY		ERQCRVLQDQ
VDELQSELEE		YRAQGRVLRL		PLKNSPSEEV		EANSGGIEPE		HGLGSEECNP
LNMSIEAELV		IEQMKEQHHR		DICCLRLELE		DKVRHYEKQL		DETVVSCKKA
QENMKQRHEN		ETHTLEKQIS		DLKNEIAELQ		GQAAVLKEAH		HEATCRHEEE
KKQLQVKLEE		EKTHLQEKLR		LQHEMELKAR		LTQAQASFER		EREGLQSSAW
TEEKVRGLTQ		ELEQFHQEQL		TSLVEKHTLE		KEELRKELLE		KHQRELQEGR
EKMETECNRR		TSQIEAQFQS		DCQKVTERCE		SALQSLEGRY		RQELKDLQEQ
QREEKSQWEF		EKDELTQECA		EAQELLKETL		KREKTTSLVL		TQEREMLEKT
YKEHLNSMVV		ERQQLLQDLE		DLRNVSETQQ		SLLSDQILEL		KSSHKRELRE
REEVLCQAGA		SEQLASQRLE		RLEMEHDQER		QEMMSKLLAM		ENIHKATCET
ADRERAEMST		EISRLQSKIK		EMQQATSPLS		MLQSGCQVIG		EEEVEGDGAL
SLLQQGEQLL		EENGDVLLSL		QRAHEQAVKE		NVKMATEISR		LQQRLQKLEP
GLVMSSCLDE		PATEFFGNTA		EQTEQFLQQN		RTKQVEGVTR		RHVLSDLEDD
EVRDLGSTGT		SSVQRQEVKI		EESEASVEGF		SELENSEETR		TESWELKNQI
SQLQEQLMML		CADCDRASEK		KQDLLFDVSV		LKKKLKMLER		IPEASPKYKL
LYEDVSREND		CLQEELRMME		TRYDEALENN		KELTAEVFRL		QDELKKMEEV
TETFLSLEKS		YDEVKIENEG		LNVLVLRLQG		KIEKLQESVV		QRCDCCLWEA
SLENLEIEPD		GNILQLNQTL		EECVPRVRSV		HHVIEECKQE		NQYLEGNTQL
LEKVKAHEIA		WLHGTIQTHQ		ERPRVQNQVI		LEENTTLLGF		QDKHFQHQAT
IAELELEKTK		LQELTRKLKE		RVTILVKQKD		VLSHGEKEEE		LKAMMHDLQI
TCSEMQQKVE		LLRYESEKLQ		QENSILRNEI		TTLNEEDSIS		NLKLGTLNGS
QEEMWQKTET		VKQENAAVQK		MVENLKKQIS		ELKIKNQQLD		LENTELSQKN
SQNQEKLQEL		NQRLTEMLCQ		KEKEPGNSAL		EEREQEKFNL		KEELERCKVQ
SSTLVSSLEA		ELSEVKIQTH		IVQQENHLLK		DELEKMKQLH		RCPDLSDFQQ
KISSVLSYNE		KLLKEKEALS		EELNSCVDKL		AKSSLLEHRI		ATMKQEQKSW
EHQSASLKSQ		LVASQEKVQN		LEDTVQNVNL		QMSRMKSDLR		VTQQEKEALK
QEVMSLHKQL		QNAGGKSWAP		EIATHPSGLH		NQQKRLSWDK		LDHLMNEEQQ
LLWQENERLQ		TMVQNTKAEL		THSREKVRQL		ESNLLPKHQK		HLNPSGTMNP
TEQEKLSLKR		ECDQFQKEQS		PANRKVSQMN		SLEQELETIH		LENEGLKKKQ
VKLDEQLMEM		QHLRSTATPS		PSPHAWDLQL		LQQQACPMVP		REQFLQLQRQ
LLQAERINQH		LQEELENRTS		ETNTPQGNQE		QLVTVMEERM		IEVEQKLKLV
KRLLQEKVNQ		LKEQVSLPGH		LCSPTSHSSF		NSSFTSLYCH

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з нуклеотидами, ГТФ. Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті.

Література

• Hong Y.-R., Chen C.-H., Chuo M.-H., Liou S.-Y., Howng S.-L. (2000). Genomic organization and molecular characterization of the human ninein gene. Biochem. Biophys. Res. Commun. 279: 989—995. PMID 11162463 DOI:10.1006/bbrc.2000.4050
• Nagase T., Kikuno R., Nakayama M., Hirosawa M., Ohara O. (2000). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XVIII. The complete sequences of 100 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro. DNA Res. 7: 273—281. PMID 10997877 DOI:10.1093/dnares/7.4.271
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Dammermann A., Merdes A. (2002). Assembly of centrosomal proteins and microtubule organization depends on PCM-1. J. Cell Biol. 159: 255—266. PMID 12403812 DOI:10.1083/jcb.200204023
• Fritzler M.J., Zhang M., Stinton L.M., Rattner J.B. (2003). Spectrum of centrosome autoantibodies in childhood varicella and post-varicella acute cerebellar ataxia. BMC Pediatr. 3: 11—11. PMID 14503922 DOI:10.1186/1471-2431-3-11
• Kodani A., Salome Sirerol-Piquer M., Seol A., Garcia-Verdugo J.M., Reiter J.F. (2013). Kif3a interacts with Dynactin subunit p150 Glued to organize centriole subdistal appendages. EMBO J. 32: 597—607. PMID 23386061 DOI:10.1038/emboj.2013.3

Див. також

• Хромосома 14