CDK5RAP2

Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.
Перейти до навігації Перейти до пошуку
CDK5RAP2
Ідентифікатори
Символи CDK5RAP2, C48, Cep215, MCPH3, CDK5 regulatory subunit associated protein 2
Зовнішні ІД OMIM: 608201 MGI: 2384875 HomoloGene: 49533 GeneCards: CDK5RAP2
Пов'язані генетичні захворювання
ревматоїдний артрит[1]
Реагує на сполуку
Viroporin 3a[2]
Шаблон експресії


Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
NM_001011649
NM_001272039
NM_018249
NM_145990
NM_001313762
RefSeq (білок)
NP_001011649
NP_001258968
NP_060719
NP_035869
NP_001300691
NP_666102
Локус (UCSC) Хр. 9: 120.39 – 120.58 Mb Хр. 4: 70.14 – 70.33 Mb
PubMed search [3] [4]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

CDK5RAP2 (англ. CDK5 regulatory subunit associated protein 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 9-ї хромосоми.[5] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 893 амінокислот, а молекулярна маса — 215 038[6].

Послідовність амінокислот
1020304050
MMDLVLEEDVTVPGTLSGCSGLVPSVPDDLDGINPNAGLGNGLLPNVSEE
TVSPTRARNMKDFENQITELKKENFNLKLRIYFLEERMQQEFHGPTEHIY
KTNIELKVEVESLKRELQEREQLLIKASKAVESLAEAGGSEIQRVKEDAR
KKVQQVEDLLTKRILLLEKDVTAAQAELEKAFAGTETEKALRLRLESKLS
EMKKMHEGDLAMALVLDEKDRLIEELKLSLKSKEALIQCLKEEKSQMACP
DENVSSGELRGLCAAPREEKERETEAAQMEHQKERNSFEERIQALEEDLR
EKEREIATEKKNSLKRDKAIQGLTMALKSKEKKVEELNSEIEKLSAAFAK
AREALQKAQTQEFQGSEDYETALSGKEALSAALRSQNLTKSTENHRLRRS
IKKITQELSDLQQERERLEKDLEEAHREKSKGDCTIRDLRNEVEKLRNEV
NEREKAMENRYKSLLSESNKKLHNQEQVIKHLTESTNQKDVLLQKFNEKD
LEVIQQNCYLMAAEDLELRSEGLITEKCSSQQPPGSKTIFSKEKKQSSDY
EELIQVLKKEQDIYTHLVKSLQESDSINNLQAELNKIFALRKQLEQDVLS
YQNLRKTLEEQISEIRRREEESFSLYSDQTSYLSICLEENNRFQVEHFSQ
EELKKKVSDLIQLVKELYTDNQHLKKTIFDLSCMGFQGNGFPDRLASTEQ
TELLASKEDEDTIKIGEDDEINFLSDQHLQQSNEIMKDLSKGGCKNGYLR
HTESKISDCDGAHAPGCLEEGAFINLLAPLFNEKATLLLESRPDLLKVVR
ELLLGQLFLTEQEVSGEHLDGKTEKTPKQKGELVHFVQTNSFSKPHDELK
LSCEAQLVKAGEVPKVGLKDASVQTVATEGDLLRFKHEATREAWEEKPIN
TALSAEHRPENLHGVPGWQAALLSLPGITNREAKKSRLPILIKPSRSLGN
MYRLPATQEVVTQLQSQILELQGELKEFKTCNKQLHQKLILAEAVMEGRP
TPDKTLLNAQPPVGAAYQDSPGEQKGIKTTSSVWRDKEMDSDQQRSYEID
SEICPPDDLASLPSCKENPEDVLSPTSVATYLSSKSQPSAKVSVMGTDQS
ESINTSNETEYLKQKIHDLETELEGYQNFIFQLQKHSQCSEAIITVLCGT
EGAQDGLSKPKNGSDGEEMTFSSLHQVRYVKHVKILGPLAPEMIDSRVLE
NLKQQLEEQEYKLQKEQNLNMQLFSEIHNLQNKFRDLSPPRYDSLVQSQA
RELSLQRQQIKDGHGICVISRQHMNTMIKAFEELLQASDVDYCVAEGFQE
QLNQCAELLEKLEKLFLNGKSVGVEMNTQNELMERIEEDNLTYQHLLPES
PEPSASHALSDYETSEKSFFSRDQKQDNETEKTSVMVNSFSQDLLMEHIQ
EIRTLRKRLEESIKTNEKLRKQLERQGSEFVQGSTSIFASGSELHSSLTS
EIHFLRKQNQALNAMLIKGSRDKQKENDKLRESLSRKTVSLEHLQREYAS
VKEENERLQKEGSEKERHNQQLIQEVRCSGQELSRVQEEVKLRQQLLSQN
DKLLQSLRVELKAYEKLDEEHRRLREASGEGWKGQDPFRDLHSLLMEIQA
LRLQLERSIETSSTLQSRLKEQLARGAEKAQEGALTLAVQAVSIPEVPLQ
PDKHDGDKYPMESDNSFDLFDSSQAVTPKSVSETPPLSGNDTDSLSCDSG
SSATSTPCVSRLVTGHHLWASKNGRHVLGLIEDYEALLKQISQGQRLLAE
MDIQTQEAPSSTSQELGTKGPHPAPLSKFVSSVSTAKLTLEEAYRRLKLL
WRVSLPEDGQCPLHCEQIGEMKAEVTKLHKKLFEQEKKLQNTMKLLQLSK
RQEKVIFDQLVVTHKILRKARGNLELRPGGAHPGTCSPSRPGS

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з молекулою кальмодуліну. Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті, апараті гольджі.

Література

[ред. | ред. код]
  • Nagase T., Kikuno R., Nakayama M., Hirosawa M., Ohara O. (2000). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XVIII. The complete sequences of 100 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro. DNA Res. 7: 273—281. PMID 10997877 DOI:10.1093/dnares/7.4.271
  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Ching Y.-P., Qi Z., Wang J.H. (2000). Cloning of three novel neuronal Cdk5 activator binding proteins. Gene. 242: 285—294. PMID 10721722 DOI:10.1016/S0378-1119(99)00499-0
  • Graser S., Stierhof Y.D., Nigg E.A. (2007). Cep68 and Cep215 (Cdk5rap2) are required for centrosome cohesion. J. Cell Sci. 120: 4321—4331. PMID 18042621 DOI:10.1242/jcs.020248
  • Fong K.W., Choi Y.K., Rattner J.B., Qi R.Z. (2008). CDK5RAP2 is a pericentriolar protein that functions in centrosomal attachment of the gamma-tubulin ring complex. Mol. Biol. Cell. 19: 115—125. PMID 17959831 DOI:10.1091/mbc.E07-04-0371
  • Haren L., Stearns T., Lueders J. (2009). Plk1-dependent recruitment of gamma-tubulin complexes to mitotic centrosomes involves multiple PCM components. PLoS ONE. 4: E5976—E5976. PMID 19543530 DOI:10.1371/journal.pone.0005976

Примітки

[ред. | ред. код]

Див. також

[ред. | ред. код]