ATF1

ATF1
Ідентифікатори
Символи	ATF1, EWS-FUS/ATF-1, TREB36, activating transcription factor 1
Зовнішні ІД	OMIM: 123803 MGI: 3037720 HomoloGene: 3790 GeneCards: ATF1
Пов'язані генетичні захворювання
Angiomatoid fibrous histiocytoma
Онтологія гена Молекулярна функція • DNA binding • sequence-specific DNA binding • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • protein heterodimerization activity • transcription factor activity, RNA polymerase II distal enhancer sequence-specific binding • identical protein binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • GO:0032403 protein-containing complex binding Клітинна компонента • ATF1-ATF4 transcription factor complex • transcription regulator complex • нуклеоплазма • клітинне ядро Біологічний процес • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • GO:1904578 response to organic cyclic compound • transcription, DNA-templated • positive regulation of DNA replication • positive regulation of neuron projection development • response to cobalt ion • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription by RNA polymerase II • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	466	100040260
Ensembl	ENSG00000123268	ENSMUSG00000080968
UniProt	P18846	н/д
RefSeq (мРНК)	NM_005171	XM_036162179
RefSeq (білок)	NP_005162	н/д
Локус (UCSC)	Хр. 12: 50.76 – 50.82 Mb	Хр. X: 52.89 – 52.89 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

ATF1 (англ. Activating transcription factor 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 271 амінокислот, а молекулярна маса — 29 233.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MEDSHKSTTS		ETAPQPGSAV		QGAHISHIAQ		QVSSLSESEE		SQDSSDSIGS
SQKAHGILAR		RPSYRKILKD		LSSEDTRGRK		GDGENSGVSA		AVTSMSVPTP
IYQTSSGQYI		AIAPNGALQL		ASPGTDGVQG		LQTLTMTNSG		STQQGTTILQ
YAQTSDGQQI		LVPSNQVVVQ		TASGDMQTYQ		IRTTPSATSL		PQTVVMTSPV
TLTSQTTKTD		DPQLKREIRL		MKNREAAREC		RRKKKEYVKC		LENRVAVLEN
QNKTLIEELK		TLKDLYSNKS		V

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до активаторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Hai T., Liu F., Coukos W.J., Green M.R. (1989). Transcription factor ATF cDNA clones: an extensive family of leucine zipper proteins able to selectively form DNA-binding heterodimers. Genes Dev. 3: 2083—2090. PMID 2516827 DOI:10.1101/gad.3.12b.2083
• Waters B.L., Panagopoulos I., Allen E.F. (2000). Genetic characterization of angiomatoid fibrous histiocytoma identifies fusion of the FUS and ATF-1 genes induced by a chromosomal translocation involving bands 12q13 and 16p11. Cancer Genet. Cytogenet. 121: 109—116. PMID 11063792 DOI:10.1016/S0165-4608(00)00237-5
• Sun P., Lou L., Maurer R.A. (1996). Regulation of activating transcription factor-1 and the cAMP response element-binding protein by Ca2+/calmodulin-dependent protein kinases type I, II, and IV. J. Biol. Chem. 271: 3066—3073. PMID 8621702 DOI:10.1074/jbc.271.6.3066
• Hailemariam K., Iwasaki K., Huang B.W., Sakamoto K., Tsuji Y. (2010). Transcriptional regulation of ferritin and antioxidant genes by HIPK2 under genotoxic stress. J. Cell Sci. 123: 3863—3871. PMID 20980392 DOI:10.1242/jcs.073627
• Yoshimura T., Fujisawa J., Yoshida M. (1990). Multiple cDNA clones encoding nuclear proteins that bind to the tax-dependent enhancer of HTLV-1: all contain a leucine zipper structure and basic amino acid domain. EMBO J. 9: 2537—2542. PMID 2196176

Див. також

• Хромосома 12