Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.
ELK4
Ідентифікатори
Символи
ELK4 , SAP1, ETS transcription factor, ETS transcription factor ELK4
Зовнішні ІД
OMIM : 600246 MGI: 102853 HomoloGene: 1492 GeneCards: ELK4
Онтологія гена
Молекулярна функція
• GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • DNA binding • sequence-specific DNA binding • chromatin binding • GO:0001104 transcription coregulator activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
Клітинна компонента
• нуклеоплазма • клітинне ядро • гіалоплазма
Біологічний процес
• histone H3 deacetylation • диференціація клітин • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription, DNA-templated • transcription by RNA polymerase II • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II
Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види
Людина
Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
RefSeq (білок)
Локус (UCSC)
Хр. 1: 205.6 – 205.63 Mb
Хр. 1: 131.94 – 131.96 Mb
PubMed search
[1]
[2] Вікідані
ELK4 (англ. ELK4, ETS transcription factor ) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 431 амінокислот , а молекулярна маса — 46 900[4] .
Послідовність амінокислот
10 20 30 40 50
MDSAITLWQF LLQLLQKPQN KHMICWTSND GQFKLLQAEE VARLWGIRKN
KPNMNYDKLS RALRYYYVKN IIKKVNGQKF VYKFVSYPEI LNMDPMTVGR
IEGDCESLNF SEVSSSSKDV ENGGKDKPPQ PGAKTSSRND YIHSGLYSSF
TLNSLNSSNV KLFKLIKTEN PAEKLAEKKS PQEPTPSVIK FVTTPSKKPP
VEPVAATISI GPSISPSSEE TIQALETLVS PKLPSLEAPT SASNVMTAFA
TTPPISSIPP LQEPPRTPSP PLSSHPDIDT DIDSVASQPM ELPENLSLEP
KDQDSVLLEK DKVNNSSRSK KPKGLELAPT LVITSSDPSP LGILSPSLPT
ASLTPAFFSQ TPIILTPSPL LSSIHFWSTL SPVAPLSPAR LQGANTLFQF
PSVLNSHGPF TLSGLDGPST PGPFSPDLQK T
Кодований геном білок за функціями належить до репресорів , активаторів , фосфопротеїнів .
Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція , регуляція транскрипції .
Білок має сайт для зв'язування з ДНК .
Локалізований у ядрі .
Dalton S., Treisman R. (1992). Characterization of SAP-1, a protein recruited by serum response factor to the c-fos serum response element. Cell . 68 : 597—612. PMID 1339307 DOI :10.1016/0092-8674(92)90194-H
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res . 14 : 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI :10.1101/gr.2596504
Mo Y., Vaessen B., Johnston K., Marmorstein R. (1998). Structures of SAP-1 bound to DNA targets from the E74 and c-fos promoters: insights into DNA sequence discrimination by Ets proteins. Mol. Cell . 2 : 201—212. PMID 9734357 DOI :10.1016/S1097-2765(00)80130-6
Dalton S., Treisman R. (1994). Characterization of SAP-1, a protein recruited by serum response factor to the c-fos serum response element. Cell . 76 : 411—411. PMID 8293474
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)
(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)
(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP)
(1.4) NF-1
(1.5) RF-X
(1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1) Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4 )
підродина 1
підродина 2
підродина 3
підродина 4
підродина 5
підродина 6
підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4
(2.3) Cys2 His2 з доменом цинкових пальців
(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер
(2.5) Цинкові пальці іншого складу
(2.6) WRKY
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс
(3.2) Парний бокс
(3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль
(3.4) Фактори теплового шоку
(3.5) Триптофановий кластер
(3.6) Домен транскрипційний енхансер
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR
(4.2) STAT
(4.3) p53
(4.4) MADS
(4.6) TATA
(4.7) Високомобільна група
(4.9) Grainyhead
(4.10) Домен холодового шоку
(4.11) Runt
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y)
(0.3) Pocket домен
(0.5) AP2/EREBP-подібні
(0.6) Інші