Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.
ZNF649
Ідентифікатори
Символи
ZNF649 , zinc finger protein 649
Зовнішні ІД
OMIM : 611903 HomoloGene: 56964 GeneCards: ZNF649
Онтологія гена
Молекулярна функція
• GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • зв'язування з іоном металу • nucleic acid binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
Клітинна компонента
• внутрішньоклітинний • клітинне ядро • міжклітинний простір • нуклеоплазма
Біологічний процес
• GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription, DNA-templated • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II
Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види
Людина
Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
RefSeq (білок)
Локус (UCSC)
Хр. 19: 51.89 – 51.91 Mb
н/д
PubMed search
[1]
н/д Вікідані
ZNF649 (англ. Zinc finger protein 649 ) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми.[2] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 505 амінокислот , а молекулярна маса — 57 683[3] .
Послідовність амінокислот
10 20 30 40 50
MTKAQESLTL EDVAVDFTWE EWQFLSPAQK DLYRDVMLEN YSNLVSVGYQ
AGKPDALTKL EQGEPLWTLE DEIHSPAHPE IEKADDHLQQ PLQNQKILKR
TGQRYEHGRT LKSYLGLTNQ SRRYNRKEPA EFNGDGAFLH DNHEQMPTEI
EFPESRKPIS TKSQFLKHQQ THNIEKAHEC TDCGKAFLKK SQLTEHKRIH
TGKKPHVCSL CGKAFYKKYR LTEHERAHRG EKPHGCSLCG KAFYKRYRLT
EHERAHKGEK PYGCSECGKA FPRKSELTEH QRIHTGIKPH QCSECGRAFS
RKSLLVVHQR THTGEKPHTC SECGKGFIQK GNLNIHQRTH TGEKPYGCID
CGKAFSQKSC LVAHQRYHTG KTPFVCPECG QPCSQKSGLI RHQKIHSGEK
PYKCSDCGKA FLTKTMLIVH HRTHTGERPY GCDECEKAYF YMSCLVKHKR
IHSREKRGDS VKVENPSTAS HSLSPSEHVQ GKSPVNMVTV AMVAGQCEFA
HILHS
Кодований геном білок за функцією належить до репресорів .
Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція , регуляція транскрипції .
Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку , ДНК .
Локалізований у ядрі .
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res . 14 : 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI :10.1101/gr.2596504
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)
(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)
(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP)
(1.4) NF-1
(1.5) RF-X
(1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1) Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4 )
підродина 1
підродина 2
підродина 3
підродина 4
підродина 5
підродина 6
підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4
(2.3) Cys2 His2 з доменом цинкових пальців
(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер
(2.5) Цинкові пальці іншого складу
(2.6) WRKY
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс
(3.2) Парний бокс
(3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль
(3.4) Фактори теплового шоку
(3.5) Триптофановий кластер
(3.6) Домен транскрипційний енхансер
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR
(4.2) STAT
(4.3) p53
(4.4) MADS
(4.6) TATA
(4.7) Високомобільна група
(4.9) Grainyhead
(4.10) Домен холодового шоку
(4.11) Runt
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y)
(0.3) Pocket домен
(0.5) AP2/EREBP-подібні
(0.6) Інші