Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.
DBX2
Ідентифікатори
Символи
DBX2 , developing brain homeobox 2
Зовнішні ІД
MGI: 107445 HomoloGene: 54981 GeneCards: DBX2
Онтологія гена
Молекулярна функція
• sequence-specific DNA binding • DNA binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
Клітинна компонента
• клітинне ядро
Біологічний процес
• GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II
Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види
Людина
Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
RefSeq (білок)
Локус (UCSC)
Хр. 12: 45.01 – 45.05 Mb
Хр. 15: 95.52 – 95.55 Mb
PubMed search
[1]
[2] Вікідані
DBX2 (англ. Developing brain homeobox 2 ) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 339 амінокислот , а молекулярна маса — 36 555[4] .
Послідовність амінокислот
10 20 30 40 50
MLPSAVAAHA GAYWDVVASS ALLNLPAAPG FGNLGKSFLI ENLLRVGGAP
TPRLQPPAPH DPATALATAG AQLRPLPASP VPLKLCPAAE QVSPAGAPYG
TRWAFQVLSP SADSARLPGR APGDRDCTFQ PSAPAPSKPF LLSTPPFYSA
CCGGSCRRPA SSTAFPREES MLPLLTQDSN SKARRGILRR AVFSEDQRKA
LEKMFQKQKY ISKTDRKKLA INLGLKESQV KIWFQNRRMK WRNSKEKEVL
SNRCIQEVGL QEDPLSRSAL GFPSPCPSIW DVPQQHSSPR WRENSPEPSE
RLIQESSGAP PPEANSLQGA LYLCSEEEAG SKGVLTGAV
Білок має сайт для зв'язування з ДНК .
Локалізований у ядрі .
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)
(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)
(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP)
(1.4) NF-1
(1.5) RF-X
(1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1) Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4 )
підродина 1
підродина 2
підродина 3
підродина 4
підродина 5
підродина 6
підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4
(2.3) Cys2 His2 з доменом цинкових пальців
(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер
(2.5) Цинкові пальці іншого складу
(2.6) WRKY
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс
(3.2) Парний бокс
(3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль
(3.4) Фактори теплового шоку
(3.5) Триптофановий кластер
(3.6) Домен транскрипційний енхансер
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR
(4.2) STAT
(4.3) p53
(4.4) MADS
(4.6) TATA
(4.7) Високомобільна група
(4.9) Grainyhead
(4.10) Домен холодового шоку
(4.11) Runt
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y)
(0.3) Pocket домен
(0.5) AP2/EREBP-подібні
(0.6) Інші