Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.
HES6
Ідентифікатори
Символи
HES6 , C-HAIRY1, HES-6, bHLHb41, bHLHc23, hes family bHLH transcription factor 6
Зовнішні ІД
OMIM : 610331 MGI: 1859852 HomoloGene: 23111 GeneCards: HES6
Онтологія гена
Молекулярна функція
• DNA binding • transcription factor binding • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding • protein dimerization activity • GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0001104 transcription coregulator activity • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001106 transcription corepressor activity • sequence-specific DNA binding • sequence-specific double-stranded DNA binding
Клітинна компонента
• клітинне ядро • transcription regulator complex
Біологічний процес
• GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • multicellular organism development • диференціація клітин • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription, DNA-templated • нейробіологія розвитку • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • somitogenesis • Сигнальний шлях Notch • regulation of neurogenesis • anterior/posterior pattern specification
Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види
Людина
Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
RefSeq (білок)
Локус (UCSC)
Хр. 2: 238.24 – 238.24 Mb
Хр. 1: 91.34 – 91.34 Mb
PubMed search
[1]
[2] Вікідані
HES6 (англ. Hes family bHLH transcription factor 6 ) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 224 амінокислот , а молекулярна маса — 24 129[4] .
Послідовність амінокислот
10 20 30 40 50
MAPPAAPGRD RVGREDEDGW ETRGDRKARK PLVEKKRRAR INESLQELRL
LLAGAEVQAK LENAEVLELT VRRVQGVLRG RAREREQLQA EASERFAAGY
IQCMHEVHTF VSTCQAIDAT VAAELLNHLL ESMPLREGSS FQDLLGDALA
GPPRAPGRSG WPAGGAPGSP IPSPPGPGDD LCSDLEEAPE AELSQAPAEG
PDLVPAALGS LTTAQIARSV WRPW
Кодований геном білок за функціями належить до репресорів , білків розвитку .
Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція , регуляція транскрипції , диференціація, поліморфізм, альтернативний сплайсинг .
Локалізований у ядрі .
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)
(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)
(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP)
(1.4) NF-1
(1.5) RF-X
(1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1) Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4 )
підродина 1
підродина 2
підродина 3
підродина 4
підродина 5
підродина 6
підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4
(2.3) Cys2 His2 з доменом цинкових пальців
(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер
(2.5) Цинкові пальці іншого складу
(2.6) WRKY
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс
(3.2) Парний бокс
(3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль
(3.4) Фактори теплового шоку
(3.5) Триптофановий кластер
(3.6) Домен транскрипційний енхансер
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR
(4.2) STAT
(4.3) p53
(4.4) MADS
(4.6) TATA
(4.7) Високомобільна група
(4.9) Grainyhead
(4.10) Домен холодового шоку
(4.11) Runt
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y)
(0.3) Pocket домен
(0.5) AP2/EREBP-подібні
(0.6) Інші