ITGAV

Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.
Перейти до навігації Перейти до пошуку
ITGAV
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Ідентифікатори
Символи ITGAV, CD51, MSK8, VNRA, VTNR, integrin subunit alpha V
Зовнішні ІД OMIM: 193210 MGI: 96608 HomoloGene: 20510 GeneCards: ITGAV
Реагує на сполуку
cilengitide[1]
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
NM_001144999
NM_001145000
NM_002210
NM_008402
NM_001398691
RefSeq (білок)
NP_001138471
NP_001138472
NP_002201
NP_032428
NP_001385620
Локус (UCSC) Хр. 2: 186.59 – 186.68 Mb Хр. 2: 83.55 – 83.64 Mb
PubMed search [2] [3]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

ITGAV (англ. Integrin subunit alpha V) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 048 амінокислот, а молекулярна маса — 116 038[5].

Послідовність амінокислот
1020304050
MAFPPRRRLRLGPRGLPLLLSGLLLPLCRAFNLDVDSPAEYSGPEGSYFG
FAVDFFVPSASSRMFLLVGAPKANTTQPGIVEGGQVLKCDWSSTRRCQPI
EFDATGNRDYAKDDPLEFKSHQWFGASVRSKQDKILACAPLYHWRTEMKQ
EREPVGTCFLQDGTKTVEYAPCRSQDIDADGQGFCQGGFSIDFTKADRVL
LGGPGSFYWQGQLISDQVAEIVSKYDPNVYSIKYNNQLATRTAQAIFDDS
YLGYSVAVGDFNGDGIDDFVSGVPRAARTLGMVYIYDGKNMSSLYNFTGE
QMAAYFGFSVAATDINGDDYADVFIGAPLFMDRGSDGKLQEVGQVSVSLQ
RASGDFQTTKLNGFEVFARFGSAIAPLGDLDQDGFNDIAIAAPYGGEDKK
GIVYIFNGRSTGLNAVPSQILEGQWAARSMPPSFGYSMKGATDIDKNGYP
DLIVGAFGVDRAILYRARPVITVNAGLEVYPSILNQDNKTCSLPGTALKV
SCFNVRFCLKADGKGVLPRKLNFQVELLLDKLKQKGAIRRALFLYSRSPS
HSKNMTISRGGLMQCEELIAYLRDESEFRDKLTPITIFMEYRLDYRTAAD
TTGLQPILNQFTPANISRQAHILLDCGEDNVCKPKLEVSVDSDQKKIYIG
DDNPLTLIVKAQNQGEGAYEAELIVSIPLQADFIGVVRNNEALARLSCAF
KTENQTRQVVCDLGNPMKAGTQLLAGLRFSVHQQSEMDTSVKFDLQIQSS
NLFDKVSPVVSHKVDLAVLAAVEIRGVSSPDHVFLPIPNWEHKENPETEE
DVGPVVQHIYELRNNGPSSFSKAMLHLQWPYKYNNNTLLYILHYDIDGPM
NCTSDMEINPLRIKISSLQTTEKNDTVAGQGERDHLITKRDLALSEGDIH
TLGCGVAQCLKIVCQVGRLDRGKSAILYVKSLLWTETFMNKENQNHSYSL
KSSASFNVIEFPYKNLPIEDITNSTLVTTNVTWGIQPAPMPVPVWVIILA
VLAGLLLLAVLVFVMYRMGFFKRVRPPQEEQEREQLQPHENGEGNSET

Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів клітини-хазяїна для входу вірусу, рецепторів, інтегринів. Задіяний у таких біологічних процесах як клітинна адгезія, взаємодія хазяїн-вірус, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном кальцію. Локалізований у мембрані, клітинних контактах.

Література

[ред. | ред. код]
  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Donahue J.P., Sugg N., Hawiger J. (1994). The integrin alpha v gene: identification and characterization of the promoter region. Biochim. Biophys. Acta. 1219: 228—232. PMID 7522056 DOI:10.1016/0167-4781(94)90278-X
  • Cheresh D.A., Smith J.W., Cooper H.M., Quaranta V. (1989). A novel vitronectin receptor integrin (alpha v beta x) is responsible for distinct adhesive properties of carcinoma cells. Cell. 57: 59—69. PMID 2467745 DOI:10.1016/0092-8674(89)90172-4
  • Joki-Korpela P., Marjomaki V., Krogerus C., Heino J., Hyypia T. (2001). Entry of human parechovirus 1. J. Virol. 75: 1958—1967. PMID 11160695 DOI:10.1128/JVI.75.4.1958-1967.2001
  • Zhang H., Li X.-J., Martin D.B., Aebersold R. (2003). Identification and quantification of N-linked glycoproteins using hydrazide chemistry, stable isotope labeling and mass spectrometry. Nat. Biotechnol. 21: 660—666. PMID 12754519 DOI:10.1038/nbt827
  • Vallon M., Essler M. (2006). Proteolytically processed soluble tumor endothelial marker (TEM) 5 mediates endothelial cell survival during angiogenesis by linking integrin alpha(v)beta3 to glycosaminoglycans. J. Biol. Chem. 281: 34179—34188. PMID 16982628 DOI:10.1074/jbc.M605291200

Примітки

[ред. | ред. код]
  1. Сполуки, які фізично взаємодіють з Integrin alpha-V переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
  2. Human PubMed Reference:.
  3. Mouse PubMed Reference:.
  4. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:6150 (англ.) . Архів оригіналу за 15 вересня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.
  5. UniProt, P06756 (англ.) . Архів оригіналу за 10 вересня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.

Див. також

[ред. | ред. код]