SDC1

Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.
Перейти до навігації Перейти до пошуку
SDC1
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Ідентифікатори
Символи SDC1, CD138, SDC, SYND1, syndecan, syndecan 1
Зовнішні ІД OMIM: 186355 MGI: 1349162 HomoloGene: 2252 GeneCards: SDC1
Шаблон експресії


Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
NM_001006946
NM_002997
NM_011519
RefSeq (білок)
NP_001006947
NP_002988
NP_035649
Локус (UCSC) Хр. 2: 20.2 – 20.23 Mb Хр. 12: 8.82 – 8.84 Mb
PubMed search [1] [2]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

SDC1 (англ. Syndecan 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 310 амінокислот, а молекулярна маса — 32 462[4].

Послідовність амінокислот
1020304050
MRRAALWLWLCALALSLQPALPQIVATNLPPEDQDGSGDDSDNFSGSGAG
ALQDITLSQQTPSTWKDTQLLTAIPTSPEPTGLEATAASTSTLPAGEGPK
EGEAVVLPEVEPGLTAREQEATPRPRETTQLPTTHLASTTTATTAQEPAT
SHPHRDMQPGHHETSTPAGPSQADLHTPHTEDGGPSATERAAEDGASSQL
PAAEGSGEQDFTFETSGENTAVVAVEPDRRNQSPVDQGATGASQGLLDRK
EVLGGVIAGGLVGLIFAVCLVGFMLYRMKKKDEGSYSLEEPKQANGGAYQ
KPTKQEEFYA

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі як поліморфізм. Локалізований у мембрані. Також секретований назовні.

Література

[ред. | ред. код]
  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Kaukonen J., Alanen-Kurki L., Jalkanen M., Palotie A. (1997). The mapping and visual ordering of the human syndecan-1 and N-myc genes near the telomeric region of chromosome 2p. Hum. Genet. 99: 295—297. PMID 9050911 DOI:10.1007/s004390050360
  • Subramanian S.V., Fitzgerald M.L., Bernfield M. (1997). Regulated shedding of syndecan-1 and -4 ectodomains by thrombin and growth factor receptor activation. J. Biol. Chem. 272: 14713—14720. PMID 9169435 DOI:10.1074/jbc.272.23.14713
  • Bhatt A.S., Erdjument-Bromage H., Tempst P., Craik C.S., Moasser M.M. (2005). Adhesion signaling by a novel mitotic substrate of src kinases. Oncogene. 24: 5333—5343. PMID 16007225 DOI:10.1038/sj.onc.1208582
  • Liu X., Shepherd T.R., Murray A.M., Xu Z., Fuentes E.J. (2013). The structure of the Tiam1 PDZ domain/ phospho-syndecan1 complex reveals a ligand conformation that modulates protein dynamics. Structure. 21: 342—354. PMID 23395182 DOI:10.1016/j.str.2013.01.004
  • Lories V., Cassiman J.-J., van de Berghe H., David G. (1992). Differential expression of cell surface heparan sulfate proteoglycans in human mammary epithelial cells and lung fibroblasts. J. Biol. Chem. 267: 1116—1122. PMID 1339431

Примітки

[ред. | ред. код]
  1. Human PubMed Reference:.
  2. Mouse PubMed Reference:.
  3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:10658 (англ.) . Архів оригіналу за 20 травня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.
  4. UniProt, P18827 (англ.) . Архів оригіналу за 10 серпня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.

Див. також

[ред. | ред. код]